Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SFJ4

Protein Details
Accession C9SFJ4    Localization Confidence Low Confidence Score 7.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-329FSSTCSPSSPRCRRNPCSSNMCWQSCKRTTRQRLQHGAATRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 10, nucl 6, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR013949  Utp6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG val:VDBG_03436  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08640  U3_assoc_6  
Amino Acid Sequences MAAAELFQLRKVVDQDQDGGCCRESSILLGEEEIRNIVQRRSDFEHRALAPGVQPTDFTNYVAWEISLDALRVKRCERLKIRHVASQHATQARVLAIYERAVTKRPASKELWLDYLTYTERIRATKRWRRTMTRALRLMPRDAELWVLAGRRAAKNGDMGTARGYFMRGCRFCTVDGGLWIEYARCEMEWLAKMERNRKDSKKGGRVGPLAGEQVAEGDAIMFNVGEDDLNDEDEGTAIMPEPEAEEPVFDEKPPVRWSATQPWMVRYQWLFSTLQGNNRSSTTQPPSFSSTCSPSSPRCRRNPCSSNMCWQSCKRTTRQRLQHGAATRAFRWWASILTRPTFPAVFEKPCPDSRSVWKQHQSLPC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.31
3 0.32
4 0.35
5 0.34
6 0.33
7 0.29
8 0.25
9 0.23
10 0.19
11 0.17
12 0.16
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.2
18 0.19
19 0.19
20 0.17
21 0.13
22 0.15
23 0.17
24 0.19
25 0.22
26 0.23
27 0.28
28 0.35
29 0.44
30 0.45
31 0.46
32 0.51
33 0.46
34 0.48
35 0.42
36 0.36
37 0.3
38 0.3
39 0.28
40 0.2
41 0.19
42 0.18
43 0.23
44 0.22
45 0.21
46 0.17
47 0.17
48 0.18
49 0.17
50 0.15
51 0.09
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.13
58 0.16
59 0.19
60 0.2
61 0.26
62 0.3
63 0.4
64 0.46
65 0.53
66 0.59
67 0.66
68 0.68
69 0.66
70 0.63
71 0.6
72 0.55
73 0.51
74 0.48
75 0.41
76 0.38
77 0.34
78 0.33
79 0.26
80 0.22
81 0.17
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.15
89 0.17
90 0.21
91 0.26
92 0.29
93 0.33
94 0.33
95 0.38
96 0.42
97 0.43
98 0.41
99 0.35
100 0.32
101 0.27
102 0.27
103 0.22
104 0.18
105 0.15
106 0.14
107 0.16
108 0.18
109 0.21
110 0.26
111 0.36
112 0.43
113 0.53
114 0.6
115 0.65
116 0.7
117 0.75
118 0.78
119 0.78
120 0.78
121 0.72
122 0.65
123 0.65
124 0.59
125 0.53
126 0.44
127 0.35
128 0.26
129 0.22
130 0.2
131 0.13
132 0.12
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.14
150 0.11
151 0.11
152 0.09
153 0.11
154 0.19
155 0.18
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.22
162 0.15
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.07
176 0.09
177 0.12
178 0.13
179 0.15
180 0.18
181 0.26
182 0.31
183 0.34
184 0.4
185 0.42
186 0.48
187 0.54
188 0.61
189 0.62
190 0.63
191 0.61
192 0.6
193 0.58
194 0.5
195 0.44
196 0.35
197 0.26
198 0.21
199 0.16
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.05
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.04
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.13
239 0.13
240 0.18
241 0.2
242 0.21
243 0.2
244 0.23
245 0.29
246 0.35
247 0.41
248 0.43
249 0.42
250 0.43
251 0.45
252 0.42
253 0.41
254 0.32
255 0.28
256 0.22
257 0.24
258 0.22
259 0.18
260 0.26
261 0.24
262 0.3
263 0.32
264 0.33
265 0.31
266 0.32
267 0.33
268 0.26
269 0.32
270 0.32
271 0.32
272 0.32
273 0.34
274 0.4
275 0.39
276 0.4
277 0.36
278 0.33
279 0.32
280 0.33
281 0.34
282 0.35
283 0.46
284 0.54
285 0.59
286 0.64
287 0.71
288 0.76
289 0.83
290 0.83
291 0.8
292 0.79
293 0.73
294 0.73
295 0.72
296 0.69
297 0.64
298 0.61
299 0.62
300 0.61
301 0.64
302 0.63
303 0.65
304 0.71
305 0.76
306 0.82
307 0.83
308 0.84
309 0.82
310 0.8
311 0.75
312 0.71
313 0.65
314 0.59
315 0.49
316 0.43
317 0.39
318 0.32
319 0.29
320 0.25
321 0.24
322 0.24
323 0.31
324 0.33
325 0.36
326 0.37
327 0.35
328 0.37
329 0.33
330 0.31
331 0.31
332 0.31
333 0.33
334 0.36
335 0.4
336 0.42
337 0.48
338 0.5
339 0.46
340 0.46
341 0.5
342 0.57
343 0.59
344 0.64
345 0.67
346 0.68