Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SR96

Protein Details
Accession C9SR96    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
535-571AYERRQRGRRAGARDGRHCRAHRTCRGRARQEDYEGFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
540-547QRGRRAGA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG val:VDBG_07008  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MEPDGSSLPFVEPWARRQAHLCPTDLAILSIAASSQHTRSFATSSIEDAIRAPVASTTSRQTRPSTRSDLKDRQKLEWAVKKHLERMDDPFIIAQHVSRTLAKDRYDEALLLVQQASKTAQCVVSWNHLIDFQMKNQKLNAAVRLLNDMKKRGQHPDELTYTIIFRGCARSTYPKLAVAESVRLYKSMTKDARLKPNIIHLNAVLQACGRAGDLDAMFSLLDSLDDSKLKPDTHTYTAILQSLRASAEDPASTKTASQQLRKEHVAQTIERCKSLWEEVMRNWRKGDLVIDEHLVCAMGRVLLLDKSTRSQDILVLAAETMNLPRLDKDSNAKPHDAVDPAPPSLMSSSKRTAPYAVPGKNTLSLLITILTDARLTRAGIRYWHHILDTYAVKPDAKLWEQMLRLLHLGRASADAASLAAAIPPPLATPYFFRLALATCLRDKNSPRMPANAAAIVDSMSAAGRTDPKSLALYLQLVQGRGEDFSPANMDERKPYCKRLADALDKVWEPYRLASESVGLPRMVESRKPWIRDTSAYERRQRGRRAGARDGRHCRAHRTCRGRARQEDYEGFADEARQPQQASSRLYRTPTAAAGQHHRRGEGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.36
4 0.4
5 0.47
6 0.48
7 0.5
8 0.48
9 0.39
10 0.4
11 0.42
12 0.38
13 0.3
14 0.21
15 0.17
16 0.15
17 0.12
18 0.1
19 0.07
20 0.09
21 0.11
22 0.12
23 0.15
24 0.16
25 0.18
26 0.2
27 0.22
28 0.22
29 0.25
30 0.24
31 0.23
32 0.26
33 0.25
34 0.23
35 0.21
36 0.21
37 0.16
38 0.15
39 0.13
40 0.11
41 0.13
42 0.15
43 0.16
44 0.21
45 0.28
46 0.32
47 0.36
48 0.41
49 0.47
50 0.51
51 0.56
52 0.59
53 0.59
54 0.64
55 0.7
56 0.74
57 0.75
58 0.78
59 0.74
60 0.68
61 0.69
62 0.66
63 0.66
64 0.64
65 0.59
66 0.6
67 0.64
68 0.63
69 0.62
70 0.6
71 0.55
72 0.49
73 0.51
74 0.5
75 0.43
76 0.4
77 0.34
78 0.3
79 0.27
80 0.24
81 0.18
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.19
87 0.24
88 0.3
89 0.31
90 0.31
91 0.32
92 0.33
93 0.33
94 0.29
95 0.25
96 0.22
97 0.2
98 0.19
99 0.17
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.17
110 0.19
111 0.24
112 0.26
113 0.26
114 0.24
115 0.23
116 0.24
117 0.25
118 0.24
119 0.23
120 0.31
121 0.31
122 0.32
123 0.32
124 0.34
125 0.34
126 0.36
127 0.33
128 0.27
129 0.28
130 0.27
131 0.33
132 0.33
133 0.33
134 0.33
135 0.33
136 0.32
137 0.36
138 0.39
139 0.42
140 0.43
141 0.45
142 0.47
143 0.5
144 0.5
145 0.45
146 0.43
147 0.34
148 0.31
149 0.24
150 0.2
151 0.13
152 0.11
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.18
157 0.25
158 0.29
159 0.35
160 0.36
161 0.35
162 0.36
163 0.35
164 0.34
165 0.28
166 0.27
167 0.23
168 0.24
169 0.2
170 0.19
171 0.19
172 0.2
173 0.21
174 0.26
175 0.27
176 0.3
177 0.39
178 0.45
179 0.55
180 0.54
181 0.53
182 0.45
183 0.52
184 0.53
185 0.45
186 0.39
187 0.29
188 0.28
189 0.29
190 0.28
191 0.18
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.08
197 0.04
198 0.05
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.09
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.17
219 0.21
220 0.24
221 0.26
222 0.26
223 0.25
224 0.26
225 0.28
226 0.22
227 0.18
228 0.15
