Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9STC3

Protein Details
Accession C9STC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42NEPADRPRTPRTPKTPKTPVLRTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-188EDERRREAARRKREEEEAERTRPTIGRTPSVRGRGTARVRSR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013960  DASH_Duo1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0042729  C:DASH complex  
GO:0005874  C:microtubule  
GO:0072686  C:mitotic spindle  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
KEGG val:VDBG_08148  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08651  DASH_Duo1  
Amino Acid Sequences MSDPLDDSTTDIWASPDQNEPADRPRTPRTPKTPKTPVLRTPANQDTDEYDRDAVLRKELEGVRTINASIEGIISTLEKAKSNMGTVSNTVGNASTLLNTWTRILSQTEHNQRLILNPEWRGATQDMQEMEAEALQRQQAAERKAAEDERRREAARRKREEEEAERTRPTIGRTPSVRGRGTARVRSRGTRGTMHTRGPSISGTTGSRIGRGASSTSTRAGSRGRGTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.19
4 0.2
5 0.23
6 0.24
7 0.26
8 0.31
9 0.36
10 0.36
11 0.37
12 0.43
13 0.5
14 0.57
15 0.64
16 0.67
17 0.72
18 0.77
19 0.81
20 0.83
21 0.82
22 0.82
23 0.8
24 0.77
25 0.74
26 0.74
27 0.65
28 0.64
29 0.63
30 0.57
31 0.5
32 0.43
33 0.39
34 0.37
35 0.36
36 0.29
37 0.23
38 0.19
39 0.19
40 0.22
41 0.18
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.2
46 0.21
47 0.22
48 0.21
49 0.22
50 0.19
51 0.19
52 0.19
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.08
57 0.07
58 0.06
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.12
68 0.12
69 0.13
70 0.15
71 0.14
72 0.15
73 0.14
74 0.16
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.05
83 0.05
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.14
94 0.22
95 0.29
96 0.31
97 0.31
98 0.3
99 0.29
100 0.29
101 0.29
102 0.24
103 0.19
104 0.18
105 0.19
106 0.2
107 0.19
108 0.2
109 0.17
110 0.15
111 0.13
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.09
126 0.14
127 0.15
128 0.19
129 0.19
130 0.2
131 0.23
132 0.27
133 0.3
134 0.34
135 0.36
136 0.38
137 0.41
138 0.41
139 0.45
140 0.51
141 0.54
142 0.56
143 0.61
144 0.6
145 0.61
146 0.67
147 0.68
148 0.65
149 0.65
150 0.61
151 0.55
152 0.51
153 0.47
154 0.43
155 0.36
156 0.33
157 0.31
158 0.28
159 0.32
160 0.34
161 0.4
162 0.45
163 0.5
164 0.47
165 0.41
166 0.42
167 0.44
168 0.49
169 0.52
170 0.51
171 0.53
172 0.56
173 0.59
174 0.6
175 0.57
176 0.54
177 0.51
178 0.51
179 0.52
180 0.53
181 0.54
182 0.52
183 0.47
184 0.43
185 0.39
186 0.34
187 0.27
188 0.24
189 0.21
190 0.19
191 0.2
192 0.25
193 0.23
194 0.23
195 0.21
196 0.21
197 0.19
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.22
202 0.23
203 0.25
204 0.26
205 0.25
206 0.26
207 0.28
208 0.3