Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SMH1

Protein Details
Accession C9SMH1    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-44NTTAILGKRHDRHRTQRGAVRHREHBasic
95-116PRMPAFEKRARHKTRHDKYDLHBasic
121-147KIVSKSKAEKIKRPSRRRETNNRMLLAHydrophilic
197-227SHEHRPAKKRIPSRSRDRKHKKRGRELDEASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-138KRARHKTRHDKYDLHASPPKIVSKSKAEKIKRPSRRR
200-221HRPAKKRIPSRSRDRKHKKRGR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
KEGG val:VDBG_06095  -  
Amino Acid Sequences MDGNEFVELWLQRVNDRSRNTTAILGKRHDRHRTQRGAVRHREHLAGGAACDTIGQDQKHSWVDDNPLAPNQHAPQAPIRDRVDTANGSLEDDSPRMPAFEKRARHKTRHDKYDLHASPPKIVSKSKAEKIKRPSRRRETNNRMLLASREVMEKFAPEAVHNSRVTLQPANTPGLFYNGRHATQKNLGHGSMEIASSHEHRPAKKRIPSRSRDRKHKKRGRELDEASDIFRRPVLQGDRQQVQGMSNIVKDQEISGYRLGEVIRDQPENRFLFPPENIREDRPSTGQNTSYYTWSTSDMSRGRRPDQQSHELGRVCQESLTPDHVQQALQESGVLEGTGVGKRGCQVQNPQQIGALRSGNLPREVEGHVAGHDTLNHSRPITAIIHYEDKGVMARESSLDREARMDHSVASEEMHEKAFKGEVSRDEIAKQIYLKSPAPKSPLPFSPAPPRPQRTISLEETPERCFQRVDEDHISRPLTAPVGSTPSDRVVRLPKECPAVQVTKSPADTQIQSQPDTGRTKTTRTRDVATKNGSAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.35
3 0.4
4 0.45
5 0.47
6 0.5
7 0.5
8 0.5
9 0.5
10 0.5
11 0.52
12 0.51
13 0.54
14 0.59
15 0.66
16 0.69
17 0.71
18 0.74
19 0.78
20 0.82
21 0.82
22 0.81
23 0.82
24 0.83
25 0.84
26 0.79
27 0.76
28 0.69
29 0.63
30 0.56
31 0.49
32 0.43
33 0.34
34 0.28
35 0.22
36 0.18
37 0.16
38 0.15
39 0.12
40 0.1
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.22
46 0.26
47 0.27
48 0.26
49 0.25
50 0.31
51 0.33
52 0.34
53 0.32
54 0.33
55 0.32
56 0.3
57 0.31
58 0.27
59 0.28
60 0.27
61 0.27
62 0.3
63 0.38
64 0.41
65 0.45
66 0.45
67 0.41
68 0.42
69 0.42
70 0.41
71 0.33
72 0.3
73 0.28
74 0.26
75 0.25
76 0.24
77 0.22
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.13
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.17
86 0.23
87 0.3
88 0.38
89 0.46
90 0.57
91 0.64
92 0.7
93 0.76
94 0.78
95 0.81
96 0.83
97 0.81
98 0.75
99 0.72
100 0.76
101 0.67
102 0.62
103 0.58
104 0.48
105 0.47
106 0.45
107 0.46
108 0.37
109 0.37
110 0.35
111 0.4
112 0.47
113 0.49
114 0.55
115 0.56
116 0.62
117 0.7
118 0.76
119 0.76
120 0.79
121 0.82
122 0.84
123 0.89
124 0.9
125 0.91
126 0.91
127 0.9
128 0.88
129 0.78
130 0.68
131 0.59
132 0.51
133 0.43
134 0.33
135 0.24
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.14
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.1
145 0.15
146 0.18
147 0.24
148 0.23
149 0.23
150 0.23
151 0.25
152 0.27
153 0.25
154 0.22
155 0.21
156 0.23
157 0.25
158 0.23
159 0.21
160 0.19
161 0.21
162 0.21
163 0.17
164 0.22
165 0.22
166 0.23
167 0.26
168 0.26
169 0.26
170 0.32
171 0.35
172 0.32
173 0.32
174 0.31
175 0.28
176 0.28
177 0.25
178 0.18
179 0.15
180 0.1
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.16
186 0.18
187 0.21
188 0.29
189 0.37
190 0.45
191 0.5
192 0.57
193 0.62
194 0.7
