FuNGI

C9SK05

Protein Details

Accession

C9SK05

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-49	TSDKSAKKVKTDAPKKKKKAAPVESPADS	Hydrophilic
68-87	EQSPPQKKKYDGKAKADNIT	Hydrophilic
120-143	DEVQRTKKIWERLRRKSHVPSEER	Basic
636-655	GKELKATLKKSKKQLQAAAT	Hydrophilic
674-700	EDSDKGDKKAKKAKKGGAKPERPVGNS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-40	SKRKAAPMGKATSDKSAKKVKTDAPKKKKKA
106-136	KKLARERKAAKPLGDEVQRTKKIWERLRRKS
678-695	KGDKKAKKAKKGGAKPER

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR012959 CPL_dom IPR033133 PUM-HD IPR040059 PUM3 IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	val:VDBG_05132 -
Pfam	View protein in Pfam PF08144 CPL
PROSITE	View protein in PROSITE PS50303 PUM_HD

Amino Acid Sequences

MATKAAATGSKRKAAPMGKATSDKSAKKVKTDAPKKKKKAAPVESPADSSDDFDGIDDDESDGGAKLEQSPPQKKKYDGKAKADNITGVGKPVITESSKEAHALQKKLARERKAAKPLGDEVQRTKKIWERLRRKSHVPSEERKQLLEELFTIITGRVKDFVLKHDAVRAVQTAIKYSNAAQRKQICTELQGTFSQLAESRYAKFLIAKLVVQKEPEIRDMIIPEFYGRVRRLINHPEASWILDDIYRQVASKEQKAILLREWYGPEFALLERNKNEKPTSDLAAILEESPSKRGPIMKTLCNMINSLVQKKMTGFTMLHDAMLQYFLNIKPGSDEHTAFLDLLRDDESGDLFKNMAFTRSGSRLACLLLAHGSSKDRRNILKVYKDNFVLMSGDANAHMVILTAFDVIDDTKMTSKVIFSELIGDDEEKVAENIIASMNNQYARATLMYPIEGQSKALFLSNMSDDKAILQEVHEIRKTTSKKDDHIRRAELAAVLAPSLLSTIAAAAPTLLADSFGCHIVTEVLLSVEGDKTKALEAVAAVAEGDPTAEPMELDNHVAQQAHVSQTAWGGRALKTLIAGGKYNKQTGKVEQVEPPLKFADALYPVIEDHVVQWATGPSSLVVLALLESPDFSHGKELKATLKKSKKQLQAAATEETAEQKARREAEAEAAGEDSDKGDKKAKKAKKGGAKPERPVGNSGTRLLLENL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.55
3	0.54
4	0.54
5	0.53
6	0.58
7	0.58
8	0.59
9	0.61
10	0.55
11	0.53
12	0.57
13	0.54
14	0.55
15	0.61
16	0.6
17	0.63
18	0.71
19	0.75
20	0.76
21	0.84
22	0.86
23	0.89
24	0.86
25	0.85
26	0.85
27	0.84
28	0.83
29	0.81
30	0.81
31	0.73
32	0.68
33	0.59
34	0.51
35	0.41
36	0.32
37	0.24
38	0.17
39	0.15
40	0.13
41	0.13
42	0.1
43	0.11
44	0.09
45	0.08
46	0.08
47	0.08
48	0.08
49	0.08
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.1
54	0.14
55	0.19
56	0.28
57	0.38
58	0.45
59	0.53
60	0.58
61	0.62
62	0.68
63	0.74
64	0.76
65	0.75
66	0.78
67	0.8
68	0.8
69	0.78
70	0.71
71	0.61
72	0.52
73	0.46
74	0.37
75	0.28
76	0.22
77	0.17
78	0.15
79	0.15
80	0.16
81	0.13
82	0.15
83	0.16
84	0.19
85	0.2
86	0.21
87	0.22
88	0.26
89	0.32
90	0.33
91	0.36
92	0.38
93	0.43
94	0.52
95	0.58
96	0.55
97	0.58
98	0.63
99	0.67
100	0.72
101	0.72
102	0.65
103	0.62
104	0.6
105	0.59
106	0.56
107	0.49
108	0.46
109	0.51
110	0.52
111	0.48
112	0.48
113	0.47
114	0.51
115	0.58
116	0.61
117	0.62
118	0.69
119	0.79
120	0.81
121	0.81
122	0.82
123	0.82
124	0.81
125	0.79
126	0.76
127	0.75
128	0.77
129	0.71
130	0.61
131	0.54
132	0.48
133	0.41
134	0.34
135	0.26
136	0.2
137	0.18
138	0.18
139	0.16
140	0.12
141	0.13
142	0.12
143	0.12
144	0.11
145	0.11
146	0.16
147	0.16
148	0.2
149	0.25
150	0.26
151	0.25
152	0.29
153	0.31
154	0.27
155	0.27
156	0.24
157	0.18
158	0.19
159	0.19
160	0.16
161	0.15
162	0.16
163	0.15
164	0.16
165	0.22
166	0.26
167	0.28
168	0.32
169	0.39
170	0.42
171	0.44
172	0.46
173	0.39
174	0.37
175	0.41
176	0.35
177	0.3
178	0.27
179	0.25
180	0.22
181	0.2
182	0.18
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.16
187	0.16
188	0.16
189	0.17
190	0.16
191	0.16
192	0.16
193	0.18
194	0.18
195	0.18
196	0.22
197	0.26
198	0.26
199	0.25
200	0.26
201	0.25
202	0.26
203	0.27
204	0.23
205	0.19
206	0.19
207	0.2
208	0.19
209	0.15
210	0.13
211	0.12
212	0.11
213	0.11
214	0.15
215	0.14
216	0.16
217	0.17
218	0.2
219	0.26
220	0.33
221	0.4
222	0.37
223	0.37
224	0.37
225	0.36
226	0.34
227	0.28
228	0.2
229	0.14
230	0.11
231	0.11
232	0.09
233	0.1
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.14
238	0.17
239	0.21
240	0.23
241	0.22
242	0.26
243	0.28
