Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SCP6

Protein Details
Accession C9SCP6    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
577-601TPAGRTKRAKTHQHHHHHHHHHHHHBasic
806-832LFQDKEPIPNKRRKDKERDEQARQDANHydrophilic
909-930GAQSRLRGKARRERMRRAMAEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
549-561GKAPAKGKRRKLK
914-925LRGKARRERMRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG val:VDBG_02970  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MPPPGSPPQQGAQQPQQQQQPPHQIGSYGLPPPRGPHMTSGPPSFPGGRELPALGHMPRTNSTGSSMSISSMLGGPPSTSRDSQPPPSQYAPPTTSAASGPTFAPSVQASPRMPSAAADYQPFRRPYTPDHPRPYDPRGDPRGDPRADPRGSVAASPQKTHSTTPEMQRYGTPQSYHQRAPSQQESRESSRIPGGPPRPNSPPKSYQGAPPRQGDLGRAPGPEDAYQRREEVPPGAMEYNPERPGLKPFAYDDRYRAERERRDEMELRERERRDRAHSGGEGGRGHPAHQPDFRQHEPPRGQAPPYNRPPDARDHARDHAAWPRPPYEQSRAPYDPAGFYPRHPHPEQPSTAGPGYPGHAAPAYGQPPPPDRYPPSSHPPSSHPMPQTGPPNQPQPFDSPERARMNLLHPQAPQPPPGHRRPLEEGPPPPSVAYNPAHGSMYDSPRRPGEEGHASQRNLLAIQEINRKGRISPLPQAVQGAQPQISAPGGEPGIKSEFGRMFSGIGSGVSGIVSSPVAPGAQLAYTNASLARRDEVDAPLHDSGPEVGGKAPAKGKRRKLKDAPDVKVDEDSSGRLTPAGRTKRAKTHQHHHHHHHHHHHHEPDQHPAAAHAGVAPFKNTKGGTPVPSPTIGGKDPSAGHHHHHHAVPRAMPQVHLGKEPHVKTPLASPTVTLPPRPKTIVTSKEVLQSVASRPRHHLGDVVYEPRLQPARQLQRQPSDVGFSSTPVPLPWKLIKDKENCTMTVKVSRTHLTKEAREEITYRRALWGTDVYTDDTDVVAACIHGGWIRGEWSNVDVNMLDLDRGILFQDKEPIPNKRRKDKERDEQARQDANMATYLDKAPNTGPVQVQPDRDMQVTILILPRLEKYSSTVRFGVKSREWGGTYGGRKSVHDGISFMITAIRWVDNGAGAQSRLRGKARRERMRRAMAEVKAVNWPEANGQASPTDKGDKAPSEGDKENQPVERAEEPSEQGAVDDAPASVAEKQTEKSEVEVNGEKGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.62
3 0.67
4 0.66
5 0.66
6 0.68
7 0.69
8 0.65
9 0.6
10 0.54
11 0.46
12 0.42
13 0.42
14 0.38
15 0.33
16 0.31
17 0.3
18 0.31
19 0.33
20 0.38
21 0.37
22 0.34
23 0.34
24 0.39
25 0.45
26 0.5
27 0.52
28 0.46
29 0.44
30 0.45
31 0.41
32 0.34
33 0.31
34 0.28
35 0.25
36 0.25
37 0.24
38 0.21
39 0.22
40 0.25
41 0.2
42 0.24
43 0.24
44 0.26
45 0.27
46 0.29
47 0.27
48 0.25
49 0.28
50 0.24
51 0.23
52 0.23
53 0.21
54 0.19
55 0.18
56 0.17
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.15
65 0.18
66 0.19
67 0.22
68 0.3
69 0.36
70 0.44
71 0.51
72 0.51
73 0.54
74 0.56
75 0.58
76 0.53
77 0.55
78 0.49
79 0.43
80 0.41
81 0.35
82 0.33
83 0.28
84 0.28
85 0.21
86 0.19
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.15
92 0.13
93 0.15
94 0.17
95 0.23
96 0.22
97 0.24
98 0.26
99 0.25
100 0.24
101 0.22
102 0.26
103 0.26
104 0.27
105 0.28
106 0.29
107 0.33
108 0.4
109 0.42
110 0.39
111 0.37
112 0.39
113 0.43
114 0.51
115 0.56
116 0.59
117 0.67
118 0.69
119 0.72
120 0.75
121 0.73
122 0.72
