Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SKB2

Protein Details
Accession C9SKB2    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-35EILTTRRRSNGPRRRSQRQATTTGRHydrophilic
193-213GAAGRGKKPRQGRTARPAKKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-212PKSAASNKHNAAKTAGAAGRGKKPRQGRTARPAKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG val:VDBG_05239  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSGKLDQSLDEILTTRRRSNGPRRRSQRQATTTGRPTVAAPVGGVQKNPRNARTPANKPTPAKAAPHTGDSKIIVNNLPKDVNEQQIKEYFAQSVGSIKKVEISYGPNSVSRGIANVSFSKPDGASKAFNKLNGLLVDGRPIKIEIVVGASQAANVIPPTKTLAERTSQPKSQAKAQPKSAASNKHNAAKTAGAAGRGKKPRQGRTARPAKKTAEELDSEMADYFEAAPAGTTDATSGAAVPAATGDAPMDEIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.3
4 0.35
5 0.44
6 0.54
7 0.6
8 0.63
9 0.71
10 0.76
11 0.81
12 0.86
13 0.86
14 0.86
15 0.83
16 0.82
17 0.78
18 0.78
19 0.75
20 0.7
21 0.6
22 0.5
23 0.44
24 0.39
25 0.34
26 0.25
27 0.19
28 0.17
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.24
33 0.28
34 0.36
35 0.41
36 0.41
37 0.41
38 0.43
39 0.52
40 0.56
41 0.59
42 0.6
43 0.64
44 0.68
45 0.64
46 0.66
47 0.63
48 0.56
49 0.51
50 0.45
51 0.44
52 0.39
53 0.41
54 0.4
55 0.34
56 0.33
57 0.3
58 0.29
59 0.22
60 0.22
61 0.2
62 0.21
63 0.22
64 0.22
65 0.22
66 0.19
67 0.24
68 0.25
69 0.3
70 0.29
71 0.28
72 0.28
73 0.3
74 0.32
75 0.27
76 0.26
77 0.18
78 0.15
79 0.15
80 0.12
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.13
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.13
90 0.16
91 0.17
92 0.19
93 0.2
94 0.17
95 0.18
96 0.18
97 0.16
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.14
113 0.14
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.21
120 0.18
121 0.18
122 0.13
123 0.12
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.12
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.1
132 0.05
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.15
151 0.17
152 0.22
153 0.28
154 0.32
155 0.33
156 0.39
157 0.41
158 0.42
159 0.48
160 0.51
161 0.54
162 0.55
163 0.58
164 0.59
165 0.55
166 0.6
167 0.56
168 0.58
169 0.51
170 0.53
171 0.51
172 0.52
173 0.51
174 0.45
175 0.42
176 0.34
177 0.31
178 0.28
179 0.26
180 0.22
181 0.23
182 0.25
183 0.32
184 0.38
185 0.39
186 0.4
187 0.48
188 0.53
189 0.6
190 0.67
191 0.67
192 0.71
193 0.8
194 0.82
195 0.8
196 0.78
197 0.72
198 0.68
199 0.64
200 0.57
201 0.51
202 0.45
203 0.41
204 0.37
205 0.33
206 0.28
207 0.23
208 0.18
209 0.13
210 0.11
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05