Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SCX6

Protein Details
Accession C9SCX6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
773-799IPRDETTIRVHRRKRSRPSSPEDKDEDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11cyto_nucl 11, cyto 9, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG val:VDBG_03050  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
Amino Acid Sequences MLSAFTARPIIELKQRDKSKIETILAYGDRILVGLNSGALRVYRLNELPPPEPNGSAHTNPLDGDDDASLTPQPPQPAPKPTDLLREVEKFSTRAIEQLAIIKEATTLVSLSNYYISLHNLQTYELIETLSRTKNASCFAVTSNIVKDPDTGIPEIISRLAVAVRRRLLPGIQRLRGAGEPLRRCQQRWNGVHGPGRLHAQALGAKLAEGEMLLAKDINTLFITDEGKPVEKRQIPWQAAPDSIGYSYPYIVALQPPAKGSLEVRNPDTLSLLQTLALPGAAQLHFPPPNLSLAHAGKGFHISSERSVWKMDATDYDSQIDELVEKAKYDEAISILNMLEDALLKDKTETLREVSMLKAEAMFKQKKFRDSMDLFNEDHVPAPPERVLKLYPPAISGELSGWGQSRQDEAEEDKHDGDGSTKDTNGDSPSSENPPETAASPVKATGGFAKLFLGHRKAPASDTASIASKKLGTDVEDAPSIKGKSSDDLSLEEKDLADAVHALTGYLVGTRTRLQRVIDPVTTKLKRSDTNGSTEEAIKNLMPTSSDESDAQREGELQRTFRLVDTTLFRAYMYWRPQLAGSLFRIPNLCDPEVVNEKLLEHNRFTELVDFFYGKKLHSQALELLKRFGAAEKADEAAPTLHGPERTIAYLQNLPPHEIDLIIHYSEWTLKRDSEHAMEVFIADSENAETLPRDRVVTFLRRIDARLELQYLEHIIGELDDSTPDFHNRLVELYIQLLREGSSEGSQDDLMVRFVEFLRESKQYSLGKAYGLIPRDETTIRVHRRKRSRPSSPEDKDEDTPSIYHTLLSLYLTPPAPHKTALEPALDLLSKHGSRLPATSTMSLIPSTLPVSELESYFRGRIRSANSVVNESRIVAGLRATEYISSQALLLLGDGIPGGQGGRNRRVVITDERLCGVCHKRLGGSVVSVLPDNTVVHYGCLNRATAQKSDGQKAGSWGRMRSSTRDRPSVVGNGGEGTWQPTSPSTREREAPQGGGEGTYVFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.53
3 0.57
4 0.58
5 0.59
6 0.6
7 0.6
8 0.57
9 0.49
10 0.45
11 0.47
12 0.44
13 0.39
14 0.3
15 0.22
16 0.19
17 0.16
18 0.15
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.18
31 0.19
32 0.23
33 0.27
34 0.32
35 0.33
36 0.35
37 0.39
38 0.36
39 0.36
40 0.34
41 0.34
42 0.35
43 0.34
44 0.35
45 0.3
46 0.29
47 0.27
48 0.29
49 0.26
50 0.2
51 0.2
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.15
56 0.13
57 0.1
58 0.14
59 0.15
60 0.19
61 0.21
62 0.28
63 0.34
64 0.42
65 0.46
66 0.49
67 0.51
68 0.51
69 0.57
70 0.52
71 0.49
72 0.46
73 0.46
74 0.43
75 0.42
76 0.42
77 0.33
78 0.32
79 0.33
80 0.27
81 0.25
82 0.24
83 0.22
84 0.2
85 0.26
86 0.26
87 0.22
88 0.22
89 0.19
90 0.17
91 0.15
92 0.15
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.14
104 0.17
105 0.18
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.17
112 0.14
113 0.13
114 0.11
115 0.12
116 0.17
117 0.19
118 0.19
119 0.19
120 0.21
121 0.24
122 0.27
123 0.28
124 0.24
125 0.22
126 0.23
127 0.27
128 0.26
129 0.25
130 0.24
131 0.26
132 0.25
133 0.23
134 0.23
135 0.2
136 0.23
137 0.23
138 0.21
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.15
144 0.11
145 0.08
146 0.08
147 0.1
148 0.13
149 0.16
150 0.22
151 0.25
152 0.27
153 0.28
154 0.29
155 0.31
156 0.35
157 0.42
158 0.45
159 0.45
160 0.44
161 0.43
162 0.44
163 0.41
164 0.37
165 0.32
166 0.32
167 0.33
168 0.37
169 0.46
170 0.45
171 0.46
172 0.51
173 0.56
174 0.57
175 0.57
176 0.61
177 0.58
178 0.63
179 0.67
180 0.6
181 0.53
182 0.44
183 0.43
184 0.35
185 0.28
186 0.23
187 0.19
188 0.19
189 0.18
190 0.17
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.09
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.14
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.18
215 0.18
216 0.2
217 0.27
218 0.29
219 0.32
220 0.39
221 0.47
222 0.47
223 0.5
224 0.54
225 0.47
226 0.43
227 0.41
228 0.33
