Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SLM5

Protein Details
Accession C9SLM5    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-255SGFKASRRGNYHRKRRRWARTRFIVDQHydrophilic
380-401LFTGSKARGRQRSKHAARPSGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-248RRGNYHRKRRRWAR
385-433KARGRQRSKHAARPSGARSRHSWEGTFMLRRGPDGGIGKGGARRGRGGK
Subcellular Location(s) cyto 14, nucl 8, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG val:VDBG_05702  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHTVVQPNEWVAVKLPNESIRIIQVIPNTTISLGKYGSFPSNLIIERPYHLTYEVQDRRDDENFNRLRVVPASELHADVIAEENGEKAVPDESAEADADADADANNDASAVTSANVVAVEDGADFTLVDKASGTVIAREGRDKIEAEARQLLTQQEIETLKKRDTDGGRDIIAKLLLSHTSLDEKTTFSLAKYKILKNKKYLRRFSLIEPESDTTYASFTDDIAEETLSGFKASRRGNYHRKRRRWARTRFIVDQARAGGFSGLVVASTMDPISVVRAALPLLAGGAPISIYSPTIEPLTQLADCFSKARRAGWSSNPPTDDSGRARCRTWRNWPGSDDFPVNPSLLIGPNVQTSRAKRWQVLPGRTHPLMMARGFPGFLFTGSKARGRQRSKHAARPSGARSRHSWEGTFMLRRGPDGGIGKGGARRGRGGKIVTID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.27
3 0.27
4 0.29
5 0.29
6 0.29
7 0.26
8 0.27
9 0.25
10 0.23
11 0.24
12 0.25
13 0.26
14 0.25
15 0.23
16 0.22
17 0.23
18 0.2
19 0.19
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.2
25 0.2
26 0.19
27 0.18
28 0.22
29 0.22
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.21
34 0.25
35 0.24
36 0.21
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.32
41 0.35
42 0.33
43 0.34
44 0.36
45 0.4
46 0.42
47 0.43
48 0.35
49 0.4
50 0.4
51 0.39
52 0.39
53 0.34
54 0.34
55 0.31
56 0.32
57 0.24
58 0.23
59 0.26
60 0.24
61 0.24
62 0.21
63 0.2
64 0.15
65 0.13
66 0.14
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.09
123 0.12
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.21
132 0.21
133 0.23
134 0.27
135 0.26
136 0.25
137 0.25
138 0.24
139 0.18
140 0.18
141 0.15
142 0.13
143 0.14
144 0.16
145 0.2
146 0.22
147 0.22
148 0.23
149 0.24
150 0.27
151 0.28
152 0.32
153 0.32
154 0.32
155 0.32
156 0.31
157 0.3
158 0.24
159 0.21
160 0.15
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.12
175 0.09
176 0.16
177 0.16
178 0.22
179 0.26
180 0.3
181 0.37
182 0.46
183 0.51
184 0.53
185 0.63
186 0.66
187 0.7
188 0.73
189 0.7
190 0.67
191 0.64
192 0.59
193 0.59
194 0.5
195 0.41
196 0.36
197 0.32
198 0.27
199 0.24
200 0.21
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.12
220 0.14
221 0.19
222 0.25
223 0.33
224 0.44
225 0.54
226 0.64
227 0.68
228 0.75
229 0.8
230 0.85
231 0.88
232 0.87
233 0.88
234 0.87
235 0.87
236 0.85
237 0.78
238 0.75
239 0.7
240 0.6
241 0.52
242 0.43
243 0.33
244 0.26
245 0.22
246 0.14
247 0.08
248 0.07
249 0.06
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.03
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.17
295 0.18
296 0.2
297 0.24
298 0.29
299 0.33
300 0.41
301 0.5
302 0.49
303 0.53
304 0.53
305 0.48
306 0.46
307 0.43
308 0.39
309 0.33
310 0.37
311 0.39
312 0.4
313 0.4
314 0.45
315 0.51
316 0.54
317 0.6
318 0.6
319 0.61
320 0.64
321 0.66
322 0.63
323 0.59
324 0.55
325 0.48
326 0.38
327 0.32
328 0.28
329 0.25
330 0.19
331 0.15
332 0.13
333 0.11
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.16
338 0.17
339 0.18
340 0.22
341 0.24
342 0.32
343 0.4
344 0.42
345 0.41
346 0.47
347 0.55
348 0.6
349 0.65
350 0.62
351 0.61
352 0.65
353 0.61
354 0.56
355 0.47
356 0.42
357 0.38
358 0.32
359 0.28
360 0.21
361 0.22
362 0.21
363 0.2
364 0.18
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.19
370 0.21
371 0.26
372 0.3
373 0.38
374 0.47
375 0.52
376 0.59
377 0.64
378 0.73
379 0.77
380 0.8
381 0.81
382 0.8
383 0.76
384 0.76
385 0.73
386 0.72
387 0.68
388 0.62
389 0.57
390 0.56
391 0.61
392 0.56
393 0.49
394 0.43
395 0.43
396 0.46
397 0.47
398 0.4
399 0.38
400 0.34
401 0.34
402 0.33
403 0.28
404 0.28
405 0.26
406 0.27
407 0.24
408 0.24
409 0.25
410 0.26
411 0.3
412 0.27
413 0.26
414 0.31
415 0.34
416 0.38
417 0.42
418 0.42