244	0.29
245	0.27
246	0.27
247	0.24
248	0.23
249	0.24
250	0.21
251	0.19
252	0.17
253	0.14
254	0.11
255	0.1
256	0.15
257	0.14
258	0.17
259	0.2
260	0.24
261	0.25
262	0.28
263	0.29
264	0.23
265	0.28
266	0.28
267	0.28
268	0.24
269	0.24
270	0.2
271	0.2
272	0.19
273	0.13
274	0.1
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.09
279	0.08
280	0.09
281	0.14
282	0.15
283	0.24
284	0.28
285	0.29
286	0.3
287	0.33
288	0.34
289	0.3
290	0.29
291	0.21
292	0.21
293	0.19
294	0.2
295	0.19
296	0.18
297	0.17
298	0.17
299	0.17
300	0.13
301	0.13
302	0.11
303	0.1
304	0.16
305	0.16
306	0.15
307	0.14
308	0.13
309	0.11
310	0.12
311	0.11
312	0.05
313	0.07
314	0.07
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.11
320	0.16
321	0.16
322	0.17
323	0.14
324	0.15
325	0.15
326	0.14
327	0.14
328	0.1
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.12
347	0.14
348	0.17
349	0.14
350	0.15
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.11
355	0.09
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.09
361	0.11
362	0.15
363	0.18
364	0.21
365	0.22
366	0.26
367	0.31
368	0.36
369	0.42
370	0.44
371	0.44
372	0.43
373	0.42
374	0.39
375	0.33
376	0.27
377	0.18
378	0.12
379	0.1
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.1
406	0.09
407	0.08
408	0.12
409	0.12
410	0.13
411	0.13
412	0.12
413	0.1
414	0.1
415	0.1
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.09
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.1
437	0.11
438	0.12
439	0.13
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.06
448	0.09
449	0.11
450	0.11
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.12
456	0.09
457	0.07
458	0.07
459	0.13
460	0.14
461	0.18
462	0.2
463	0.2
464	0.21
465	0.29
466	0.31
467	0.3
468	0.38
469	0.38
470	0.43
471	0.52
472	0.61
473	0.63
474	0.68
475	0.66
476	0.58
477	0.55
478	0.5
479	0.4
480	0.3
481	0.22
482	0.14
483	0.1
484	0.08
485	0.07
486	0.05
487	0.05
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.03
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.06
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.08
522	0.09
523	0.08
524	0.08
525	0.07
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.06
532	0.05
533	0.06
534	0.04
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.06
540	0.09
541	0.09
542	0.11
543	0.11
544	0.11
545	0.12
546	0.13
547	0.12
548	0.12
549	0.14
550	0.14
551	0.14
552	0.13
553	0.13
554	0.16
555	0.18
556	0.16
557	0.15
558	0.16
559	0.15
560	0.18
561	0.18
562	0.15
563	0.14
564	0.15
565	0.16
566	0.16
567	0.18
568	0.19
569	0.26
570	0.29
571	0.34
572	0.34
573	0.36
574	0.37
575	0.4
576	0.47
577	0.44
578	0.44
579	0.44
580	0.51
581	0.53
582	0.5
583	0.47
584	0.38
585	0.32
586	0.29
587	0.24
588	0.21
589	0.18
590	0.19
591	0.17
592	0.16
593	0.16
594	0.17
595	0.16
596	0.1
597	0.08
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.13
602	0.14
603	0.15
604	0.15
605	0.15
606	0.09
607	0.1
608	0.1
609	0.08
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.1
619	0.1
620	0.1
621	0.18
622	0.2
623	0.22
624	0.25
625	0.28
626	0.34
627	0.42
628	0.47
629	0.49
630	0.57
631	0.63
632	0.7
633	0.77
634	0.77
635	0.78
636	0.81
637	0.77
638	0.75
639	0.71
640	0.65
641	0.56
642	0.47
643	0.38
644	0.33
645	0.27
646	0.22
647	0.19
648	0.21
649	0.26
650	0.28
651	0.29
652	0.28
653	0.27
654	0.32
655	0.35
656	0.31
657	0.25
658	0.23
659	0.22
660	0.2
661	0.19
662	0.13
663	0.13
664	0.14
665	0.16
666	0.24
667	0.29
668	0.38
669	0.49
670	0.57
671	0.63
672	0.71
673	0.78
674	0.81
675	0.86
676	0.88
677	0.89
678	0.89
679	0.85
680	0.84
681	0.82
682	0.73
683	0.67
684	0.62
685	0.59
686	0.53
687	0.48
688	0.43
689	0.36

C9SK05

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer