FuNGI

C9SH50

Protein Details

Accession

C9SH50

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
79-105	GAPALKRQTIQGRKRRREGRRDDAVRT	Basic
1014-1033	APNAFRRKFRKSQVAKLFLP	Hydrophilic
1155-1177	DTPTASSGSKRKRTARAATRTSL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-99	GRKRRREGRR
1198-1209	TRGRGKRTKADR

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036279 5-3_exonuclease_C_sf IPR008918 HhH2 IPR029060 PIN-like_dom_sf IPR003903 UIM_dom IPR006086 XPG-I_dom IPR006084 XPG/Rad2 IPR001044 XPG/Rad2_eukaryotes IPR019974 XPG_CS IPR006085 XPG_DNA_repair_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004519 F:endonuclease activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
KEGG	val:VDBG_03753 -
Pfam	View protein in Pfam PF02809 UIM PF00867 XPG_I PF00752 XPG_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00841 XPG_1 PS00842 XPG_2
CDD	cd09904 H3TH_XPG cd09868 PIN_XPG_RAD2

Amino Acid Sequences

MGVNGLWTVLQPCARPTNLATLNRKRLAVDASIWIYQFLKAVRDKEGNALRNSHVVGFFRRICKLLWFGIRPVFVFDGGAPALKRQTIQGRKRRREGRRDDAVRTAGKLLAVQMQRIAEEQDEKRKRELERGVDERARQAEMAEEEAVPNADQLVYVGEVGMSQQERQQTRTFRKQDQYHLPKLDGDISSMARADDPRIMSVEELEEYARQFNNGEDLNLYDFSKIDFNGEFFKSLPPPDRYNILNAARLRSRLRMGLSKEQLEEMFPNRMDFSRFQIERVKERNNLTQLLMKEVGMTGLDLTINGGGRIAGERDREYILVKNDGVEGGWALGVVSKEKDIGEAHKPIDIDALEFKYQQKDEEPEMEEEEEFEDVPVQGLNRLPKLSHGTEGQTMDEDDSLFVGGDKALKLSTKPQEQNSEDLHPEEEDDINQAIALSLQSQHVANSDTPEVEDVFEDVELVVPQWEQKAVPQNKPIASSSGRMVAHIVNNRASAAVPKRRQSNASSSDSDNDLQAALAASRKNRKAQPKAVPGNIKNPFGGPLPFPKLDIGTAFESDVRGGDEPLMGDLDDMAGGFRSQKPDPNAPKPLPPWMTDNTDIRDTMLKAKEVEQEINAEDREAAAEEEMMFQRKRQNETIEIASSDDGSDVEVLEVAPAPKKMASPAEISSTPSSLAQESSEKAEVTETQTVPGGNSSGAPSADEANEPVPTITLGGVAISSKSSVSPEPEFEDIEIPEQEDEHDVTVRELSNTPESVVPVADISTADKEPDTTGVAHQADFEEALAQTAQPADENAEDNYNPFGDSDVDEYSDPEDEELFASLAQEADEHARFASELNHKSEQENREAYERELKALRTQQKKDRRDADEVTQVMVGECQALLRLFGIPYITAPMEAEAQCAELVRLGLVDGIVTDDSDTFLFGGTRVYKNMFNSNKLVECYLSSDLDKELSLSREQLVSIALLLGSDYTDGLPGVGPVTAVEILSEFPESEGGLAAFCHWWADVQGQRRPKEDDAPNAFRRKFRKSQVAKLFLPVGFPNPAVREAYMKPEVDDSPETFQWGVPNLEGLRQYLMATIGWSEERTDEVLVPVIRDMNRRDVEGTQSNITRYFEGGVGTGAKESFAPRQKQKASKRMAEAVNKLRNTGASVSESSPTTDTPTASSGSKRKRTARAATRTSLVDEEPGTGEDDDEAEAAVPRTRGRGKRTKADR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.28
3	0.28
4	0.36
5	0.41
6	0.49
7	0.54
8	0.58
9	0.67
10	0.68
11	0.67
12	0.57
13	0.53
14	0.49
15	0.43
16	0.35
17	0.32
18	0.32
19	0.33
20	0.32
21	0.29
22	0.26
23	0.22
24	0.22
25	0.17
26	0.2
27	0.24
28	0.26
29	0.32
30	0.36
31	0.37
32	0.43
33	0.51
34	0.51
35	0.49
36	0.51
37	0.45
38	0.45
39	0.45
40	0.39
41	0.33
42	0.29
43	0.31
44	0.34
45	0.38
46	0.38
47	0.39
48	0.38
49	0.36