123 0.67
124 0.67
125 0.65
126 0.63
127 0.6
128 0.61
129 0.64
130 0.56
131 0.53
132 0.5
133 0.52
134 0.48
135 0.45
136 0.4
137 0.36
138 0.35
139 0.32
140 0.32
141 0.31
142 0.32
143 0.34
144 0.33
145 0.33
146 0.34
147 0.36
148 0.34
149 0.34
150 0.38
151 0.45
152 0.51
153 0.47
154 0.46
155 0.46
156 0.46
157 0.45
158 0.43
159 0.36
160 0.34
161 0.41
162 0.46
163 0.48
164 0.48
165 0.48
166 0.48
167 0.55
168 0.57
169 0.55
170 0.54
171 0.58
172 0.59
173 0.58
174 0.58
175 0.51
176 0.44
177 0.43
178 0.42
179 0.37
180 0.39
181 0.41
182 0.44
183 0.48
184 0.51
185 0.53
186 0.59
187 0.63
188 0.62
189 0.61
190 0.58
191 0.61
192 0.57
193 0.56
194 0.59
195 0.62
196 0.59
197 0.55
198 0.53
199 0.48
200 0.47
201 0.42
202 0.35
203 0.33
204 0.3
205 0.28
206 0.26
207 0.25
208 0.27
209 0.27
210 0.28
211 0.26
212 0.27
213 0.28
214 0.29
215 0.3
216 0.3
217 0.29
218 0.26
219 0.23
220 0.2
221 0.22
222 0.21
223 0.19
224 0.2
225 0.22
226 0.25
227 0.24
228 0.24
229 0.21
230 0.21
231 0.27
232 0.3
233 0.27
234 0.23
235 0.25
236 0.33
237 0.36
238 0.37
239 0.34
240 0.35
241 0.37
242 0.38
243 0.41
244 0.41
245 0.45
246 0.49
247 0.54
248 0.51
249 0.55
250 0.57
251 0.56
252 0.57
253 0.55
254 0.53
255 0.53
256 0.52
257 0.51
258 0.52
259 0.51
260 0.49
261 0.52
262 0.5
263 0.49
264 0.47
265 0.47
266 0.42
267 0.41
268 0.34
269 0.27
270 0.28
271 0.22
272 0.22
273 0.21
274 0.22
275 0.23
276 0.26
277 0.28
278 0.31
279 0.38
280 0.39
281 0.45
282 0.43
283 0.48
284 0.48
285 0.5
286 0.49
287 0.45
288 0.44
289 0.4
290 0.45
291 0.45
292 0.51
293 0.52
294 0.47
295 0.47
296 0.47
297 0.51
298 0.52
299 0.5
300 0.47
301 0.47
302 0.49
303 0.5
304 0.47
305 0.41
306 0.41
307 0.4
308 0.37
309 0.34
310 0.33
311 0.33
312 0.35
313 0.39
314 0.37
315 0.38
316 0.38
317 0.43
318 0.43
319 0.42
320 0.41
321 0.36
322 0.31
323 0.25
324 0.27
325 0.2
326 0.19
327 0.25
328 0.27
329 0.32
330 0.32
331 0.36
332 0.39
333 0.46
334 0.46
335 0.43
336 0.41
337 0.38
338 0.37
339 0.31
340 0.25
341 0.18
342 0.18
343 0.15
344 0.13
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.2
355 0.23
356 0.24
357 0.25
358 0.27
359 0.32
360 0.38
361 0.41
362 0.45
363 0.49
364 0.48
365 0.46
366 0.46
367 0.46
368 0.43
369 0.44
370 0.36
371 0.33
372 0.33
373 0.35
374 0.37
375 0.36
376 0.37
377 0.34
378 0.41
379 0.4
380 0.39
381 0.36
382 0.33
383 0.33
384 0.33
385 0.35
386 0.3
387 0.37
388 0.38
389 0.38
390 0.35
391 0.32
392 0.31
393 0.33
394 0.32
395 0.27
396 0.25
397 0.27
398 0.32
399 0.32
400 0.31
401 0.27
402 0.32
403 0.35
404 0.4
405 0.45
406 0.41
407 0.45
