Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SNS8

Protein Details
Accession C9SNS8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-62EPTDEKPSKRKTTTKSPTKSSSKRIKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-46KRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG val:VDBG_06553  -  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MSRVTRASARQAAATSTPKVTSPLSSQARRANIKAEPTDEKPSKRKTTTKSPTKSSSKRIKTEDDDDALPATPAKRVKKDPSEDDSPAAKPKVSPSGASPNALQAKKLKAFDQFSAKSPFPDFAHPTAEEAKLAHRILTLAARRRARGPTRSEAPTLRAPEAIKCGGLAAVKSKVILGILEQAKARYGAYSLDHMFDKTDEEAMRELIGFQGVGPKTASCVLLFCLRRESFAVDTHVWRITGLLGWRPKTASRDETYAHLDVRIPDEDKYGLHILLVKHGKVCDECKAGGKDPGQVSAEKRPSWDKDDGVAGASLSCPTKTTMRTVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.33
3 0.29
4 0.28
5 0.26
6 0.28
7 0.26
8 0.25
9 0.25
10 0.32
11 0.38
12 0.41
13 0.46
14 0.5
15 0.56
16 0.57
17 0.54
18 0.5
19 0.46
20 0.5
21 0.48
22 0.46
23 0.44
24 0.44
25 0.52
26 0.52
27 0.55
28 0.56
29 0.62
30 0.66
31 0.68
32 0.72
33 0.69
34 0.75
35 0.79
36 0.81
37 0.8
38 0.78
39 0.79
40 0.81
41 0.81
42 0.8
43 0.8
44 0.79
45 0.79
46 0.77
47 0.75
48 0.71
49 0.7
50 0.66
51 0.58
52 0.5
53 0.42
54 0.38
55 0.3
56 0.23
57 0.18
58 0.13
59 0.13
60 0.19
61 0.24
62 0.3
63 0.37
64 0.46
65 0.54
66 0.61
67 0.65
68 0.65
69 0.66
70 0.61
71 0.58
72 0.52
73 0.44
74 0.41
75 0.34
76 0.28
77 0.22
78 0.23
79 0.28
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.35
84 0.36
85 0.36
86 0.33
87 0.31
88 0.37
89 0.36
90 0.33
91 0.27
92 0.31
93 0.35
94 0.36
95 0.32
96 0.32
97 0.35
98 0.37
99 0.42
100 0.37
101 0.36
102 0.4
103 0.38
104 0.33
105 0.3
106 0.3
107 0.23
108 0.26
109 0.26
110 0.22
111 0.26
112 0.25
113 0.26
114 0.25
115 0.24
116 0.19
117 0.16
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.17
126 0.2
127 0.22
128 0.28
129 0.3
130 0.31
131 0.34
132 0.4
133 0.41
134 0.43
135 0.42
136 0.43
137 0.46
138 0.48
139 0.47
140 0.41
141 0.39
142 0.37
143 0.33
144 0.27
145 0.24
146 0.22
147 0.21
148 0.23
149 0.19
150 0.14
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.14
172 0.13
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.12
185 0.09
186 0.11
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.09
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.14
205 0.15
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.17
210 0.19
211 0.18
212 0.24
213 0.24
214 0.25
215 0.26
216 0.28
217 0.23
218 0.25
219 0.29
220 0.23
221 0.24
222 0.25
223 0.25
224 0.21
225 0.19
226 0.16
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.17
231 0.21
232 0.22
233 0.24
234 0.25
235 0.28
236 0.29
237 0.33
238 0.33
239 0.32
240 0.34
241 0.34
242 0.36
243 0.38
244 0.37
245 0.31
246 0.25
247 0.24
248 0.21
249 0.23
250 0.22
251 0.19
252 0.17
253 0.19
254 0.19
255 0.17
256 0.21
257 0.19
258 0.16
259 0.15
260 0.18
261 0.16
262 0.24
263 0.27
264 0.23
265 0.24
266 0.25
267 0.27
268 0.27
269 0.3
270 0.28
271 0.29
272 0.3
273 0.35
274 0.39
275 0.38
276 0.41
277 0.4
278 0.4
279 0.37
280 0.41
281 0.35
282 0.33
283 0.35
284 0.39
285 0.44
286 0.37
287 0.4
288 0.42
289 0.46
290 0.49
291 0.51
292 0.43
293 0.4
294 0.43
295 0.4
296 0.34
297 0.29
298 0.23
299 0.17
300 0.16
301 0.14
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.13
306 0.19
307 0.21