Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SXU1

Protein Details
Accession C9SXU1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
454-481GIGTGKKTPPKAPPPRRHAKLRIVETPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
436-474AKRIRPEVPRHRHGLPFAGIGTGKKTPPKAPPPRRHAKL
Subcellular Location(s) nucl 11.5cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, cysk 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
KEGG val:VDBG_09716  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MADYDVYQSLETEQEFFEELDDVVGTQYQSHDLIDETLRSWLYLASMFRDKFCDAEDDIAACAQKLLASQLFVDNRDYVRTQIIFSLLQEDEPNSLYLITCFLLLDGRADEATFTRMVEEACFPRLLELINGRKDRDPRLHRLLLELMYEMSRIERLRTEDLLQIDDGFINYLFQIIEELSNDVHDPYHYPIIRVLLVLNEQYMLSSTNIGTDPLAPSAPLTNRVIKCLSLHGDSFRTFGENIILLLNRETETSQQLLILKLLYLLFTTKATHEYFYTNDLKVLLDVIIRNLMDLPDEKASLRHTYLRVLYPLLAHTQLSHPPHYKRDEVHKVLRILGGFGNSHFAPADETTVRLVERVSKVKWLAAPDEDAAAAASGEAEVARKFLGISLSPSQTASSISVVDVAAVMEKPGVQTPSRRAEAGGEAAAAAGTAAAKRIRPEVPRHRHGLPFAGIGTGKKTPPKAPPPRRHAKLRIVETPPDGGPASDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.16
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.12
29 0.12
30 0.14
31 0.15
32 0.17
33 0.25
34 0.26
35 0.26
36 0.3
37 0.29
38 0.26
39 0.27
40 0.26
41 0.19
42 0.22
43 0.22
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.18
48 0.13
49 0.12
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.19
58 0.21
59 0.22
60 0.24
61 0.22
62 0.22
63 0.24
64 0.24
65 0.2
66 0.23
67 0.22
68 0.21
69 0.2
70 0.22
71 0.19
72 0.18
73 0.22
74 0.16
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.14
107 0.14
108 0.16
109 0.16
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.19
116 0.24
117 0.31
118 0.33
119 0.34
120 0.38
121 0.41
122 0.45
123 0.48
124 0.48
125 0.49
126 0.56
127 0.58
128 0.54
129 0.54
130 0.51
131 0.41
132 0.35
133 0.27
134 0.19
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.12
143 0.16
144 0.2
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.25
149 0.25
150 0.22
151 0.18
152 0.14
153 0.13
154 0.1
155 0.07
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.09
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.19
180 0.19
181 0.18
182 0.15
183 0.09
184 0.1
185 0.1
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.09
206 0.09
207 0.12
208 0.13
209 0.2
210 0.2
211 0.23
212 0.23
213 0.21
214 0.21
215 0.21
216 0.21
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.14
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.18
264 0.2
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.16
269 0.14
270 0.14
271 0.09
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.13
288 0.15
289 0.16
290 0.18
291 0.18
292 0.21
293 0.24
294 0.24
295 0.23
296 0.22
297 0.21
298 0.17
299 0.17
300 0.15
301 0.13
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.17
306 0.19
307 0.23
308 0.26
309 0.29
310 0.35
311 0.38
312 0.39
313 0.38
314 0.45
315 0.51
316 0.52
317 0.56
318 0.56
319 0.53
320 0.51
321 0.49
322 0.39
323 0.31
324 0.25
325 0.19
326 0.14
327 0.12
328 0.14
329 0.12
330 0.13
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.14
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.11
342 0.11
343 0.14
344 0.19
345 0.23
346 0.23
347 0.28
348 0.28
349 0.31
350 0.33
351 0.3
352 0.28
353 0.25
354 0.26
355 0.21
356 0.21
357 0.18
358 0.15
359 0.12
360 0.09
361 0.07
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.07
374 0.1
375 0.1
376 0.15
377 0.19
378 0.21
379 0.21
380 0.22
381 0.21
382 0.18
383 0.19
384 0.15
385 0.12
386 0.11
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.07
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.1
400 0.12
401 0.13
402 0.19
403 0.26
404 0.34
405 0.36
406 0.36
407 0.33
408 0.34
409 0.36
410 0.34
411 0.27
412 0.19
413 0.16
414 0.16
415 0.14
416 0.11
417 0.07
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.06
422 0.08
423 0.1
424 0.12
425 0.18
426 0.23
427 0.29
428 0.4
429 0.49
430 0.57
431 0.63
432 0.67
433 0.67
434 0.66
435 0.63
436 0.59
437 0.51
438 0.43
439 0.37
440 0.34
441 0.3
442 0.25
443 0.26
444 0.23
445 0.24
446 0.27
447 0.31
448 0.35
449 0.44
450 0.54
451 0.62
452 0.69
453 0.76
454 0.81
455 0.87
456 0.89
457 0.89
458 0.87
459 0.86
460 0.85
461 0.82
462 0.82
463 0.76
464 0.74
465 0.66
466 0.61
467 0.5
468 0.43
469 0.36