Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHT5

Protein Details
Accession C9SHT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
483-511EGEDKGGKGKRKRGPKKRKGDANNAADVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
487-502KGGKGKRKRGPKKRKG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039896  Red-like  
IPR012916  RED_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG val:VDBG_04617  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07808  RED_N  
Amino Acid Sequences MNNDQFRRLVGASSSQSGSPSNGSSASTASPAGATPSALGSRQRSSIPMTPRSVGGGYSSRNEFARQLAARNNPDQAQKKFRTSAPKGSRLAEGYVDRSKEREAEEEDERAARIKALEELLKKEEIDQETFEKQRDQIAGGDLSSTHLVKGLDRKLLARIRQGEDDEFDRIEVKEVQAVANADKAEKKKGQVALIPGKKRTRDQIVAEMKAARLVAVQAAKEASLGDRFKKIGARQKAGTRIERVNKGREVMIIVVEDGHEKRKVRKVQRDFEEDERQRELMRPDKDAKPLGMEVPEIYQKQAEPAKEEDDDIFADAGDDYDPLAGMDSDSDEDEDHEHKDKTASEEEAQAVDEKAAAKQAMPPPPRRKQAEAKDYFKGSKTELLSAQTRKAPSMSDPDIQAAFKRAAQLGAAAKDRKGDDEDDDMADEEARRRAEKHKKMLESSNRDDADIDMGFGTSRFEDEEDFDDTKVKLSEWGHDDDEGEDKGGKGKRKRGPKKRKGDANNAADVLRVMEQRKAAGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.26
3 0.26
4 0.25
5 0.25
6 0.21
7 0.19
8 0.17
9 0.17
10 0.18
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.1
23 0.13
24 0.14
25 0.15
26 0.2
27 0.21
28 0.24
29 0.26
30 0.27
31 0.27
32 0.32
33 0.37
34 0.4
35 0.44
36 0.45
37 0.43
38 0.43
39 0.44
40 0.38
41 0.31
42 0.27
43 0.24
44 0.23
45 0.26
46 0.27
47 0.26
48 0.26
49 0.28
50 0.25
51 0.22
52 0.29
53 0.26
54 0.28
55 0.33
56 0.4
57 0.44
58 0.45
59 0.46
60 0.41
61 0.48
62 0.52
63 0.52
64 0.54
65 0.54
66 0.58
67 0.59
68 0.6
69 0.62
70 0.61
71 0.65
72 0.64
73 0.68
74 0.64
75 0.62
76 0.61
77 0.52
78 0.48
79 0.41
80 0.34
81 0.31
82 0.32
83 0.32
84 0.28
85 0.28
86 0.27
87 0.26
88 0.26
89 0.26
90 0.26
91 0.29
92 0.31
93 0.31
94 0.31
95 0.28
96 0.26
97 0.23
98 0.18
99 0.14
100 0.12
101 0.11
102 0.13
103 0.15
104 0.2
105 0.21
106 0.25
107 0.26
108 0.27
109 0.26
110 0.25
111 0.28
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.25
116 0.29
117 0.3
118 0.29
119 0.25
120 0.23
121 0.26
122 0.25
123 0.22
124 0.19
125 0.21
126 0.2
127 0.18
128 0.17
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.11
133 0.08
134 0.1
135 0.1
136 0.12
137 0.19
138 0.21
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.3
143 0.36
144 0.37
145 0.37
146 0.39
147 0.39
148 0.42
149 0.43
150 0.36
151 0.33
152 0.32
153 0.27
154 0.2
155 0.17
156 0.15
157 0.13
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.11
170 0.15
171 0.16
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.27
176 0.3
177 0.32
178 0.31
179 0.37
180 0.41
181 0.46
182 0.47
183 0.47
184 0.47
185 0.47
186 0.46
187 0.45
188 0.43
189 0.42
190 0.42
191 0.47
192 0.49
193 0.48
194 0.47
195 0.41
196 0.33
197 0.28
198 0.25
199 0.14
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.06
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.2
218 0.24
219 0.29
220 0.35
221 0.37
222 0.39
223 0.44
224 0.5
225 0.51
226 0.49
227 0.44
228 0.43
229 0.44
230 0.49
231 0.47
232 0.44
233 0.41
234 0.39
235 0.35
236 0.29
237 0.25
238 0.17
239 0.15
240 0.1
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.16
250 0.24
251 0.33
252 0.41
253 0.51
254 0.58
255 0.64
256 0.7
257 0.72
258 0.67
259 0.65
260 0.66
261 0.57
262 0.51
263 0.43
264 0.37
265 0.31
266 0.3
267 0.28
268 0.25
269 0.25
270 0.27
271 0.31
272 0.34
273 0.37
274 0.36
275 0.32
276 0.27
277 0.26
278 0.23
279 0.18
280 0.15
281 0.11
282 0.11
283 0.14
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.14
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.18
293 0.2
294 0.2
295 0.21
296 0.17
297 0.15
298 0.15
299 0.12
300 0.1
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.15
328 0.16
329 0.19
330 0.21
331 0.22
332 0.2
333 0.22
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.16
338 0.13
339 0.1
340 0.1
341 0.08
342 0.07
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.14
347 0.2
348 0.28
349 0.32
350 0.42
351 0.49
352 0.58
353 0.66
354 0.65
355 0.66
356 0.67
357 0.73
358 0.74
359 0.73
360 0.7
361 0.66
362 0.64
363 0.6
364 0.52
365 0.43
366 0.34
367 0.32
368 0.29
369 0.28
370 0.26
371 0.28
372 0.32
373 0.32
374 0.34
375 0.32
376 0.31
377 0.29
378 0.27
379 0.25
380 0.22
381 0.28
382 0.28
383 0.27
384 0.27
385 0.28
386 0.28
387 0.27
388 0.25
389 0.2
390 0.17
391 0.15
392 0.17
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.18
397 0.18
398 0.21
399 0.25
400 0.24
401 0.24
402 0.27
403 0.27
404 0.26
405 0.25
406 0.23
407 0.22
408 0.25
409 0.27
410 0.23
411 0.24
412 0.22
413 0.19
414 0.17
415 0.15
416 0.13
417 0.15
418 0.16
419 0.16
420 0.19
421 0.28
422 0.39
423 0.48
424 0.56
425 0.61
426 0.66
427 0.71
428 0.78
429 0.79
430 0.77
431 0.73
432 0.72
433 0.63
434 0.56
435 0.51
436 0.42
437 0.35
438 0.26
439 0.21
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.11
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.09
449 0.1
450 0.12
451 0.15
452 0.19
453 0.2
454 0.2
455 0.22
456 0.21
457 0.22
458 0.21
459 0.18
460 0.19
461 0.19
462 0.26
463 0.28
464 0.32
465 0.31
466 0.31
467 0.32
468 0.27
469 0.29
470 0.22
471 0.19
472 0.15
473 0.14
474 0.2
475 0.24
476 0.31
477 0.36
478 0.46
479 0.52
480 0.63
481 0.74
482 0.79
483 0.86
484 0.88
485 0.91
486 0.92
487 0.95
488 0.93
489 0.93
490 0.92
491 0.87
492 0.83
493 0.73
494 0.62
495 0.52
496 0.42
497 0.33
498 0.27
499 0.23
500 0.18
501 0.21
502 0.22