408 0.47
409 0.51
410 0.5
411 0.49
412 0.46
413 0.43
414 0.42
415 0.37
416 0.31
417 0.25
418 0.2
419 0.19
420 0.17
421 0.15
422 0.15
423 0.16
424 0.16
425 0.15
426 0.19
427 0.18
428 0.23
429 0.25
430 0.25
431 0.26
432 0.26
433 0.28
434 0.25
435 0.22
436 0.22
437 0.25
438 0.26
439 0.32
440 0.36
441 0.34
442 0.34
443 0.34
444 0.28
445 0.2
446 0.18
447 0.12
448 0.08
449 0.11
450 0.18
451 0.2
452 0.21
453 0.22
454 0.22
455 0.21
456 0.26
457 0.28
458 0.24
459 0.28
460 0.32
461 0.32
462 0.32
463 0.33
464 0.27
465 0.25
466 0.22
467 0.17
468 0.12
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.09
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.11
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.13
488 0.12
489 0.11
490 0.12
491 0.08
492 0.07
493 0.05
494 0.04
495 0.04
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.08
518 0.09
519 0.08
520 0.09
521 0.11
522 0.12
523 0.14
524 0.14
525 0.16
526 0.16
527 0.15
528 0.14
529 0.12
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.06
534 0.06
535 0.09
536 0.09
537 0.11
538 0.15
539 0.2
540 0.28
541 0.35
542 0.45
543 0.51
544 0.58
545 0.66
546 0.7
547 0.75
548 0.77
549 0.79
550 0.73
551 0.7
552 0.64
553 0.55
554 0.48
555 0.38
556 0.28
557 0.19
558 0.17
559 0.12
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.12
565 0.2
566 0.24
567 0.29
568 0.33
569 0.37
570 0.46
571 0.54
572 0.61
573 0.6
574 0.65
575 0.7
576 0.76
577 0.81
578 0.79
579 0.81
580 0.81
581 0.81
582 0.81
583 0.79
584 0.75
585 0.73
586 0.69
587 0.64
588 0.62
589 0.55
590 0.52
591 0.46
592 0.4
593 0.33
594 0.29
595 0.25
596 0.17
597 0.16
598 0.09
599 0.07
600 0.08
601 0.08
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.13
606 0.12
607 0.12
608 0.16
609 0.19
610 0.21
611 0.24
612 0.25
613 0.24
614 0.24
615 0.24
616 0.2
617 0.2
618 0.17
619 0.15
620 0.14
621 0.14
622 0.15
623 0.16
624 0.2
625 0.18
626 0.21
627 0.25
628 0.29
629 0.3
630 0.31
631 0.33
632 0.35
633 0.36
634 0.35
635 0.33
636 0.35
637 0.31
638 0.29
639 0.29
640 0.28
641 0.26
642 0.28
643 0.25
644 0.25
645 0.31
646 0.32
647 0.33
648 0.3
649 0.29
650 0.26
651 0.31
652 0.32
653 0.28
654 0.26
655 0.23
656 0.23
657 0.31
658 0.31
659 0.28
660 0.28
661 0.29
662 0.33
663 0.34
664 0.31
665 0.3
666 0.38
667 0.41
668 0.4
669 0.39
670 0.37
671 0.41
672 0.4
673 0.35
674 0.27
675 0.22
676 0.24
677 0.29
678 0.3
679 0.26
680 0.3
681 0.34
682 0.34
683 0.32
684 0.31
685 0.24
686 0.29
687 0.3
688 0.28
689 0.25
690 0.25
691 0.24
692 0.25
693 0.26
694 0.18
695 0.2
696 0.27
697 0.37
698 0.43
699 0.51
