Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SCX4

Protein Details
Accession C9SCX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
785-810AAVHEHPGQRGRRRGRERRGEQEDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
282-306EKEKSKVKLFSRPVKIGTKGESKEK
793-803QRGRRRGRERR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 7, extr 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013745  Bit61/PRR5  
KEGG val:VDBG_03048  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08539  HbrB  
Amino Acid Sequences MQPARPNPRAPGSFSPLAGSAAAASSAAAAMQPPQRPRPAPRLDSESSEDLSLNVSKQRNHAPSAPAGTPIYSQFASQNNGSTASLQNFSRPTAQRPHINTNDLNTTSNSSVRTASPLTKSYHSRKHSQTQGLFEPTLPSTSTSNLSHISMVQPPAANLALTASQIAAQAAFQHQNNSAHTRQRSQTVPAPGEDGARRGSNGKGPLSPPILSLTEASGPRESGFGNHSYHNGLLNHSSAAHSAANAAYPRSGQSSPGLPQHPSSPILPPQPQALDQRPAKLEKEKSKVKLFSRPVKIGTKGESKEKPLPSPSKIGSAFASLSKGELQHQQSRRPERPVNLQSDNSSSATIRPVDTLVEREVKEKEKKHNFLSRQKNKLKEDYHLPLSSASSNSKPTDPNAPTSLYSFNIPAGQTAATSSSFAKGRKDRKTERSDSRLDSESTLNLQSEWPGPGSLPSASSYSLTPGVDPTESGKYGLNNMSLDDAWPFLKAKMLVIFEGEDLRQLVEDYNRLVNLHIQYCIQRRSPTIMLEDLRELLMTGFASLDHTLRRTQEDKVIPALVEMWLITYTSILPYMQAVFLPLDLEFSGCGALMTPEQAYDFWGGVLDPAGDGVNPASSVLDIRRIVLAAYRDRIILPRFENLKTIFSRLSLEFLPSSFGNMALASDSVSALSSSPATQSELGLARPGTAMSLDPSLASYGSTSTTLLGEAVSAAGSNGGNSGNAAVSSRSRAISNVSYASGGSDQQLRPFTPSSGAVGSQQVLGQRQGAERRGFEAGHGNGRADAAVHEHPGQRGRRRGRERRGEQEDGGALPAAQAELARTRTDRPES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.47
3 0.39
4 0.37
5 0.29
6 0.21
7 0.14
8 0.11
9 0.1
10 0.08
11 0.06
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.04
16 0.04
17 0.09
18 0.15
19 0.21
20 0.26
21 0.33
22 0.41
23 0.47
24 0.53
25 0.59
26 0.64
27 0.64
28 0.65
29 0.67
30 0.62
31 0.62
32 0.6
33 0.53
34 0.44
35 0.39
36 0.33
37 0.25
38 0.25
39 0.21
40 0.17
41 0.2
42 0.23
43 0.24
44 0.3
45 0.39
46 0.41
47 0.44
48 0.48
49 0.46
50 0.49
51 0.52
52 0.47
53 0.41
54 0.37
55 0.33
56 0.29
57 0.26
58 0.24
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.22
63 0.25
64 0.25
65 0.27
66 0.24
67 0.26
68 0.25
69 0.24
70 0.23
71 0.23
72 0.25
73 0.21
74 0.25
75 0.24
76 0.26
77 0.32
78 0.31
79 0.34
80 0.4
81 0.46
82 0.5
83 0.56
84 0.64
85 0.61
86 0.64
87 0.6
88 0.55
89 0.56
90 0.49
91 0.44
92 0.35
93 0.34
94 0.3
95 0.3
96 0.27
97 0.21
98 0.21
99 0.2
100 0.23
101 0.22
102 0.25
103 0.28
104 0.31
105 0.33
106 0.37
107 0.44
108 0.49
109 0.55
110 0.55
111 0.59
112 0.62
113 0.68
114 0.71
115 0.73
116 0.7
117 0.66
118 0.68
119 0.64
120 0.57
121 0.48
122 0.41
123 0.32
124 0.29
125 0.23
126 0.18
127 0.15
128 0.16
129 0.2
130 0.18
131 0.2
132 0.2
133 0.21
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.18
144 0.15
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.1
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.2
162 0.23
163 0.26
164 0.31
165 0.32
166 0.36
167 0.39
168 0.43
169 0.41
170 0.43
171 0.43
172 0.42
173 0.46
174 0.46
175 0.44
176 0.39
177 0.39
178 0.33
179 0.34
180 0.29
181 0.24
182 0.19
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.2
188 0.24
189 0.24
190 0.25
191 0.26
192 0.3
193 0.32
194 0.3
195 0.26
196 0.24
197 0.23
198 0.2
199 0.2
200 0.16
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.14
209 0.11
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.17
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.21
218 0.19
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.14
225 0.1
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.13
238 0.14
239 0.13
240 0.14
241 0.18
242 0.2
243 0.26
244 0.27
245 0.24
246 0.24
247 0.26
248 0.26
249 0.24
250 0.23
251 0.21
252 0.24
253 0.29
254 0.3
255 0.28
256 0.28
257 0.27
258 0.29
259 0.31
260 0.3
261 0.33
262 0.32
263 0.35
264 0.35
265 0.36
266 0.36
267 0.38
268 0.42
269 0.42
270 0.49
271 0.52
272 0.56
273 0.61
274 0.65
275 0.61
276 0.63
277 0.62
278 0.63
279 0.64
280 0.61
281 0.58
282 0.56
283 0.56
284 0.49
285 0.46
286 0.44
287 0.39
288 0.43
289 0.42
290 0.42
291 0.46
292 0.46
293 0.45
294 0.44
295 0.47
296 0.43
297 0.45
298 0.41
299 0.4
300 0.38
301 0.36
302 0.29
303 0.25
304 0.23
