Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SLI3

Protein Details
Accession C9SLI3    Localization Confidence High Confidence Score 23.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
416-438EREREKERKKREKEAAKEQKARDBasic
493-515QSPVEKVVKWRRKVKSRFNDDLGHydrophilic
583-610NVRNDGSSRRGQQRRRRRRPAAATAAQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-438LRVSKRKASVAKKPTENKARDKEAKAAEREREKERKKREKEAAKEQKARD
585-603RNDGSSRRGQQRRRRRRPA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG val:VDBG_05660  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MTGEVISLLSSSSPEPALPPAPAAAPHPAKSCSPPPKQPSGLLDLTSSSPVSGPNRDRPSGSQQLPHPKRRSSAVQLDLHFLSDDFDTTGDLGHSSQIRQDAGQNKRLRLSPPDAAKRGFHRSQSAADATERSSARQGPAVRRTQALFDPIECSSSPALGRRPRSSGQTTYDDPFATSSPVRTVSEIVAMAEPRAASPRQPEMAAVAASLGMDVDDPFASSPPPAAKAAPAAAPAGSLQVASTAKSTCASMVTSKTSMAVFSLDDDLSDPFASSQPDAAPLRAATSTAVSLNSKPRSPKGKADWDPISSSAPQLLHDSFDSSPPAVRSKGKEKAPAVIDLSDSELSVLESHKWSDSDSDLPDVKDMDLSKSRAPRSHTAARSRTSSATLRVSKRKASVAKKPTENKARDKEAKAAEREREKERKKREKEAAKEQKARDKETAAAMAEVNKVRTDKKVSTPEMIVDLPASLPPAQLLQAQTLLRDLDVEFGEWQSPVEKVVKWRRKVKSRFNDDLGLWEPMPLRIQDESYGMAVMTADEFVALALGAEGADLLAHVSRMKQHFPSTQLIYLMEGLGPWIRKNRNVRNDGSSRRGQQRRRRRRPAAATAAQEGAAPGSTLTMTRRGRLLELQVLHGALIHHTAAAVETAQWIAIFTQHISTVPYRKQREAANAAGAGFCMESGQVRTGDDTRDTYARMLQEIVRVTAPVCLRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.15
4 0.18
5 0.17
6 0.18
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.2
11 0.24
12 0.27
13 0.29
14 0.32
15 0.34
16 0.35
17 0.4
18 0.48
19 0.49
20 0.53
21 0.6
22 0.63
23 0.7
24 0.71
25 0.71
26 0.66
27 0.63
28 0.58
29 0.49
30 0.42
31 0.34
32 0.32
33 0.28
34 0.22
35 0.15
36 0.13
37 0.16
38 0.19
39 0.26
40 0.31
41 0.39
42 0.46
43 0.47
44 0.5
45 0.51
46 0.56
47 0.58
48 0.55
49 0.51
50 0.52
51 0.62
52 0.68
53 0.72
54 0.7
55 0.65
56 0.65
57 0.65
58 0.66
59 0.64
60 0.65
61 0.63
62 0.63
63 0.6
64 0.61
65 0.54
66 0.46
67 0.37
68 0.27
69 0.2
70 0.14
71 0.13
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.1
81 0.12
82 0.11
83 0.14
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.24
88 0.3
89 0.35
90 0.43
91 0.46
92 0.45
93 0.49
94 0.51
95 0.48
96 0.47
97 0.47
98 0.46
99 0.5
100 0.57
101 0.56
102 0.55
103 0.56
104 0.54
105 0.56
106 0.54
107 0.48
108 0.45
109 0.44
110 0.45
111 0.46
112 0.43
113 0.36
114 0.33
115 0.3
116 0.25
117 0.28
118 0.25
119 0.21
120 0.23
121 0.23
122 0.23
123 0.27
124 0.32
125 0.34
126 0.42
127 0.47
128 0.46
129 0.46
130 0.45
131 0.43
132 0.4
133 0.36
134 0.29
135 0.23
136 0.24
137 0.21
138 0.22
139 0.19
140 0.19
141 0.15
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.24
146 0.29
147 0.35
148 0.36
149 0.42
150 0.43
151 0.48
152 0.5
153 0.48
154 0.47
155 0.47
156 0.46
157 0.43
158 0.42
159 0.35
160 0.3
161 0.25
162 0.2
163 0.17
164 0.15
165 0.14
166 0.14
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.16
172 0.18
173 0.16
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.15
185 0.2
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.21
191 0.19
192 0.15
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.05
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.08
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.11
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.12
246 0.1
247 0.07
248 0.07
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.08
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.11
278 0.17
279 0.19
280 0.21
281 0.23
282 0.28
283 0.35
284 0.38
285 0.44
286 0.45
287 0.54
288 0.55
289 0.6
290 0.57
291 0.52
292 0.49
293 0.42
294 0.36
295 0.25
