Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SKP6

Protein Details
Accession C9SKP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-456SSKLCSTRRPMTPQTRRSRRRGASTRASNTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG val:VDBG_05373  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MPLDDDDNPFLTPSPAPVPLAGKGIANANNGDPDGHDNEDDPADAPFDMALFASMFSKKGVSSQTIRKGQKDFEAHGTRAQDAALETSRRVIEDVLAYTRLHTGDWNRGWLFADYWPDALAELATARPEFVAALDPALHAADRVVVLEELKGPQNRSVGRTVRGMKPPSPAVGKVWLLPEEALFMLERGSLDLWWPDRTLEDLMPGLAIKRSRGAMTGSKTTAQRGDDNHSGRPADGEPERIEKKRRRTTTTTSSPMAFPSACKQPMRFSSASRASAERSRCRNTRSTHTSREAVTTSSGRPRAETATQAAPSPASTQPKSVWQWLFSLFEPTGSGAARGLPFGPPRPARASTENTPPKYKKARIHPFASTPARRRLIQRAEDPFKVFFHVWRRPSTQSSPKAIRHRPTCASPSSTPGTRSFRSWSSSKLCSTRRPMTPQTRRSRRRGASTRASNTAIATCSSPSSTAASSILCDSARPPSPTRSCTSASTCRTAAEVGRGAEAAAEEEVGAVVDVVGDEAREHPHELRLQPGRAAAVCRCSWRHAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.2
4 0.22
5 0.24
6 0.24
7 0.27
8 0.24
9 0.2
10 0.19
11 0.24
12 0.25
13 0.24
14 0.23
15 0.21
16 0.23
17 0.22
18 0.22
19 0.17
20 0.18
21 0.2
22 0.2
23 0.2
24 0.18
25 0.2
26 0.21
27 0.2
28 0.15
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.06
37 0.06
38 0.05
39 0.06
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.15
47 0.18
48 0.22
49 0.28
50 0.37
51 0.46
52 0.55
53 0.59
54 0.6
55 0.6
56 0.58
57 0.6
58 0.56
59 0.5
60 0.51
61 0.53
62 0.49
63 0.49
64 0.48
65 0.4
66 0.34
67 0.3
68 0.21
69 0.15
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.2
75 0.2
76 0.19
77 0.19
78 0.16
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.17
83 0.18
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.17
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.25
92 0.27
93 0.32
94 0.3
95 0.31
96 0.33
97 0.3
98 0.27
99 0.21
100 0.24
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.11
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.14
138 0.16
139 0.16
140 0.19
141 0.24
142 0.26
143 0.28
144 0.34
145 0.33
146 0.34
147 0.39
148 0.41
149 0.43
150 0.48
151 0.49
152 0.44
153 0.45
154 0.44
155 0.41
156 0.39
157 0.33
158 0.28
159 0.3
160 0.28
161 0.25
162 0.25
163 0.22
164 0.19
165 0.18
166 0.16
167 0.12
168 0.11
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.13
186 0.14
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.15
202 0.18
203 0.22
204 0.25
205 0.25
206 0.27
207 0.27
208 0.27
209 0.27
210 0.23
211 0.22
212 0.21
213 0.26
214 0.3
215 0.31
216 0.31
217 0.3
218 0.28
219 0.25
220 0.24
221 0.18
222 0.15
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.2
227 0.24
228 0.25
229 0.33
230 0.36
231 0.46
232 0.53
233 0.57
234 0.59
235 0.63
236 0.68
237 0.7
238 0.72
239 0.66
240 0.58
241 0.53
242 0.46
243 0.39
244 0.32
245 0.22
246 0.14
247 0.13
248 0.18
249 0.19
250 0.2
251 0.2
252 0.24
253 0.27
254 0.33
255 0.3
256 0.26
257 0.31
258 0.36
259 0.37
260 0.33
261 0.31
262 0.26
263 0.3
264 0.34
265 0.32
266 0.33
267 0.37
268 0.39
269 0.42
270 0.47
271 0.46
272 0.5
273 0.53
274 0.54
275 0.55
276 0.56
277 0.55
278 0.48
279 0.47
280 0.38
281 0.29
282 0.24
283 0.19
284 0.17
285 0.2
286 0.22
287 0.19
288 0.19
289 0.2
290 0.22
291 0.21
292 0.21
293 0.19
294 0.2
295 0.2
296 0.2
297 0.18
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.19
306 0.26
307 0.28
308 0.32
309 0.3
310 0.26
311 0.27
312 0.27
313 0.29
314 0.22
315 0.23
316 0.17
317 0.15
318 0.15
319 0.13
320 0.12
321 0.1
322 0.1
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.11
330 0.13
331 0.2
332 0.19
333 0.23
334 0.27
335 0.3
336 0.32
337 0.36
338 0.4
339 0.37
340 0.46
341 0.51
342 0.48
343 0.53
344 0.51
345 0.53
346 0.56
347 0.59
348 0.56
349 0.59
350 0.67
351 0.67
352 0.7
353 0.67
354 0.62
355 0.63
356 0.64
357 0.59
358 0.54
359 0.56
360 0.54
361 0.52
362 0.52
363 0.53
364 0.54
365 0.54
366 0.56
367 0.57
368 0.59
369 0.6
370 0.58
371 0.49
372 0.41
373 0.38
374 0.3
375 0.25
376 0.29
377 0.34
378 0.36
379 0.4
380 0.44
381 0.45
382 0.51
383 0.54
384 0.55
385 0.55
386 0.59
387 0.61
388 0.64
389 0.7
390 0.71
391 0.71
392 0.67
393 0.67
394 0.64
395 0.62
396 0.59
397 0.54
398 0.53
399 0.45
400 0.45
401 0.42
402 0.4
403 0.37
404 0.39
405 0.41
406 0.36
407 0.38
408 0.37
409 0.35
410 0.38
411 0.36
412 0.37
413 0.36
414 0.4
415 0.42
416 0.46
417 0.47
418 0.51
419 0.58
420 0.59
421 0.6
422 0.64
423 0.69
424 0.72
425 0.77
426 0.79
427 0.82
428 0.84
429 0.85
430 0.86
431 0.87
432 0.83
433 0.83
434 0.82
435 0.8
436 0.8
437 0.82
438 0.79
439 0.73
440 0.68
441 0.58
442 0.5
443 0.43
444 0.33
445 0.24
446 0.2
447 0.15
448 0.14
449 0.14
450 0.14
451 0.13
452 0.15
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.14
457 0.14
458 0.14
459 0.15
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.18
464 0.24
465 0.27
466 0.29
467 0.37
468 0.44
469 0.48
470 0.52
471 0.5
472 0.47
473 0.49
474 0.53
475 0.53
476 0.5
477 0.51
478 0.47
479 0.42
480 0.4
481 0.37
482 0.31
483 0.28
484 0.28
485 0.23
486 0.24
487 0.23
488 0.21
489 0.2
490 0.18
491 0.12
492 0.08
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.06
508 0.1
509 0.12
510 0.16
511 0.17
512 0.23
513 0.3
514 0.3
515 0.38
516 0.43
517 0.43
518 0.42
519 0.42
520 0.4
521 0.36
522 0.39
523 0.33
524 0.32
525 0.32
526 0.36
527 0.37