50	0.38
51	0.39
52	0.38
53	0.41
54	0.4
55	0.42
56	0.46
57	0.47
58	0.41
59	0.41
60	0.34
61	0.26
62	0.23
63	0.19
64	0.17
65	0.16
66	0.18
67	0.14
68	0.15
69	0.17
70	0.17
71	0.18
72	0.2
73	0.3
74	0.38
75	0.49
76	0.57
77	0.66
78	0.74
79	0.84
80	0.89
81	0.88
82	0.89
83	0.89
84	0.89
85	0.89
86	0.85
87	0.8
88	0.77
89	0.72
90	0.63
91	0.55
92	0.47
93	0.37
94	0.31
95	0.27
96	0.21
97	0.23
98	0.22
99	0.21
100	0.21
101	0.21
102	0.21
103	0.21
104	0.21
105	0.15
106	0.22
107	0.25
108	0.34
109	0.41
110	0.43
111	0.47
112	0.51
113	0.51
114	0.54
115	0.58
116	0.56
117	0.59
118	0.61
119	0.64
120	0.63
121	0.62
122	0.58
123	0.51
124	0.43
125	0.33
126	0.28
127	0.25
128	0.22
129	0.23
130	0.19
131	0.17
132	0.16
133	0.16
134	0.17
135	0.12
136	0.1
137	0.08
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.07
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.12
152	0.19
153	0.21
154	0.25
155	0.32
156	0.38
157	0.47
158	0.57
159	0.61
160	0.63
161	0.71
162	0.74
163	0.77
164	0.79
165	0.78
166	0.76
167	0.73
168	0.65
169	0.57
170	0.52
171	0.48
172	0.37
173	0.3
174	0.24
175	0.21
176	0.21
177	0.19
178	0.18
179	0.14
180	0.14
181	0.14
182	0.16
183	0.16
184	0.17
185	0.18
186	0.18
187	0.17
188	0.17
189	0.16
190	0.12
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.11
195	0.14
196	0.13
197	0.12
198	0.12
199	0.11
200	0.16
201	0.16
202	0.15
203	0.13
204	0.14
205	0.16
206	0.17
207	0.17
208	0.12
209	0.12
210	0.12
211	0.14
212	0.12
213	0.12
214	0.12
215	0.13
216	0.17
217	0.18
218	0.18
219	0.17
220	0.2
221	0.2
222	0.23
223	0.29
224	0.29
225	0.32
226	0.33
227	0.36
228	0.34
229	0.36
230	0.41
231	0.36
232	0.38
233	0.35
234	0.38
235	0.36
236	0.39
237	0.37
238	0.33
239	0.33
240	0.31
241	0.34
242	0.36
243	0.4
244	0.46
245	0.48
246	0.47
247	0.45
248	0.43
249	0.39
250	0.33
251	0.29
252	0.22
253	0.22
254	0.19
255	0.2
256	0.2
257	0.2
258	0.22
259	0.21
260	0.24
261	0.29
262	0.29
263	0.31
264	0.38
265	0.41
266	0.46
267	0.51
268	0.51
269	0.47
270	0.51
271	0.57
272	0.53
273	0.51
274	0.44
275	0.43
276	0.37
277	0.36
278	0.32
279	0.24
280	0.21
281	0.18
282	0.17
283	0.11
284	0.11
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.09
299	0.12
300	0.13
301	0.15
302	0.16
303	0.17
304	0.18
305	0.21
306	0.21
307	0.21
308	0.2
309	0.19
310	0.18
311	0.18
312	0.16
313	0.11
314	0.09
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.1
327	0.1
328	0.14
329	0.18
330	0.22
331	0.22
332	0.23
333	0.23
334	0.21
335	0.23
336	0.19
337	0.15
338	0.14
339	0.16
340	0.15
341	0.16
342	0.18
343	0.2
344	0.2
345	0.2
346	0.21
347	0.22
348	0.24
349	0.28
350	0.29
351	0.26
352	0.27
353	0.27
354	0.23
