Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SYD1

Protein Details
Accession C9SYD1    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
330-350EEERGGRRRRREEGQEGRAHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-172AKPPKKKLKM
335-340GRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, extr 4, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG val:VDBG_09906  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd20908  SUF4-like  
Amino Acid Sequences MSDMISQLGSSLDVLFTYGQEARAPRCRGHPGASVVLLLFVAITHGRMPHTADTDPDAGERDFEDLKLLISHQKAKHFKCDRCGRRLNTAGGLSVHLNQVHKETLDHVENALPNRQGLDVEIFGMEGIPADILDQHRNRIIQNFYQAQEDRRAATGNPLPGQAKPPKKKLKMETPEELKARLADHRAKVAAAKAAGLPHPGISVSPAAGAPANASPGAFNNSPYPAPRRASYGAAPADPQFPANAQAAGTVPLGYPQPGFPGGPGAFNGFSPAALPARPSNSSLAAPPGLPQRPQNAGGYYNGGPTGQPGEVGDAIDQIIRDAELRQQDEEERGGRRRRREEGQEGRAHGVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.07
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.15
8 0.18
9 0.23
10 0.32
11 0.35
12 0.35
13 0.4
14 0.48
15 0.49
16 0.52
17 0.53
18 0.49
19 0.5
20 0.48
21 0.41
22 0.33
23 0.29
24 0.23
25 0.15
26 0.09
27 0.05
28 0.06
29 0.05
30 0.06
31 0.07
32 0.09
33 0.1
34 0.11
35 0.15
36 0.18
37 0.21
38 0.21
39 0.21
40 0.24
41 0.25
42 0.24
43 0.21
44 0.2
45 0.16
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.14
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.15
57 0.18
58 0.26
59 0.27
60 0.37
61 0.45
62 0.47
63 0.57
64 0.61
65 0.62
66 0.64
67 0.72
68 0.7
69 0.72
70 0.78
71 0.71
72 0.71
73 0.73
74 0.66
75 0.6
76 0.52
77 0.44
78 0.35
79 0.33
80 0.24
81 0.2
82 0.18
83 0.15
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.14
91 0.17
92 0.19
93 0.18
94 0.17
95 0.18
96 0.2
97 0.21
98 0.22
99 0.17
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.02
117 0.03
118 0.05
119 0.06
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.22
127 0.24
128 0.21
129 0.26
130 0.28
131 0.27
132 0.31
133 0.31
134 0.28
135 0.29
136 0.28
137 0.23
138 0.2
139 0.2
140 0.15
141 0.2
142 0.21
143 0.18
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.19
148 0.24
149 0.26
150 0.33
151 0.36
152 0.45
153 0.53
154 0.58
155 0.66
156 0.68
157 0.71
158 0.7
159 0.7
160 0.68
161 0.63
162 0.62
163 0.55
164 0.49
165 0.38
166 0.3
167 0.25
168 0.2
169 0.2
170 0.19
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.21
175 0.21
176 0.2
177 0.17
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.11
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.17
211 0.21
212 0.22
213 0.24
214 0.24
215 0.28
216 0.28
217 0.31
218 0.3
219 0.32
220 0.29
221 0.27
222 0.27
223 0.22
224 0.22
225 0.18
226 0.17
227 0.1
228 0.09
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.07
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.09
248 0.16
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.18
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.13
264 0.17
265 0.18
266 0.2
267 0.21
268 0.22
269 0.23
270 0.22
271 0.23
272 0.2
273 0.18
274 0.19
275 0.24
276 0.24
277 0.25
278 0.28
279 0.29
280 0.33
281 0.36
282 0.37
283 0.31
284 0.31
285 0.3
286 0.32
287 0.27
288 0.23
289 0.21
290 0.18
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.13
298 0.14
299 0.15
300 0.13
301 0.11
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.13
311 0.19
312 0.22
313 0.23
314 0.25
315 0.27
316 0.29
317 0.32
318 0.31
319 0.3
320 0.36
321 0.44
322 0.49
323 0.56
324 0.62
325 0.66
326 0.71
327 0.75
328 0.78
329 0.8
330 0.83
331 0.8
332 0.75