195 0.75
196 0.79
197 0.81
198 0.81
199 0.85
200 0.88
201 0.89
202 0.9
203 0.9
204 0.9
205 0.9
206 0.91
207 0.87
208 0.86
209 0.78
210 0.72
211 0.68
212 0.57
213 0.48
214 0.4
215 0.32
216 0.22
217 0.19
218 0.14
219 0.1
220 0.16
221 0.19
222 0.23
223 0.29
224 0.34
225 0.35
226 0.35
227 0.35
228 0.3
229 0.26
230 0.21
231 0.16
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.09
248 0.09
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.21
255 0.22
256 0.22
257 0.19
258 0.18
259 0.19
260 0.2
261 0.26
262 0.22
263 0.25
264 0.25
265 0.25
266 0.28
267 0.27
268 0.28
269 0.23
270 0.23
271 0.21
272 0.22
273 0.22
274 0.2
275 0.22
276 0.21
277 0.21
278 0.19
279 0.17
280 0.16
281 0.15
282 0.16
283 0.12
284 0.17
285 0.2
286 0.24
287 0.28
288 0.31
289 0.33
290 0.38
291 0.43
292 0.46
293 0.49
294 0.51
295 0.51
296 0.5
297 0.52
298 0.46
299 0.41
300 0.35
301 0.29
302 0.22
303 0.17
304 0.14
305 0.12
306 0.13
307 0.18
308 0.16
309 0.16
310 0.18
311 0.19
312 0.18
313 0.16
314 0.18
315 0.14
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.04
323 0.04
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.15
331 0.15
332 0.18
333 0.25
334 0.33
335 0.42
336 0.44
337 0.43
338 0.39
339 0.4
340 0.37
341 0.33
342 0.24
343 0.16
344 0.17
345 0.19
346 0.19
347 0.19
348 0.18
349 0.16
350 0.17
351 0.18
352 0.16
353 0.15
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.11
361 0.13
362 0.15
363 0.16
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.18
368 0.16
369 0.15
370 0.15
371 0.17
372 0.21
373 0.21
374 0.21
375 0.18
376 0.17
377 0.16
378 0.15
379 0.12
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.13
385 0.15
386 0.15
387 0.15
388 0.17
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.18
393 0.15
394 0.15
395 0.17
396 0.15
397 0.14
398 0.13
399 0.12
400 0.13
401 0.14
402 0.13
403 0.11
404 0.12
405 0.14
406 0.13
407 0.14
408 0.17
409 0.19
410 0.26
411 0.27
412 0.27
413 0.26
414 0.28
415 0.26
416 0.24
417 0.22
418 0.19
419 0.21
420 0.25
421 0.28
422 0.33
423 0.36
424 0.39
425 0.44
426 0.44
427 0.45
428 0.46
429 0.47
430 0.46
431 0.44
432 0.44
433 0.49
434 0.52
435 0.56
436 0.59
437 0.59
438 0.59
439 0.6
440 0.61
441 0.57
442 0.56
443 0.54
444 0.52
445 0.51
446 0.51
447 0.49
448 0.47
449 0.46
450 0.42
451 0.38
452 0.31
453 0.28
454 0.33
455 0.35
456 0.39
457 0.42
458 0.43
459 0.46
460 0.5
461 0.5
462 0.4
463 0.37
464 0.31
465 0.24
466 0.2
467 0.18
468 0.16
469 0.19
470 0.2
471 0.2
472 0.2
473 0.24
474 0.26
475 0.25
476 0.28
477 0.33
478 0.39
479 0.43
480 0.44
481 0.44
482 0.49
483 0.49
484 0.48
485 0.46
486 0.44
487 0.4
488 0.43
489 0.43
490 0.41
491 0.42
492 0.4
493 0.38
494 0.37
495 0.37
496 0.35
497 0.38
498 0.36
499 0.36
500 0.37
501 0.36
502 0.38
503 0.41
504 0.38
505 0.39
506 0.38
507 0.45
508 0.51
509 0.57
510 0.6
511 0.59
512 0.65
513 0.64
514 0.69
515 0.7
516 0.68