355	0.19
356	0.17
357	0.12
358	0.09
359	0.08
360	0.07
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.07
366	0.09
367	0.12
368	0.13
369	0.14
370	0.14
371	0.17
372	0.23
373	0.23
374	0.23
375	0.22
376	0.23
377	0.26
378	0.27
379	0.24
380	0.18
381	0.17
382	0.15
383	0.13
384	0.11
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.08
398	0.15
399	0.22
400	0.29
401	0.34
402	0.38
403	0.46
404	0.47
405	0.51
406	0.47
407	0.44
408	0.36
409	0.33
410	0.29
411	0.2
412	0.19
413	0.16
414	0.12
415	0.09
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.07
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.04
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.09
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.1
439	0.09
440	0.08
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.05
455	0.08
456	0.19
457	0.24
458	0.28
459	0.32
460	0.37
461	0.38
462	0.4
463	0.38
464	0.32
465	0.28
466	0.26
467	0.22
468	0.24
469	0.22
470	0.2
471	0.2
472	0.18
473	0.2
474	0.22
475	0.23
476	0.18
477	0.18
478	0.18
479	0.17
480	0.15
481	0.16
482	0.19
483	0.26
484	0.29
485	0.33
486	0.39
487	0.4
488	0.43
489	0.42
490	0.45
491	0.42
492	0.44
493	0.43
494	0.38
495	0.38
496	0.36
497	0.33
498	0.24
499	0.17
500	0.11
501	0.08
502	0.07
503	0.06
504	0.04
505	0.06
506	0.07
507	0.1
508	0.17
509	0.2
510	0.25
511	0.31
512	0.41
513	0.47
514	0.55
515	0.62
516	0.66
517	0.69
518	0.69
519	0.7
520	0.62
521	0.63
522	0.58
523	0.49
524	0.39
525	0.34
526	0.3
527	0.23
528	0.23
529	0.15
530	0.16
531	0.19
532	0.19
533	0.2
534	0.18
535	0.18
536	0.17
537	0.16
538	0.14
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.09
545	0.09
546	0.07
547	0.06
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.05
552	0.06
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.03
561	0.02
562	0.03
563	0.04
564	0.05
565	0.09
566	0.1
567	0.15
568	0.19
569	0.28
570	0.35
571	0.4
572	0.46
573	0.44
574	0.48
575	0.44
576	0.47
577	0.4
578	0.35
579	0.33
580	0.29
581	0.32
582	0.29
583	0.3
584	0.26
585	0.24
586	0.23
587	0.2
588	0.18
589	0.15
590	0.19
591	0.18
592	0.17
593	0.16
594	0.19
595	0.22
596	0.22
597	0.22
598	0.16
599	0.16
600	0.16
601	0.17
602	0.14
603	0.1
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.05
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.06
613	0.06
614	0.09
615	0.08
616	0.09
617	0.15
618	0.18
619	0.22
620	0.25
621	0.28
622	0.29
623	0.32
624	0.33
625	0.29
626	0.26
627	0.22
628	0.18
629	0.15
630	0.11
631	0.08
632	0.05
633	0.05
634	0.04
635	0.04
636	0.03
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.04
641	0.04
642	0.05
643	0.05
644	0.06