296 0.22
297 0.17
298 0.14
299 0.12
300 0.13
301 0.12
302 0.11
303 0.11
304 0.14
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.13
312 0.13
313 0.16
314 0.19
315 0.25
316 0.33
317 0.35
318 0.41
319 0.39
320 0.43
321 0.42
322 0.4
323 0.34
324 0.27
325 0.24
326 0.17
327 0.18
328 0.12
329 0.1
330 0.08
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.14
349 0.13
350 0.11
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.14
355 0.15
356 0.18
357 0.23
358 0.25
359 0.27
360 0.31
361 0.32
362 0.36
363 0.43
364 0.46
365 0.49
366 0.52
367 0.5
368 0.49
369 0.47
370 0.4
371 0.35
372 0.31
373 0.26
374 0.28
375 0.32
376 0.34
377 0.39
378 0.41
379 0.41
380 0.41
381 0.44
382 0.46
383 0.46
384 0.51
385 0.53
386 0.57
387 0.61
388 0.64
389 0.66
390 0.67
391 0.66
392 0.65
393 0.63
394 0.64
395 0.64
396 0.61
397 0.6
398 0.57
399 0.57
400 0.54
401 0.52
402 0.49
403 0.48
404 0.5
405 0.5
406 0.53
407 0.55
408 0.59
409 0.66
410 0.71
411 0.71
412 0.77
413 0.8
414 0.79
415 0.8
416 0.82
417 0.83
418 0.81
419 0.82
420 0.75
421 0.73
422 0.67
423 0.63
424 0.54
425 0.45
426 0.38
427 0.32
428 0.32
429 0.24
430 0.21
431 0.17
432 0.16
433 0.17
434 0.16
435 0.14
436 0.12
437 0.13
438 0.14
439 0.17
440 0.22
441 0.23
442 0.3
443 0.39
444 0.4
445 0.42
446 0.42
447 0.39
448 0.36
449 0.32
450 0.23
451 0.15
452 0.12
453 0.09
454 0.08
455 0.09
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.09
462 0.1
463 0.1
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.14
468 0.13
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.09
479 0.09
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.1
484 0.11
485 0.2
486 0.31
487 0.4
488 0.46
489 0.56
490 0.63
491 0.71
492 0.8
493 0.82
494 0.82
495 0.83
496 0.83
497 0.77
498 0.73
499 0.62
500 0.57
501 0.48
502 0.4
503 0.3
504 0.25
505 0.21
506 0.17
507 0.19
508 0.14
509 0.14
510 0.12
511 0.13
512 0.13
513 0.14
514 0.14
515 0.13
516 0.13
517 0.1
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.06
522 0.04
523 0.04
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.02
531 0.03
532 0.02
533 0.02
534 0.02
535 0.02
536 0.02
537 0.02
538 0.03
539 0.03
540 0.04
541 0.04
542 0.05
543 0.12
544 0.15
545 0.19
546 0.22
547 0.27
548 0.31
549 0.36
550 0.41
551 0.39
552 0.39
553 0.36
554 0.33
555 0.29
556 0.25
557 0.2
558 0.14
559 0.1
560 0.08
561 0.1
562 0.1
563 0.11
564 0.18
565 0.21
566 0.28
567 0.38
568 0.48
569 0.56
570 0.61
571 0.64
572 0.66
573 0.72
574 0.71
575 0.68
576 0.64
577 0.61
578 0.65
579 0.69
580 0.7
581 0.72
582 0.77
583 0.82
584 0.87
585 0.9
586 0.9
587 0.92
588 0.92
589 0.92
590 0.91
591 0.86
592 0.79
593 0.7
594 0.62
595 0.51
596 0.4
597 0.3
598 0.2
599 0.13
600 0.09
601 0.06
602 0.05
603 0.06
604 0.07
605 0.09
606 0.17
607 0.19
608 0.21
609 0.24
610 0.25
611 0.27
612 0.31
613 0.34
614 0.33
615 0.33
616 0.34
617 0.32
618 0.3
619 0.27
620 0.24
621 0.19
622 0.12
623 0.12
624 0.1
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.07
629 0.08
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.06
638 0.08
639 0.09
640 0.09
641 0.11
642 0.11
643 0.12
644 0.15
645 0.2
646 0.25
647 0.32
648 0.41
649 0.45
650 0.48
651 0.53
652 0.56
653 0.61
654 0.6
655 0.57
656 0.53
657 0.48
658 0.45
659 0.39
660 0.33
661 0.24
662 0.17
663 0.12
664 0.07
665 0.06
666 0.07
667 0.09
668 0.12
669 0.13
670 0.13
671 0.17
672 0.2
673 0.23
674 0.24
675 0.25
676 0.26
677 0.27
678 0.28
679 0.26
680 0.29
681 0.27
682 0.25
683 0.25
684 0.23
685 0.26
686 0.27
687 0.28
688 0.24
689 0.22
690 0.21
691 0.24
692 0.26