700 0.53
701 0.57
702 0.6
703 0.57
704 0.48
705 0.42
706 0.36
707 0.32
708 0.26
709 0.2
710 0.2
711 0.17
712 0.17
713 0.13
714 0.16
715 0.13
716 0.18
717 0.21
718 0.25
719 0.3
720 0.36
721 0.43
722 0.46
723 0.51
724 0.55
725 0.53
726 0.49
727 0.48
728 0.44
729 0.39
730 0.4
731 0.36
732 0.31
733 0.32
734 0.36
735 0.34
736 0.35
737 0.4
738 0.39
739 0.41
740 0.45
741 0.48
742 0.44
743 0.43
744 0.41
745 0.39
746 0.4
747 0.38
748 0.32
749 0.28
750 0.27
751 0.26
752 0.27
753 0.26
754 0.19
755 0.2
756 0.21
757 0.2
758 0.2
759 0.2
760 0.17
761 0.12
762 0.11
763 0.08
764 0.07
765 0.05
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.04
770 0.05
771 0.06
772 0.06
773 0.07
774 0.09
775 0.1
776 0.11
777 0.11
778 0.13
779 0.15
780 0.14
781 0.14
782 0.12
783 0.12
784 0.12
785 0.12
786 0.09
787 0.06
788 0.07
789 0.06
790 0.06
791 0.07
792 0.09
793 0.1
794 0.11
795 0.19
796 0.19
797 0.25
798 0.3
799 0.39
800 0.44
801 0.52
802 0.59
803 0.62
804 0.72
805 0.77
806 0.82
807 0.83
808 0.86
809 0.89
810 0.9
811 0.88
812 0.86
813 0.85
814 0.79
815 0.68
816 0.61
817 0.51
818 0.42
819 0.36
820 0.28
821 0.2
822 0.17
823 0.18
824 0.17
825 0.16
826 0.16
827 0.14
828 0.21
829 0.22
830 0.23
831 0.23
832 0.24
833 0.32
834 0.34
835 0.36
836 0.31
837 0.33
838 0.33
839 0.32
840 0.28
841 0.21
842 0.2
843 0.18
844 0.17
845 0.16
846 0.14
847 0.13
848 0.14
849 0.16
850 0.16
851 0.16
852 0.15
853 0.17
854 0.27
855 0.3
856 0.33
857 0.35
858 0.35
859 0.38
860 0.41
861 0.45
862 0.39
863 0.42
864 0.41
865 0.43
866 0.41
867 0.38
868 0.4
869 0.39
870 0.39
871 0.36
872 0.37
873 0.33
874 0.33
875 0.37
876 0.4
877 0.36
878 0.33
879 0.3
880 0.27
881 0.28
882 0.27
883 0.22
884 0.16
885 0.12
886 0.12
887 0.13
888 0.12
889 0.09
890 0.1
891 0.1
892 0.1
893 0.11
894 0.12
895 0.12
896 0.12
897 0.14
898 0.18
899 0.21
900 0.25
901 0.31
902 0.36
903 0.43
904 0.53
905 0.63
906 0.68
907 0.74
908 0.79
909 0.84
910 0.87
911 0.82
912 0.79
913 0.77
914 0.69
915 0.68
916 0.59
917 0.5
918 0.46
919 0.44
920 0.37
921 0.29
922 0.27
923 0.21
924 0.24
925 0.24
926 0.18
927 0.18
928 0.2
929 0.22
930 0.23
931 0.23
932 0.24
933 0.22
934 0.25
935 0.31
936 0.3
937 0.33
938 0.37
939 0.38
940 0.4
941 0.43
942 0.43
943 0.43
944 0.44
945 0.45
946 0.42
947 0.4
948 0.35
949 0.37
950 0.38
951 0.34
952 0.34
953 0.33
954 0.32
955 0.32
956 0.31
957 0.26
958 0.21
959 0.19
960 0.15
961 0.11
962 0.09
963 0.07
964 0.07
965 0.07
966 0.09
967 0.1
968 0.12
969 0.14
970 0.16
971 0.18
972 0.21
973 0.25
974 0.24
975 0.25
976 0.28
977 0.27
978 0.31
979 0.35