Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHH1

Protein Details
Accession C9SHH1    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MMRDSRRRSPTESSRRRRKERRNSRDKIELVSBasic
216-243FTTFFRSPSEQRHRRRQKKKNTRFMSFGHydrophilic
642-665DYARADKDSRRRSHRDSNVKVIDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-25RRRSPTESSRRRRKERRNSR
227-235RHRRRQKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 3, cyto 2.5, plas 1, extr 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
KEGG val:VDBG_04503  -  
Amino Acid Sequences MMRDSRRRSPTESSRRRRKERRNSRDKIELVSAPSASESATRSMEMPGPMPGSMPEDPAPRVTETSRAPPETSSSRSHPQLSSQSQSQSQYQYNHQYHDQAQTPQPQYQSAYQQPLPQQSPYQQQQQQQPQTYQPQQSSFQQYPQQYQQYPQNQYSQQHQSPSQYPAHPQAPYYGETVHSYPNGRARNSDSSSDTSSSLLNVSRRSPKHAKAGNVFTTFFRSPSEQRHRRRQKKKNTRFMSFGANSSSSSLDSDLAYGRGYIPREGGSLASGSRRVSPGPNGKGSQYSQSTRRTPTAELHRPPLSVRGGKAEQAKTDEEILAIGRQLSDIARKQNEADLRASGKVRPSTLVGAAAALSAFSRSRTKDSSKRGIGSSRPGRDDEDSDWESASDDDDSSSSDDADPGLVYGSTANLPSSLGAPASQAAHDGNRNHAVDPSLFGPYNSLRGSVTPIPFTQPSHVYNSPRHQSEEPKADTPSSSSRIGKQPMQHVYAIPTSDPNNFDIDRGSIISSRHTASQSSRPPPVPLQQPIPVAPVSSKVYATEKLADEDGRRELRGERRHTDGGSLAGAAVAGVAAAAIGAAVASSRKDSRDVRDSRDVRDPRDPRGARDSRDYRDYPREDRYQERRSGRTDYPEKTERDDYARADKDSRRRSHRDSNVKVIDERDQTSSRREKDPSYDSQLTRRHTAPVDQRDKSYKLPKGDEIRVEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.89
3 0.94
4 0.94
5 0.95
6 0.95
7 0.95
8 0.95
9 0.95
10 0.93
11 0.9
12 0.89
13 0.81
14 0.75
15 0.7
16 0.62
17 0.55
18 0.5
19 0.41
20 0.31
21 0.29
22 0.24
23 0.18
24 0.16
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.19
31 0.22
32 0.21
33 0.21
34 0.2
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.18
39 0.19
40 0.19
41 0.21
42 0.21
43 0.23
44 0.24
45 0.26
46 0.28
47 0.24
48 0.26
49 0.24
50 0.28
51 0.28
52 0.36
53 0.4
54 0.41
55 0.4
56 0.38
57 0.43
58 0.42
59 0.42
60 0.39
61 0.38
62 0.43
63 0.46
64 0.49
65 0.45
66 0.46
67 0.51
68 0.51
69 0.51
70 0.48
71 0.48
72 0.47
73 0.49
74 0.46
75 0.42
76 0.42
77 0.4
78 0.43
79 0.49
80 0.47
81 0.48
82 0.46
83 0.45
84 0.43
85 0.46
86 0.44
87 0.38
88 0.41
89 0.46
90 0.47
91 0.46
92 0.44
93 0.39
94 0.38
95 0.38
96 0.41
97 0.38
98 0.41
99 0.4
100 0.44
101 0.46
102 0.5
103 0.48
104 0.42
105 0.4
106 0.38
107 0.46
108 0.45
109 0.5
110 0.48
111 0.52
112 0.59
113 0.66
114 0.69
115 0.65
116 0.63
117 0.6
118 0.64
119 0.65
120 0.61
121 0.54
122 0.5
123 0.48
124 0.51
125 0.53
126 0.46
127 0.44
128 0.45
129 0.44
130 0.46
131 0.5
132 0.5
133 0.43
134 0.46
135 0.5
136 0.52
137 0.55
138 0.52
139 0.52
140 0.49
141 0.5
142 0.54
143 0.54
144 0.48
145 0.47
146 0.46
147 0.44
148 0.44
149 0.46
150 0.44
151 0.37
152 0.37
153 0.4
154 0.41
155 0.37
156 0.33
157 0.33
158 0.3
159 0.29
160 0.27
161 0.21
162 0.18
163 0.2
164 0.21
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.26
170 0.29
171 0.28
172 0.29
173 0.33
174 0.39
175 0.41
176 0.41
177 0.38
178 0.36
179 0.39
180 0.38
181 0.32
182 0.24
183 0.21
184 0.18
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.19
190 0.27
191 0.29
192 0.37
193 0.43
194 0.45
195 0.53
196 0.56
197 0.58
198 0.56
199 0.63
200 0.61
201 0.56
202 0.51
203 0.42
204 0.43
205 0.37
206 0.3
207 0.24
208 0.22
209 0.23
210 0.32
211 0.43
212 0.46
213 0.53
214 0.64
215 0.74
216 0.81
217 0.89
218 0.89
219 0.89
220 0.91
221 0.94
222 0.94
223 0.9
224 0.85
225 0.78
226 0.7
227 0.68
228 0.58
229 0.49
230 0.41
231 0.34
232 0.28
233 0.25
234 0.23
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.09
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.14
264 0.2
265 0.28
266 0.31
267 0.35
268 0.34
269 0.34
270 0.36
271 0.35