645	0.06
646	0.07
647	0.09
648	0.1
649	0.12
650	0.14
651	0.15
652	0.18
653	0.18
654	0.2
655	0.19
656	0.17
657	0.15
658	0.13
659	0.12
660	0.09
661	0.09
662	0.08
663	0.09
664	0.09
665	0.11
666	0.12
667	0.11
668	0.11
669	0.11
670	0.11
671	0.13
672	0.18
673	0.15
674	0.15
675	0.15
676	0.15
677	0.15
678	0.14
679	0.11
680	0.06
681	0.06
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.08
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.07
695	0.06
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.06
710	0.07
711	0.1
712	0.12
713	0.13
714	0.16
715	0.17
716	0.17
717	0.16
718	0.17
719	0.13
720	0.13
721	0.12
722	0.09
723	0.08
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.08
728	0.07
729	0.08
730	0.07
731	0.08
732	0.09
733	0.09
734	0.09
735	0.1
736	0.11
737	0.13
738	0.13
739	0.14
740	0.13
741	0.13
742	0.12
743	0.11
744	0.09
745	0.07
746	0.06
747	0.06
748	0.05
749	0.06
750	0.08
751	0.08
752	0.08
753	0.08
754	0.08
755	0.08
756	0.09
757	0.1
758	0.08
759	0.09
760	0.14
761	0.15
762	0.14
763	0.14
764	0.13
765	0.12
766	0.11
767	0.11
768	0.06
769	0.05
770	0.06
771	0.06
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.05
776	0.04
777	0.05
778	0.06
779	0.07
780	0.08
781	0.08
782	0.1
783	0.1
784	0.11
785	0.11
786	0.1
787	0.09
788	0.08
789	0.08
790	0.07
791	0.08
792	0.1
793	0.09
794	0.1
795	0.1
796	0.11
797	0.11
798	0.1
799	0.09
800	0.07
801	0.07
802	0.06
803	0.07
804	0.07
805	0.06
806	0.05
807	0.06
808	0.06
809	0.05
810	0.05
811	0.04
812	0.05
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.08
817	0.08
818	0.08
819	0.09
820	0.15
821	0.19
822	0.22
823	0.28
824	0.31
825	0.32
826	0.34
827	0.41
828	0.37
829	0.36
830	0.35
831	0.31
832	0.32
833	0.32
834	0.33
835	0.35
836	0.32
837	0.28
838	0.29
839	0.28
840	0.29
841	0.36
842	0.43
843	0.43
844	0.5
845	0.56
846	0.64
847	0.7
848	0.73
849	0.74
850	0.71
851	0.68
852	0.66
853	0.62
854	0.59
855	0.53
856	0.45
857	0.36
858	0.31
859	0.23
860	0.19
861	0.14
862	0.06
863	0.05
864	0.04
865	0.05
866	0.05
867	0.05
868	0.05
869	0.07
870	0.06
871	0.07
872	0.07
873	0.06
874	0.07
875	0.09
876	0.09
877	0.08
878	0.08
879	0.08
880	0.12
881	0.12
882	0.12
883	0.09
884	0.1
885	0.1
886	0.1
887	0.09
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.05
892	0.05
893	0.05
894	0.05
895	0.04
896	0.03
897	0.05
898	0.04
899	0.04
900	0.05
901	0.05
902	0.06
903	0.06
904	0.06
905	0.05
906	0.05
907	0.05
908	0.05
909	0.09
910	0.12
911	0.13
912	0.15
913	0.18
914	0.2
915	0.23
916	0.33
917	0.33
918	0.33
919	0.35
920	0.37
921	0.37
922	0.35
923	0.34
924	0.25
925	0.22
926	0.22
927	0.21
928	0.19
929	0.16
930	0.16