305 0.18
306 0.18
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.16
313 0.2
314 0.27
315 0.31
316 0.37
317 0.44
318 0.52
319 0.55
320 0.56
321 0.56
322 0.52
323 0.59
324 0.58
325 0.57
326 0.53
327 0.49
328 0.43
329 0.41
330 0.39
331 0.3
332 0.24
333 0.17
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.15
345 0.15
346 0.17
347 0.19
348 0.24
349 0.3
350 0.34
351 0.42
352 0.47
353 0.51
354 0.56
355 0.62
356 0.64
357 0.67
358 0.74
359 0.73
360 0.73
361 0.75
362 0.76
363 0.71
364 0.72
365 0.64
366 0.56
367 0.54
368 0.49
369 0.47
370 0.39
371 0.36
372 0.28
373 0.27
374 0.24
375 0.18
376 0.15
377 0.12
378 0.15
379 0.15
380 0.17
381 0.16
382 0.17
383 0.24
384 0.24
385 0.25
386 0.25
387 0.25
388 0.24
389 0.24
390 0.24
391 0.16
392 0.16
393 0.13
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.11
408 0.12
409 0.17
410 0.23
411 0.32
412 0.39
413 0.47
414 0.53
415 0.6
416 0.68
417 0.71
418 0.72
419 0.7
420 0.66
421 0.6
422 0.56
423 0.49
424 0.41
425 0.34
426 0.27
427 0.21
428 0.18
429 0.16
430 0.12
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.09
448 0.1
449 0.11
450 0.1
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.11
462 0.14
463 0.16
464 0.15
465 0.12
466 0.12
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.09
471 0.08
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.07
476 0.09
477 0.09
478 0.1
479 0.13
480 0.14
481 0.13
482 0.13
483 0.13
484 0.11
485 0.12
486 0.11
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.08
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.13
501 0.15
502 0.15
503 0.14
504 0.14
505 0.18
506 0.23
507 0.26
508 0.25
509 0.24
510 0.24
511 0.3
512 0.31
513 0.29
514 0.27
515 0.27
516 0.26
517 0.25
518 0.24
519 0.19
520 0.16
521 0.14
522 0.11
523 0.07
524 0.07
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.09
534 0.11
535 0.12
536 0.17
537 0.17
538 0.19
539 0.26
540 0.29
541 0.29
542 0.3
543 0.3
544 0.25
545 0.23
546 0.22
547 0.14
548 0.1
549 0.08
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.07
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.07
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.05
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.04
604 0.05
605 0.06
606 0.07
607 0.12
608 0.12
609 0.13
610 0.14
611 0.14
612 0.14
613 0.16
614 0.2
615 0.18
616 0.2
617 0.2
618 0.2
619 0.2
620 0.24
621 0.23
622 0.24
623 0.22
624 0.26
625 0.29
626 0.29
627 0.34
628 0.32
629 0.35
630 0.31
631 0.33
632 0.26
633 0.24
634 0.27
635 0.23
636 0.24
637 0.19
638 0.2
639 0.17
640 0.16
641 0.18
642 0.14
643 0.16
644 0.13
645 0.13
646 0.11
647 0.1
648 0.1
649 0.08
650 0.08
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.05
658 0.06
659 0.07
660 0.07
661 0.08
662 0.09
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.14
667 0.15
668 0.15
669 0.17
670 0.16
671 0.14
672 0.13
673 0.13
674 0.1
675 0.09
676 0.09
677 0.08
678 0.1
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.09
685 0.07
686 0.07
687 0.08
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.09
694 0.07
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.07
709 0.06
710 0.07
711 0.08
712 0.08
713 0.1
714 0.14
715 0.16
716 0.16
717 0.16
718 0.17
719 0.22
720 0.24
721 0.26
722 0.25
723 0.23
724 0.23
725 0.22
726 0.23
727 0.19
728 0.15
729 0.13
730 0.18
731 0.18
732 0.22
733 0.26
734 0.25
735 0.28
736 0.29
737 0.29
738 0.25
739 0.26
740 0.25
741 0.23
742 0.23
743 0.21
744 0.21
745 0.21
746 0.18
747 0.18
748 0.17
749 0.17
750 0.18
751 0.18
752 0.18
753 0.23
754 0.29
755 0.34
756 0.35
757 0.34
758 0.36
759 0.37
760 0.34
761 0.31
762 0.33
763 0.3
764 0.33
765 0.33
766 0.3
767 0.28
768 0.28
769 0.26
770 0.18
771 0.15
772 0.13
773 0.15
774 0.17
775 0.2
776 0.23
777 0.26
778 0.33
779 0.41
780 0.44
781 0.52
782 0.6
783 0.67
784 0.75
785 0.83
786 0.86
787 0.89
788 0.89
789 0.9
790 0.89
791 0.84
792 0.74
793 0.69
794 0.6
795 0.5
796 0.42
797 0.31
798 0.22
799 0.16
800 0.15
801 0.09
802 0.07
803 0.06
804 0.07
805 0.12
806 0.14
807 0.17
808 0.19
809 0.23