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.09
233 0.07
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.12
242 0.19
243 0.22
244 0.27
245 0.3
246 0.35
247 0.4
248 0.42
249 0.43
250 0.39
251 0.4
252 0.37
253 0.33
254 0.35
255 0.38
256 0.37
257 0.33
258 0.3
259 0.26
260 0.25
261 0.25
262 0.22
263 0.17
264 0.19
265 0.22
266 0.33
267 0.35
268 0.34
269 0.33
270 0.29
271 0.26
272 0.24
273 0.23
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.16
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.12
282 0.08
283 0.05
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.08
313 0.09
314 0.11
315 0.16
316 0.21
317 0.3
318 0.32
319 0.32
320 0.31
321 0.32
322 0.32
323 0.28
324 0.22
325 0.18
326 0.18
327 0.17
328 0.17
329 0.15
330 0.13
331 0.13
332 0.15
333 0.12
334 0.15
335 0.17
336 0.22
337 0.23
338 0.24
339 0.25
340 0.23
341 0.29
342 0.33
343 0.34
344 0.31
345 0.31
346 0.31
347 0.31
348 0.3
349 0.22
350 0.15
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.08
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.1
364 0.13
365 0.14
366 0.18
367 0.2
368 0.25
369 0.27
370 0.27
371 0.24
372 0.22
373 0.21
374 0.21
375 0.21
376 0.17
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.19
385 0.19
386 0.24
387 0.24
388 0.27
389 0.25
390 0.21
391 0.2
392 0.18
393 0.18
394 0.13
395 0.13
396 0.1
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.07
415 0.1
416 0.13
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.17
422 0.21
423 0.2
424 0.19
425 0.19
426 0.22
427 0.23
428 0.28
429 0.3
430 0.35
431 0.41
432 0.47
433 0.46
434 0.48
435 0.5
436 0.48
437 0.47
438 0.4
439 0.32
440 0.24
441 0.22
442 0.17
443 0.13
444 0.1
445 0.07
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.06
450 0.1
451 0.12
452 0.14
453 0.15
454 0.17
455 0.18
456 0.19
457 0.19
458 0.16
459 0.17
460 0.15
461 0.19
462 0.19
463 0.18
464 0.17
465 0.17
466 0.16
467 0.14
468 0.14
469 0.11
470 0.1
471 0.1
472 0.12
473 0.12
474 0.15
475 0.17
476 0.18
477 0.23
478 0.27
479 0.35
480 0.37
481 0.42
482 0.46
483 0.49
484 0.5
485 0.52
486 0.57
487 0.57
488 0.57
489 0.55
490 0.52
491 0.47
492 0.46
493 0.39
494 0.32
495 0.25
496 0.22
497 0.23
498 0.2
499 0.21
500 0.2
501 0.2
502 0.22
503 0.23
504 0.23
505 0.19
506 0.17
507 0.18
508 0.22
509 0.22
510 0.23
511 0.24
512 0.33
513 0.39
514 0.43
515 0.45
516 0.47
517 0.5
518 0.51
519 0.56
520 0.56
521 0.59
522 0.63
523 0.68
524 0.69
525 0.73
526 0.76
527 0.76
528 0.74
529 0.75
530 0.76
531 0.76
532 0.78
533 0.79
534 0.79
535 0.81
536 0.81
537 0.76
538 0.77
539 0.72
540 0.71
541 0.72
542 0.74
543 0.74
544 0.74
545 0.77
546 0.79
547 0.87
548 0.87
549 0.86
550 0.84
551 0.81
552 0.8
553 0.74
554 0.68
555 0.6
556 0.52
557 0.43
558 0.35
559 0.29
560 0.24
561 0.25
562 0.22
563 0.22
564 0.21
565 0.23
566 0.3
567 0.34
568 0.38
569 0.41
570 0.45
571 0.46
572 0.5
573 0.5
574 0.46
575 0.43
576 0.39
577 0.36
578 0.34
579 0.36
580 0.42
581 0.48
582 0.52
583 0.51