931	0.16
932	0.16
933	0.15
934	0.12
935	0.12
936	0.13
937	0.14
938	0.14
939	0.15
940	0.15
941	0.15
942	0.14
943	0.12
944	0.09
945	0.08
946	0.07
947	0.06
948	0.05
949	0.05
950	0.04
951	0.04
952	0.04
953	0.04
954	0.04
955	0.04
956	0.04
957	0.05
958	0.05
959	0.05
960	0.05
961	0.05
962	0.05
963	0.04
964	0.07
965	0.07
966	0.06
967	0.06
968	0.06
969	0.07
970	0.07
971	0.08
972	0.06
973	0.06
974	0.06
975	0.06
976	0.06
977	0.07
978	0.06
979	0.05
980	0.05
981	0.06
982	0.06
983	0.06
984	0.06
985	0.06
986	0.06
987	0.07
988	0.13
989	0.17
990	0.24
991	0.3
992	0.37
993	0.4
994	0.44
995	0.48
996	0.46
997	0.51
998	0.5
999	0.54
1000	0.56
1001	0.62
1002	0.65
1003	0.68
1004	0.67
1005	0.63
1006	0.63
1007	0.62
1008	0.62
1009	0.62
1010	0.67
1011	0.66
1012	0.74
1013	0.79
1014	0.81
1015	0.73
1016	0.68
1017	0.63
1018	0.52
1019	0.47
1020	0.37
1021	0.3
1022	0.24
1023	0.23
1024	0.22
1025	0.19
1026	0.21
1027	0.2
1028	0.2
1029	0.21
1030	0.21
1031	0.27
1032	0.29
1033	0.28
1034	0.27
1035	0.29
1036	0.28
1037	0.29
1038	0.3
1039	0.26
1040	0.27
1041	0.26
1042	0.27
1043	0.24
1044	0.24
1045	0.22
1046	0.22
1047	0.21
1048	0.15
1049	0.19
1050	0.17
1051	0.2
1052	0.2
1053	0.19
1054	0.18
1055	0.17
1056	0.17
1057	0.14
1058	0.15
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.1
1067	0.11
1068	0.12
1069	0.13
1070	0.12
1071	0.12
1072	0.17
1073	0.16
1074	0.16
1075	0.15
1076	0.18
1077	0.19
1078	0.23
1079	0.26
1080	0.31
1081	0.32
1082	0.33
1083	0.35
1084	0.33
1085	0.38
1086	0.39
1087	0.4
1088	0.35
1089	0.36
1090	0.35
1091	0.36
1092	0.35
1093	0.29
1094	0.24
1095	0.22
1096	0.18
1097	0.16
1098	0.15
1099	0.14
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.13
1103	0.11
1104	0.1
1105	0.1
1106	0.13
1107	0.2
1108	0.27
1109	0.35
1110	0.42
1111	0.52
1112	0.61
1113	0.7
1114	0.78
1115	0.79
1116	0.8
1117	0.8
1118	0.79
1119	0.78
1120	0.77
1121	0.75
1122	0.74
1123	0.74
1124	0.73
1125	0.65
1126	0.59
1127	0.52
1128	0.45
1129	0.4
1130	0.34
1131	0.27
1132	0.23
1133	0.25
1134	0.26
1135	0.27
1136	0.27
1137	0.25
1138	0.24
1139	0.21
1140	0.23
1141	0.22
1142	0.2
1143	0.2
1144	0.22
1145	0.22
1146	0.23
1147	0.29
1148	0.33
1149	0.41
1150	0.5
1151	0.56
1152	0.62
1153	0.7
1154	0.77
1155	0.81
1156	0.82
1157	0.83
1158	0.81
1159	0.77
1160	0.73
1161	0.65
1162	0.58
1163	0.5
1164	0.4
1165	0.32
1166	0.25
1167	0.23
1168	0.2
1169	0.19
1170	0.18
1171	0.16
1172	0.15
1173	0.13
1174	0.13
1175	0.11
1176	0.1
1177	0.09
1178	0.07
1179	0.09
1180	0.1
1181	0.12
1182	0.12
1183	0.13
1184	0.2
1185	0.29
1186	0.35
1187	0.43
1188	0.53
1189	0.59

C9SH50

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer