Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SSN4

Protein Details
Accession C9SSN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-302AGPVPGRRHREPRPRVRHRHSAGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-250HPAARRGGVLWRGRRQRGRLPR
282-304PGRRHREPRPRVRHRHSAGGRQR
Subcellular Location(s) mito 24, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001017  DH_E1  
IPR029061  THDP-binding  
Gene Ontology GO:0003863  F:3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (2-methylpropanoyl-transferring) activity  
KEGG val:VDBG_07909  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00676  E1_dh  
Amino Acid Sequences MKSRVLRPAARLRSARLASPSTSTPRLTLSARAASSLSQKPNANHVSFPGAVKSAFTHTLKYETPSDYPALSTYRVVDQDGIVVDESFKPDLSDEEVIKLYKDMVYISIMDLIMFDAQRQGRLSFYMVSAGEEALSVGSASVLAPEDVVFCQYREQGVFKQRGFTTSDFMSQLFANAKDPGRGRNMPVHYGSKELNIVSLHLLAVGDAAPAGLGGGVRAQDAAPARPQHPAARRGGVLWRGRRQRGRLPRGAQHGGDAVVSGTLHLPQQRVRHLDADAGPVPGRRHREPRPRVRHRHSAGGRQRLLGGARGDQAARAMHCRDGGRPVLIDVSCQSHSTSDDSFAYRARVEVEDWKRRDNPITRLRKWMEARGIWDEGKEKTCRDETRSEVLKGFREAEAMKKPPMRSMFEDVYEELTPDLKQQMAQLKAHLEKYPEEYDCSEFEGGADSLKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.57
3 0.52
4 0.48
5 0.41
6 0.42
7 0.42
8 0.39
9 0.41
10 0.38
11 0.33
12 0.32
13 0.34
14 0.32
15 0.33
16 0.32
17 0.35
18 0.34
19 0.34
20 0.31
21 0.3
22 0.35
23 0.37
24 0.35
25 0.34
26 0.38
27 0.39
28 0.48
29 0.53
30 0.48
31 0.41
32 0.39
33 0.39
34 0.36
35 0.36
36 0.28
37 0.22
38 0.2
39 0.2
40 0.19
41 0.18
42 0.23
43 0.23
44 0.23
45 0.23
46 0.28
47 0.29
48 0.31
49 0.31
50 0.28
51 0.29
52 0.29
53 0.29
54 0.25
55 0.24
56 0.23
57 0.2
58 0.18
59 0.18
60 0.17
61 0.19
62 0.2
63 0.2
64 0.19
65 0.16
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.15
80 0.17
81 0.16
82 0.18
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.09
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.16
110 0.18
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.19
144 0.26
145 0.32
146 0.3
147 0.36
148 0.34
149 0.35
150 0.36
151 0.32
152 0.28
153 0.22
154 0.24
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.12
162 0.11
163 0.13
164 0.14
165 0.16
166 0.17
167 0.19
168 0.24
169 0.25
170 0.26
171 0.3
172 0.32
173 0.32
174 0.34
175 0.35
176 0.29
177 0.3
178 0.28
179 0.21
180 0.21
181 0.17
182 0.16
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.02
197 0.02
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.15
214 0.17
215 0.21
216 0.26
217 0.3
218 0.29
219 0.3
220 0.29
221 0.28
222 0.3
223 0.31
224 0.31
225 0.32
226 0.37
227 0.41
228 0.46
229 0.5
230 0.52
231 0.54
232 0.59
233 0.62
234 0.63
235 0.61
236 0.61
237 0.64
238 0.62
239 0.52
240 0.42
241 0.35
242 0.27
243 0.22
244 0.16
245 0.09
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.12
255 0.17
256 0.21
257 0.25
258 0.26
259 0.27
260 0.26
261 0.29
262 0.26
263 0.27
264 0.23
265 0.21
266 0.19
267 0.19
268 0.2
269 0.2
270 0.25
271 0.25
272 0.32
273 0.41
274 0.52
275 0.6
276 0.7
277 0.76
278 0.81
279 0.88
280 0.87
281 0.88
282 0.8
283 0.81
284 0.74
285 0.74
286 0.72
287 0.71
288 0.64
289 0.54
290 0.51
291 0.42
292 0.38
293 0.32
294 0.25
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.15
300 0.16
301 0.13
302 0.12
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.18
307 0.19
308 0.19
309 0.22
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.21
315 0.19
316 0.19
317 0.15
318 0.17
319 0.16
320 0.17
321 0.17
322 0.13
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.16
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.15
337 0.24
338 0.32
339 0.39
340 0.41
341 0.47
342 0.47
343 0.49
344 0.56
345 0.53
346 0.54
347 0.55
348 0.63
349 0.61
350 0.68
351 0.68
352 0.68
353 0.65
354 0.63
355 0.61
356 0.53
357 0.55
358 0.5
359 0.51
360 0.42
361 0.4
362 0.35
363 0.3
364 0.32
365 0.29
366 0.25
367 0.28
368 0.35
369 0.38
370 0.41
371 0.45
372 0.45
373 0.53
374 0.57
375 0.54
376 0.51
377 0.5
378 0.48
379 0.43
380 0.4
381 0.3
382 0.28
383 0.27
384 0.29
385 0.34
386 0.34
387 0.38
388 0.41
389 0.42
390 0.46
391 0.51
392 0.5
393 0.47
394 0.52
395 0.5
396 0.46
397 0.48
398 0.42
399 0.4
400 0.34
401 0.28
402 0.2
403 0.17
404 0.15
405 0.14
406 0.16
407 0.12
408 0.13
409 0.18
410 0.26
411 0.3
412 0.31
413 0.32
414 0.38
415 0.42
416 0.44
417 0.42
418 0.36
419 0.34
420 0.4
421 0.43
422 0.37
423 0.36
424 0.36
425 0.36
426 0.34
427 0.35
428 0.28
429 0.22
430 0.2
431 0.2
432 0.17