Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S543

Protein Details
Accession C9S543    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-225WATTRRSRTRARKDKMREEERKLRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-225RRSRTRARKDKMREEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 9, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG val:VDBG_00250  -  
Amino Acid Sequences MASISAALASALPTPKYTGEDDAPAHAQQRGPRIVGAGHLDQTQVVLRRTGPPPYGQRTGWRPSGQEDFGDGGAFPEVPVAQYPLSMGQKSATASNALAVQVDAEGKVDYGAIARQGHNDSRIIHASFKDLIPLRQRADAGEIDLARPSRDEVAATTEKTKNALAALVSGAVAAQKPKNINVGNRADPTFVRYTPATRWATTRRSRTRARKDKMREEERKLRQSRMGAERRVQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDNPYDKPLFAAQDAISSIYRPKANMDEDEDEAAGDKEMAKIQKASRFGEALGRGTFKGAEEAEAREGPVQFEKETADPFNVDKFLSEVEQSSTAKRGYGLQEDESRQTKRARVDDEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.21
4 0.22
5 0.24
6 0.24
7 0.29
8 0.29
9 0.31
10 0.32
11 0.3
12 0.29
13 0.26
14 0.26
15 0.25
16 0.33
17 0.33
18 0.31
19 0.31
20 0.31
21 0.29
22 0.29
23 0.3
24 0.24
25 0.22
26 0.22
27 0.21
28 0.19
29 0.2
30 0.2
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.19
35 0.26
36 0.29
37 0.33
38 0.32
39 0.35
40 0.42
41 0.47
42 0.51
43 0.45
44 0.5
45 0.52
46 0.55
47 0.56
48 0.5
49 0.45
50 0.44
51 0.49
52 0.43
53 0.36
54 0.33
55 0.27
56 0.24
57 0.23
58 0.18
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.14
72 0.17
73 0.16
74 0.16
75 0.15
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.14
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.17
104 0.19
105 0.21
106 0.22
107 0.2
108 0.22
109 0.25
110 0.23
111 0.22
112 0.21
113 0.22
114 0.22
115 0.2
116 0.22
117 0.2
118 0.22
119 0.26
120 0.3
121 0.29
122 0.29
123 0.3
124 0.25
125 0.27
126 0.24
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.14
131 0.15
132 0.15
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.15
141 0.17
142 0.18
143 0.21
144 0.22
145 0.22
146 0.23
147 0.22
148 0.16
149 0.14
150 0.14
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.08
163 0.09
164 0.11
165 0.17
166 0.19
167 0.22
168 0.28
169 0.32
170 0.33
171 0.34
172 0.34
173 0.29
174 0.26
175 0.28
176 0.22
177 0.18
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.25
183 0.23
184 0.21
185 0.25
186 0.28
187 0.36
188 0.41
189 0.49
190 0.49
191 0.53
192 0.62
193 0.69
194 0.75
195 0.77
196 0.78
197 0.78
198 0.79
199 0.82
200 0.83
201 0.83
202 0.8
203 0.77
204 0.8
205 0.79
206 0.8
207 0.72
208 0.65
209 0.59
210 0.54
211 0.53
212 0.53
213 0.52
214 0.45
215 0.46
216 0.47
217 0.45
218 0.43
219 0.35
220 0.27
221 0.27
222 0.31
223 0.32
224 0.32
225 0.3
226 0.34
227 0.35
228 0.36
229 0.29
230 0.23
231 0.2
232 0.16
233 0.16
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.25
247 0.26
248 0.28
249 0.31
250 0.31
251 0.33
252 0.35
253 0.33
254 0.25
255 0.23
256 0.21
257 0.19
258 0.21
259 0.18
260 0.14
261 0.15
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.18
270 0.16
271 0.14
272 0.15
273 0.15
274 0.17
275 0.16
276 0.17
277 0.13
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.13
282 0.12
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.17
288 0.21
289 0.24
290 0.26
291 0.31
292 0.3
293 0.3
294 0.31
295 0.28
296 0.22
297 0.2
298 0.17
299 0.11
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.17
307 0.22
308 0.27
309 0.31
310 0.33
311 0.32
312 0.32
313 0.31
314 0.34
315 0.32
316 0.3
317 0.27
318 0.26
319 0.23
320 0.23
321 0.23
322 0.16
323 0.17
324 0.14
325 0.15
326 0.15
327 0.18
328 0.21
329 0.2
330 0.21
331 0.2
332 0.2
333 0.19
334 0.22
335 0.22
336 0.18
337 0.19
338 0.21
339 0.2
340 0.23
341 0.23
342 0.2
343 0.19
344 0.2
345 0.23
346 0.21
347 0.19
348 0.17
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.14
354 0.16
355 0.2
356 0.21
357 0.22
358 0.24
359 0.23
360 0.23
361 0.22
362 0.25
363 0.26
364 0.32
365 0.34
366 0.36
367 0.42
368 0.45
369 0.5
370 0.5
371 0.47
372 0.44
373 0.46
374 0.46
375 0.47
376 0.52
377 0.53