Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S7B0

Protein Details
Accession C9S7B0    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-48NHPTPRPGSSRGKRKGRPRGARTLALBasic
229-257VLVKGAERWRRRSRPPRPHGRTKAQQGLFHydrophilic
273-294QEAFRRLQQRPKKIRAMLNGSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-44PRPGSSRGKRKGRPRGAR
219-251RGALKAKGQEVLVKGAERWRRRSRPPRPHGRTK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, cyto 11, nucl 10, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG val:VDBG_00803  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSGISNQGLIDLPADATPMPGPNHPTPRPGSSRGKRKGRPRGARTLALARSQVQHEAGELFQTAFDDTVDACFHSGFESIDNVAAARRGSRSININDLIFQIRHDTAKVSRLRTFLSWKDVRKNVKDSDDKGGDADLGAGEDPVGGVAAGGPVDDAAKKNKKAKVGLPWEPSSFYPVDVPERDDEEDEEEEEMNFITLQRLRKADERTKAMTKEDPSGRGALKAKGQEVLVKGAERWRRRSRPPRPHGRTKAQQGLFDPPSEGKTPIEPRHVQEAFRRLQQRPKKIRAMLNGSRLPIHTTLNII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.13
6 0.14
7 0.17
8 0.24
9 0.3
10 0.4
11 0.4
12 0.45
13 0.46
14 0.52
15 0.55
16 0.56
17 0.59
18 0.6
19 0.69
20 0.74
21 0.79
22 0.8
23 0.84
24 0.88
25 0.88
26 0.89
27 0.86
28 0.87
29 0.83
30 0.8
31 0.74
32 0.71
33 0.63
34 0.56
35 0.5
36 0.41
37 0.37
38 0.34
39 0.31
40 0.24
41 0.21
42 0.18
43 0.18
44 0.16
45 0.13
46 0.12
47 0.1
48 0.08
49 0.09
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.12
77 0.15
78 0.21
79 0.22
80 0.27
81 0.28
82 0.27
83 0.25
84 0.25
85 0.24
86 0.18
87 0.15
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.21
95 0.25
96 0.26
97 0.28
98 0.29
99 0.31
100 0.31
101 0.35
102 0.3
103 0.35
104 0.37
105 0.37
106 0.43
107 0.47
108 0.51
109 0.5
110 0.53
111 0.48
112 0.51
113 0.53
114 0.48
115 0.49
116 0.45
117 0.4
118 0.34
119 0.3
120 0.21
121 0.16
122 0.13
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.02
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.11
144 0.16
145 0.2
146 0.26
147 0.3
148 0.34
149 0.37
150 0.41
151 0.45
152 0.48
153 0.52
154 0.51
155 0.5
156 0.46
157 0.44
158 0.39
159 0.33
160 0.25
161 0.18
162 0.14
163 0.13
164 0.16
165 0.15
166 0.17
167 0.14
168 0.17
169 0.17
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.13
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.06
184 0.1
185 0.12
186 0.16
187 0.17
188 0.2
189 0.26
190 0.34
191 0.39
192 0.43
193 0.46
194 0.49
195 0.53
196 0.52
197 0.49
198 0.47
199 0.41
200 0.42
201 0.4
202 0.37
203 0.33
204 0.34
205 0.31
206 0.31
207 0.31
208 0.26
209 0.27
210 0.27
211 0.27
212 0.26
213 0.26
214 0.24
215 0.23
216 0.24
217 0.21
218 0.19
219 0.19
220 0.24
221 0.31
222 0.33
223 0.4
224 0.47
225 0.54
226 0.64
227 0.75
228 0.79
229 0.83
230 0.88
231 0.9
232 0.89
233 0.92
234 0.91
235 0.9
236 0.88
237 0.86
238 0.86
239 0.77
240 0.72
241 0.64
242 0.63
243 0.54
244 0.46
245 0.38
246 0.29
247 0.29
248 0.27
249 0.26
250 0.19
251 0.24
252 0.32
253 0.36
254 0.43
255 0.43
256 0.45
257 0.54
258 0.54
259 0.49
260 0.48
261 0.51
262 0.47
263 0.52
264 0.55
265 0.49
266 0.57
267 0.65
268 0.68
269 0.7
270 0.75
271 0.77
272 0.78
273 0.82
274 0.81
275 0.82
276 0.78
277 0.77
278 0.72
279 0.64
280 0.59
281 0.51
282 0.46
283 0.38
284 0.33