Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SNK6

Protein Details
Accession C9SNK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-76QVSAPAGPPKKKRGRKPKNRNPEGAPDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-69PAGPPKKKRGRKPKNRN
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 7.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG val:VDBG_06481  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MASPPYASRPRPSPLPIPPTRHCPSRRSAPPTAAPNPLSSGARPRLFPQVSAPAGPPKKKRGRKPKNRNPEGAPDAGTPTPSLVSGRGGTAGGGADGQNGDDGNDDDDDNDMQMGLVGGETRTQEQKQEEIRLRAMLVECFDEDQMNRYENWRAAKLTDNVVKRVVNATVSQSVPPTVTLAIKSVSKYFIGELIEKAISVQGEWMNATGEKQSEVEFPPQNTDPTVRGDINRLSEKDKRGPLRPEHLREAWRQYKMSGESGWVGTQGLWHEQQSDGVERFPVRTGGKRIFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.63
3 0.64
4 0.67
5 0.66
6 0.68
7 0.67
8 0.68
9 0.63
10 0.59
11 0.59
12 0.62
13 0.67
14 0.66
15 0.68
16 0.66
17 0.68
18 0.71
19 0.68
20 0.63
21 0.55
22 0.48
23 0.45
24 0.41
25 0.35
26 0.28
27 0.32
28 0.33
29 0.34
30 0.34
31 0.33
32 0.4
33 0.4
34 0.39
35 0.36
36 0.37
37 0.36
38 0.37
39 0.36
40 0.35
41 0.41
42 0.46
43 0.47
44 0.49
45 0.58
46 0.65
47 0.74
48 0.76
49 0.82
50 0.87
51 0.92
52 0.93
53 0.94
54 0.93
55 0.89
56 0.83
57 0.81
58 0.75
59 0.65
60 0.56
61 0.46
62 0.41
63 0.34
64 0.29
65 0.19
66 0.14
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.06
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.04
107 0.05
108 0.06
109 0.09
110 0.1
111 0.13
112 0.14
113 0.19
114 0.22
115 0.29
116 0.31
117 0.32
118 0.32
119 0.29
120 0.28
121 0.25
122 0.22
123 0.15
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.12
137 0.15
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.21
143 0.21
144 0.24
145 0.27
146 0.26
147 0.26
148 0.28
149 0.27
150 0.22
151 0.22
152 0.17
153 0.13
154 0.12
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.13
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.08
186 0.07
187 0.09
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.14
202 0.2
203 0.22
204 0.22
205 0.26
206 0.27
207 0.27
208 0.26
209 0.26
210 0.21
211 0.23
212 0.26
213 0.23
214 0.23
215 0.26
216 0.28
217 0.32
218 0.35
219 0.32
220 0.33
221 0.37
222 0.43
223 0.46
224 0.51
225 0.51
226 0.54
227 0.6
228 0.63
229 0.67
230 0.71
231 0.7
232 0.69
233 0.69
234 0.65
235 0.63
236 0.65
237 0.63
238 0.58
239 0.52
240 0.46
241 0.47
242 0.46
243 0.44
244 0.34
245 0.29
246 0.27
247 0.27
248 0.27
249 0.2
250 0.17
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.17
259 0.2
260 0.21
261 0.25
262 0.22
263 0.21
264 0.24
265 0.23
266 0.24
267 0.23
268 0.26
269 0.24
270 0.31
271 0.37