Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SNB8

Protein Details
Accession C9SNB8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MARRRTKKKTHLGANNPETAAHydrophilic
372-399ELDQRWEKRKADKEARRKEQKANIESKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-406EKRKADKEARRKEQKANIESKKAAKKANG
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG val:VDBG_06393  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARRRTKKKTHLGANNPETAAPGHATISDPKSMVIRIGAGEVGSSVSQLAADVRKVMEPGTASRLKERRSNKLKDYIVMAGPLGVTHFLLFSRSESGNTNLRIGLTPRGPTMHFRVEKYSLCKDVQRAQRHPKGFGNDAVTPPLLVMNNFSAPNATSKSAVPKHLESLATTVFQSLFPPINPQSTSLKTIRRVLLLNREIDPENEGCFILNFRHYAITTRATGLSKPLKRLNAAEKLVAGKTGGPRQKGGVPNLGKLEDIADYMIGGDHGNGYMTDGGTSGSEVDTDAEIEVLERNPKKLSTGKPKPATAATAADDFEDQEDNDEGVERRAVKLVELGPRMRLRLTKVEEGLCSGKPMWHEYVQKSRAEEQELDQRWEKRKADKEARRKEQKANIESKKAAKKANGGARGDDEDEDEDEDMEDYDDYEFDSEGLEGDGEMQVNEKAEENGEWEDEEEEIANG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.82
3 0.72
4 0.61
5 0.52
6 0.42
7 0.34
8 0.24
9 0.18
10 0.13
11 0.13
12 0.15
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.21
17 0.21
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.17
22 0.15
23 0.13
24 0.14
25 0.14
26 0.11
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.06
33 0.05
34 0.05
35 0.06
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.12
40 0.13
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.17
47 0.23
48 0.27
49 0.27
50 0.35
51 0.41
52 0.42
53 0.48
54 0.52
55 0.55
56 0.6
57 0.68
58 0.67
59 0.71
60 0.7
61 0.64
62 0.62
63 0.55
64 0.46
65 0.38
66 0.31
67 0.21
68 0.18
69 0.15
70 0.11
71 0.07
72 0.06
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.13
80 0.13
81 0.15
82 0.17
83 0.21
84 0.26
85 0.27
86 0.27
87 0.23
88 0.23
89 0.23
90 0.22
91 0.24
92 0.21
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.3
99 0.34
100 0.34
101 0.34
102 0.39
103 0.41
104 0.44
105 0.46
106 0.45
107 0.4
108 0.38
109 0.4
110 0.38
111 0.42
112 0.47
113 0.51
114 0.54
115 0.6
116 0.66
117 0.66
118 0.66
119 0.63
120 0.6
121 0.53
122 0.49
123 0.44
124 0.38
125 0.37
126 0.34
127 0.28
128 0.23
129 0.19
130 0.17
131 0.12
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.13
144 0.14
145 0.22
146 0.25
147 0.28
148 0.29
149 0.28
150 0.3
151 0.32
152 0.31
153 0.24
154 0.23
155 0.2
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.13
166 0.14
167 0.17
168 0.17
169 0.2
170 0.22
171 0.23
172 0.28
173 0.27
174 0.31
175 0.31
176 0.36
177 0.35
178 0.33
179 0.33
180 0.31
181 0.37
182 0.36
183 0.34
184 0.3
185 0.3
186 0.29
187 0.27
188 0.26
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.19
211 0.24
212 0.24
213 0.27
214 0.3
215 0.3
216 0.31
217 0.35
218 0.36
219 0.36
220 0.35
221 0.31
222 0.28
223 0.28
224 0.26
225 0.22
226 0.16
227 0.1
228 0.11
229 0.18
230 0.2
231 0.19
232 0.2
233 0.22
234 0.27
235 0.3
236 0.3
237 0.31
238 0.29
239 0.31
240 0.32
241 0.3
242 0.24
243 0.2
244 0.18
245 0.1
246 0.09
247 0.07
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.12
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.19
286 0.25
287 0.33
288 0.38
289 0.48
290 0.56
291 0.61
292 0.62
293 0.61
294 0.56
295 0.49
296 0.4
297 0.33
298 0.25
299 0.21
300 0.2
301 0.17
302 0.16
303 0.13
304 0.12
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.12
315 0.1
316 0.1
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.16
321 0.19
322 0.24
323 0.27
324 0.27
325 0.3
326 0.32
327 0.32
328 0.3
329 0.28
330 0.26
331 0.32
332 0.37
333 0.37
334 0.39
335 0.4
336 0.38
337 0.4
338 0.38
339 0.29
340 0.25
341 0.2
342 0.18
343 0.18
344 0.22
345 0.22
346 0.26
347 0.32
348 0.35
349 0.45
350 0.48
351 0.49
352 0.48
353 0.49
354 0.47
355 0.45
356 0.41
357 0.35
358 0.41
359 0.41
360 0.42
361 0.42
362 0.44
363 0.46
364 0.53
365 0.53
366 0.52
367 0.59
368 0.65
369 0.7
370 0.75
371 0.79
372 0.82
373 0.89
374 0.9
375 0.86
376 0.85
377 0.83
378 0.83
379 0.81
380 0.8
381 0.77
382 0.74
383 0.73
384 0.72
385 0.72
386 0.67
387 0.63
388 0.57
389 0.58
390 0.59
391 0.64
392 0.63
393 0.56
394 0.54
395 0.52
396 0.5
397 0.44
398 0.35
399 0.28
400 0.22
401 0.21
402 0.2
403 0.16
404 0.13
405 0.12
406 0.12
407 0.1
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.07
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.1
430 0.11
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.13
435 0.15
436 0.16
437 0.16
438 0.16
439 0.15
440 0.15
441 0.13
442 0.14