272 0.33
273 0.29
274 0.28
275 0.3
276 0.35
277 0.38
278 0.38
279 0.4
280 0.37
281 0.34
282 0.38
283 0.43
284 0.45
285 0.43
286 0.45
287 0.43
288 0.41
289 0.4
290 0.38
291 0.32
292 0.25
293 0.23
294 0.24
295 0.24
296 0.27
297 0.33
298 0.29
299 0.26
300 0.27
301 0.27
302 0.22
303 0.22
304 0.19
305 0.12
306 0.11
307 0.1
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.08
316 0.11
317 0.16
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.21
322 0.23
323 0.22
324 0.2
325 0.17
326 0.18
327 0.19
328 0.19
329 0.17
330 0.18
331 0.18
332 0.17
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.05
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.05
348 0.08
349 0.09
350 0.12
351 0.17
352 0.23
353 0.3
354 0.38
355 0.46
356 0.47
357 0.48
358 0.47
359 0.46
360 0.42
361 0.44
362 0.44
363 0.39
364 0.37
365 0.36
366 0.36
367 0.34
368 0.34
369 0.26
370 0.26
371 0.23
372 0.21
373 0.2
374 0.18
375 0.17
376 0.14
377 0.13
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.12
415 0.12
416 0.15
417 0.19
418 0.2
419 0.2
420 0.2
421 0.2
422 0.17
423 0.18
424 0.16
425 0.13
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.12
430 0.16
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.12
435 0.18
436 0.2
437 0.21
438 0.18
439 0.19
440 0.21
441 0.22
442 0.23
443 0.21
444 0.2
445 0.21
446 0.26
447 0.3
448 0.31
449 0.35
450 0.42
451 0.44
452 0.42
453 0.44
454 0.4
455 0.43
456 0.46
457 0.49
458 0.45
459 0.42
460 0.42
461 0.38
462 0.36
463 0.32
464 0.3
465 0.25
466 0.25
467 0.24
468 0.28
469 0.34
470 0.37
471 0.38
472 0.37
473 0.42
474 0.43
475 0.45
476 0.41
477 0.35
478 0.34
479 0.32
480 0.28
481 0.2
482 0.17
483 0.16
484 0.18
485 0.19
486 0.17
487 0.18
488 0.18
489 0.18
490 0.17
491 0.16
492 0.14
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.12
497 0.15
498 0.15
499 0.16
500 0.17
501 0.18
502 0.19
503 0.21
504 0.3
505 0.35
506 0.38
507 0.42
508 0.41
509 0.43
510 0.45
511 0.48
512 0.46
513 0.42
514 0.42
515 0.41
516 0.42
517 0.4
518 0.39
519 0.31
520 0.24
521 0.21
522 0.2
523 0.19
524 0.18
525 0.17
526 0.16
527 0.19
528 0.21
529 0.22
530 0.23
531 0.21
532 0.21
533 0.23
534 0.23
535 0.21
536 0.22
537 0.26
538 0.23
539 0.22
540 0.22
541 0.26
542 0.34
543 0.41
544 0.45
545 0.43
546 0.48
547 0.51
548 0.5
549 0.46
550 0.39
551 0.31
552 0.24
553 0.21
554 0.14
555 0.1
556 0.1
557 0.07
558 0.05
559 0.03
560 0.02
561 0.02
562 0.02
563 0.01
564 0.01
565 0.01
566 0.01
567 0.01
568 0.01
569 0.01
570 0.02
571 0.03
572 0.04
573 0.07
574 0.09
575 0.11
576 0.17
577 0.21
578 0.29
579 0.38
580 0.43
581 0.48
582 0.57
583 0.58
584 0.57
585 0.63
586 0.6
587 0.55
588 0.61
589 0.56
590 0.52
591 0.6
592 0.57
593 0.52
594 0.59
595 0.59
596 0.53
597 0.6
598 0.61
599 0.55
600 0.62
601 0.59
602 0.56
603 0.6
604 0.62
605 0.57
606 0.58
607 0.6
608 0.57
609 0.64
610 0.67
611 0.65
612 0.69
613 0.7
614 0.68
615 0.64
616 0.66
617 0.61
618 0.62
619 0.62
620 0.57
621 0.58
622 0.6
623 0.58
624 0.57
625 0.57
626 0.5
627 0.48
628 0.48
629 0.44
630 0.47
631 0.49
632 0.46
633 0.48
634 0.51
635 0.55
636 0.61
637 0.66
638 0.65
639 0.69
640 0.74
641 0.79
642 0.83
643 0.84
644 0.81
645 0.82
646 0.8
647 0.75
648 0.69
649 0.61
650 0.58
651 0.51
652 0.46
653 0.41
654 0.38
655 0.37
656 0.44
657 0.5
658 0.47
659 0.5
660 0.51
661 0.5
662 0.55
663 0.6
664 0.59
665 0.6
666 0.63
667 0.58
668 0.63
669 0.65
670 0.61
671 0.6
672 0.53
673 0.5
674 0.44
675 0.51
676 0.52
677 0.57
678 0.61
679 0.58
680 0.63
681 0.64
682 0.65
683 0.64
684 0.64
685 0.6
686 0.59
687 0.62
688 0.65
689 0.67
690 0.71