229 0.24
230 0.21
231 0.17
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.18
248 0.22
249 0.27
250 0.29
251 0.3
252 0.31
253 0.31
254 0.3
255 0.3
256 0.23
257 0.18
258 0.16
259 0.14
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.08
265 0.06
266 0.05
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.17
275 0.14
276 0.17
277 0.17
278 0.18
279 0.19
280 0.19
281 0.21
282 0.21
283 0.2
284 0.18
285 0.2
286 0.19
287 0.13
288 0.15
289 0.13
290 0.14
291 0.2
292 0.21
293 0.19
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.14
300 0.17
301 0.19
302 0.19
303 0.2
304 0.19
305 0.18
306 0.17
307 0.14
308 0.1
309 0.07
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.05
327 0.04
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.1
334 0.11
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.16
339 0.16
340 0.17
341 0.15
342 0.15
343 0.14
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.21
349 0.25
350 0.25
351 0.34
352 0.37
353 0.41
354 0.43
355 0.42
356 0.44
357 0.43
358 0.48
359 0.45
360 0.46
361 0.41
362 0.39
363 0.37
364 0.28
365 0.25
366 0.18
367 0.14
368 0.1
369 0.12
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.2
377 0.21
378 0.19
379 0.19
380 0.19
381 0.18
382 0.17
383 0.15
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.08
395 0.09
396 0.11
397 0.16
398 0.17
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.16
403 0.15
404 0.14
405 0.1
406 0.12
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.1
415 0.11
416 0.14
417 0.16
418 0.16
419 0.15
420 0.14
421 0.15
422 0.14
423 0.13
424 0.14
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.13
439 0.15
440 0.17
441 0.15
442 0.17
443 0.18
444 0.19
445 0.18
446 0.2
447 0.21
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.19
452 0.18
453 0.18
454 0.14
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.13
461 0.13
462 0.14
463 0.15
464 0.15
465 0.14
466 0.16
467 0.15
468 0.11
469 0.12
470 0.11
471 0.11
472 0.12
473 0.14
474 0.12
475 0.14
476 0.16
477 0.15
478 0.15
479 0.14
480 0.12
481 0.1
482 0.09
483 0.07
484 0.05
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.03
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.03
496 0.05
497 0.08
498 0.1
499 0.12
500 0.14
501 0.15
502 0.18
503 0.24
504 0.27
505 0.26
506 0.25
507 0.26
508 0.32
509 0.32
510 0.3
511 0.28
512 0.28
513 0.28
514 0.31
515 0.38
516 0.31
517 0.36
518 0.36
519 0.33
520 0.3
521 0.3
522 0.26
523 0.17
524 0.16
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.08
531 0.12
532 0.13
533 0.14
534 0.14
535 0.16
536 0.17
537 0.17
538 0.16
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.17
543 0.17
544 0.15
545 0.16
546 0.17
547 0.17
548 0.16
549 0.17
550 0.11
551 0.12
552 0.14
553 0.16
554 0.15
555 0.15
556 0.15
557 0.14
558 0.16
559 0.2
560 0.21
561 0.22
562 0.21
563 0.22
564 0.22
565 0.24
566 0.23
567 0.19
568 0.18
569 0.21
570 0.21
571 0.22
572 0.22
573 0.2
574 0.24
575 0.25
576 0.23
577 0.16
578 0.17
579 0.2
580 0.24
581 0.24
582 0.2
583 0.15
584 0.16
585 0.2
586 0.24
587 0.21
588 0.17
589 0.18
590 0.19
591 0.2
592 0.19
593 0.19
594 0.15
595 0.15
596 0.15
597 0.14
598 0.13
599 0.17
600 0.17
601 0.13
602 0.16
603 0.17
604 0.18
605 0.18
606 0.19
607 0.2
608 0.29
609 0.33
610 0.3
611 0.29
612 0.26
613 0.26
614 0.25
615 0.2
616 0.14
617 0.1
618 0.11
619 0.11
