Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SQD4

Protein Details
Accession C9SQD4    Localization Confidence Low Confidence Score 5.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-138SYARWCRKCEAPKPPRAHHCRTCRRCIPKMDHHCPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 9extr 9, pero 3, nucl 1, mito 1, cyto 1, cyto_nucl 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1, cyto_mito 1, mito_nucl 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001594  Palmitoyltrfase_DHHC  
IPR033682  PFA4  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0019706  F:protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity  
GO:0018345  P:protein palmitoylation  
KEGG val:VDBG_07169  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01529  DHHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50216  DHHC  
Amino Acid Sequences MAGFNDAPIIQKLAVPGVTLLILFLGYSSQYLFLTAADLAPGPLTSSQLYTFNGLLLCLWFTYYKACTVDPGRYIFTSKILEVPDDNNGNETNPSRDDNLNLNSYARWCRKCEAPKPPRAHHCRTCRRCIPKMDHHCPWTTNCVSLTTLPHFLRFLVYTNLALAYLSYLLFLRFAALWSDRRLPAYLGPSLPALTHLACLAGVDFLTSVALGIMLATTTYHWLFNMTTIESWEADRHDDLVANRGGRAWWDAGRAPYQRVEFPYDLGLFANLAHAMGTRNPLLWLAPWAAGPSVSPVEGQGAGWTYEENGFNAREGMWPPPDPNKMRGRGAWPAARAALDREGQGPRYTTPAEDMAAFRRRQEADLRRWEGSRAEIMEELEEGEDYDVLDGDAEDGVRLHDAAGGAAWTNSDGERLYDYGVDEDAENTEVGLRHTIVGEADDDVPLAELLRRRKIRQKDGEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.14
4 0.12
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.07
9 0.06
10 0.05
11 0.05
12 0.04
13 0.04
14 0.05
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.13
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.17
40 0.17
41 0.15
42 0.14
43 0.12
44 0.11
45 0.08
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.13
50 0.13
51 0.17
52 0.18
53 0.18
54 0.23
55 0.25
56 0.3
57 0.3
58 0.32
59 0.31
60 0.3
61 0.32
62 0.28
63 0.29
64 0.26
65 0.23
66 0.23
67 0.21
68 0.22
69 0.21
70 0.22
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.21
75 0.2
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.18
80 0.18
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.24
85 0.28
86 0.3
87 0.29
88 0.27
89 0.26
90 0.23
91 0.26
92 0.32
93 0.33
94 0.33
95 0.33
96 0.36
97 0.44
98 0.53
99 0.59
100 0.62
101 0.64
102 0.7
103 0.75
104 0.8
105 0.82
106 0.81
107 0.81
108 0.79
109 0.8
110 0.82
111 0.81
112 0.83
113 0.81
114 0.81
115 0.8
116 0.8
117 0.78
118 0.77
119 0.81
120 0.79
121 0.76
122 0.71
123 0.66
124 0.59
125 0.52
126 0.49
127 0.39
128 0.33
129 0.27
130 0.26
131 0.24
132 0.24
133 0.25
134 0.2
135 0.25
136 0.23
137 0.24
138 0.22
139 0.21
140 0.21
141 0.18
142 0.17
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.11
149 0.1
150 0.08
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.08
163 0.1
164 0.12
165 0.15
166 0.19
167 0.18
168 0.2
169 0.2
170 0.19
171 0.2
172 0.22
173 0.21
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.14
179 0.12
180 0.1
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.13
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.1
234 0.12
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.2
244 0.21
245 0.21
246 0.22
247 0.26
248 0.21
249 0.21
250 0.22
251 0.19
252 0.18
253 0.16
254 0.13
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.11
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.18
307 0.24
308 0.31
309 0.32
310 0.38
311 0.43
312 0.44
313 0.47
314 0.48
315 0.46
316 0.45
317 0.49
318 0.46
319 0.39
320 0.36
321 0.33
322 0.31
323 0.26
324 0.22
325 0.2
326 0.17
327 0.17
328 0.18
329 0.19
330 0.2
331 0.21
332 0.2
333 0.17
334 0.2
335 0.2
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.2
343 0.26
344 0.26
345 0.24
346 0.29
347 0.29
348 0.3
349 0.39
350 0.42
351 0.45
352 0.55
353 0.58
354 0.54
355 0.54
356 0.53
357 0.45
358 0.39
359 0.34
360 0.25
361 0.22
362 0.22
363 0.21
364 0.2
365 0.18
366 0.15
367 0.11
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.11
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.13
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.08
415 0.11
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.14
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.12
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.09
433 0.08
434 0.1
435 0.14
436 0.21
437 0.31
438 0.37
439 0.43
440 0.53
441 0.63
442 0.71