Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SK03

Protein Details
Accession C9SK03    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-33GDSTLIPPRKQERKRFKPTSRPRPPVPGQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-28RKQERKRFKPTSRPRP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 10.333, cyto 5.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR006590  RNA_pol_Rpb4/RPC9_core  
IPR045222  Rpb4-like  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG val:VDBG_05130  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MADQGDSTLIPPRKQERKRFKPTSRPRPPVPGQEKAEAVLELGEFQEVDTLTLSEASLVINALVTKRRMDRKNVNETEMLTQTLNYLDAFSRFRQKENVEAVERLLSAHKQLAKFERAQIGSLCCETAEEAKTLIPSLQDKITDEDLQELLDEISKLQSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.66
3 0.68
4 0.76
5 0.85
6 0.9
7 0.9
8 0.91
9 0.93
10 0.94
11 0.93
12 0.9
13 0.84
14 0.83
15 0.79
16 0.79
17 0.75
18 0.72
19 0.65
20 0.61
21 0.57
22 0.48
23 0.43
24 0.32
25 0.25
26 0.16
27 0.11
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.05
32 0.04
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.06
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.03
47 0.04
48 0.04
49 0.05
50 0.07
51 0.08
52 0.1
53 0.15
54 0.24
55 0.27
56 0.35
57 0.44
58 0.5
59 0.6
60 0.6
61 0.57
62 0.5
63 0.48
64 0.43
65 0.34
66 0.26
67 0.15
68 0.13
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.07
76 0.09
77 0.1
78 0.19
79 0.19
80 0.21
81 0.25
82 0.26
83 0.31
84 0.35
85 0.38
86 0.32
87 0.32
88 0.31
89 0.27
90 0.25
91 0.19
92 0.15
93 0.1
94 0.09
95 0.13
96 0.15
97 0.15
98 0.19
99 0.24
100 0.27
101 0.28
102 0.31
103 0.34
104 0.31
105 0.32
106 0.3
107 0.27
108 0.25
109 0.24
110 0.2
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.15
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.23
129 0.27
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.21
134 0.2
135 0.18
136 0.15
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.08