620 0.13
621 0.12
622 0.12
623 0.12
624 0.09
625 0.09
626 0.08
627 0.08
628 0.09
629 0.1
630 0.1
631 0.11
632 0.12
633 0.12
634 0.13
635 0.12
636 0.13
637 0.17
638 0.18
639 0.22
640 0.21
641 0.22
642 0.21
643 0.22
644 0.18
645 0.14
646 0.13
647 0.1
648 0.12
649 0.1
650 0.1
651 0.09
652 0.09
653 0.13
654 0.14
655 0.14
656 0.14
657 0.15
658 0.17
659 0.19
660 0.22
661 0.21
662 0.22
663 0.2
664 0.19
665 0.18
666 0.16
667 0.14
668 0.11
669 0.08
670 0.05
671 0.05
672 0.04
673 0.05
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.1
679 0.1
680 0.11
681 0.11
682 0.14
683 0.19
684 0.25
685 0.28
686 0.28
687 0.3
688 0.29
689 0.3
690 0.3
691 0.29
692 0.25
693 0.23
694 0.21
695 0.19
696 0.18
697 0.18
698 0.16
699 0.13
700 0.1
701 0.08
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.07
710 0.08
711 0.09
712 0.1
713 0.1
714 0.11
715 0.12
716 0.13
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.14
721 0.15
722 0.14
723 0.13
724 0.12
725 0.11
726 0.1
727 0.11
728 0.09
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.1
733 0.1
734 0.09
735 0.1
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.08
740 0.08
741 0.09
742 0.11
743 0.11
744 0.12
745 0.16
746 0.18
747 0.2
748 0.2
749 0.28
750 0.26
751 0.27
752 0.31
753 0.27
754 0.25
755 0.25
756 0.27
757 0.24
758 0.24
759 0.22
760 0.2
761 0.2
762 0.22
763 0.21
764 0.19
765 0.21
766 0.29
767 0.37
768 0.44
769 0.51
770 0.58
771 0.68
772 0.77
773 0.81
774 0.83
775 0.85
776 0.85
777 0.87
778 0.89
779 0.83
780 0.81
781 0.75
782 0.69
783 0.62
784 0.55
785 0.48
786 0.38
787 0.33
788 0.27
789 0.24
790 0.19
791 0.16
792 0.13
793 0.12
794 0.11
795 0.12
796 0.12
797 0.1
798 0.13
799 0.14
800 0.14
801 0.17
802 0.21
803 0.21
804 0.21
805 0.22
806 0.22
807 0.28
808 0.3
809 0.28
810 0.24
811 0.23
812 0.24
813 0.23
814 0.19
815 0.15
816 0.18
817 0.17
818 0.17
819 0.2
820 0.19
821 0.2
822 0.23
823 0.24
824 0.24
825 0.27
826 0.27
827 0.26
828 0.24
829 0.24
830 0.22
831 0.19
832 0.13
833 0.11
834 0.11
835 0.1
836 0.09
837 0.09
838 0.12
839 0.14
840 0.14
841 0.15
842 0.16
843 0.19
844 0.2
845 0.22
846 0.2
847 0.19
848 0.24
849 0.27
850 0.33
851 0.34
852 0.39
853 0.38
854 0.44
855 0.43
856 0.41
857 0.35
858 0.28
859 0.25
860 0.2
861 0.18
862 0.12
863 0.12
864 0.12
865 0.12
866 0.13
867 0.12
868 0.11
869 0.12
870 0.13
871 0.13
872 0.11
873 0.1
874 0.1
875 0.09
876 0.09
877 0.08
878 0.07
879 0.06
880 0.06
881 0.05
882 0.05
883 0.04
884 0.04
885 0.05
886 0.06
887 0.1
888 0.17
889 0.24
890 0.29
891 0.3
892 0.31
893 0.33
894 0.36
895 0.41
896 0.44
897 0.42
898 0.4
899 0.4
900 0.4
901 0.38
902 0.4
903 0.38
904 0.34
905 0.32
906 0.32
907 0.32
908 0.34
909 0.37
910 0.32
911 0.29
912 0.26
913 0.24
914 0.23
915 0.22
916 0.18
917 0.15
918 0.15
919 0.13
920 0.11
921 0.13
922 0.12
923 0.13
924 0.16
925 0.17
926 0.19
927 0.2
928 0.2
929 0.2
930 0.26
931 0.28
932 0.28
933 0.29
934 0.33
935 0.37
936 0.42
937 0.42
938 0.38
939 0.36
940 0.4
941 0.44
942 0.44
943 0.41
944 0.38
945 0.39
946 0.45
947 0.47
948 0.49
949 0.53
950 0.57
951 0.61
952 0.66
953 0.63
954 0.58
955 0.61
956 0.59
957 0.51
958 0.42
959 0.35
960 0.29
961 0.26
962 0.24
963 0.19
964 0.16
965 0.14
966 0.13
967 0.13
968 0.16
969 0.21
970 0.25
971 0.32
972 0.34
973 0.39
974 0.44
975 0.48
976 0.53
977 0.52
978 0.5
979 0.44
980 0.42
981 0.37
982 0.32
983 0.27