Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SGW9

Protein Details
Accession C9SGW9    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-112QTALPPARKTEKKQKKRTPDHGNALPDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-101RKTEKKQKKR
Subcellular Location(s) mito 17, cyto 4, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
KEGG val:VDBG_04298  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MSRGRNTLLCVTVVCCATAPPHHAHQPVRPYKAGTTPIIKVAALGRLLAPFVRLTRSIVASPMTSSSPPDPVPSQLAVEQAEAAQTALPPARKTEKKQKKRTPDHGNALPDTIITPLEGPWPRPYVIEDGLRKVEPYYHTFNTYCKERWRGRTLIDVFSCEFRDRTPEYYRKCMDDGKIAANGKVVGADYVIRNGDLVSHTSHRHEPPVTAEPIAVIHEDNDYLIVNKPAGVPVHPAGRYNFNSVVEILKSERGAHFMPRPCHRLDRLTSGILCFGKTAQAATDLSRQIQARMVRKEYVARVIGHFPDGEVVCDQPLLQISPRLGLNRVRANGKFARTVFKRLAYYPPPLSDVDGGPEQRPKTPEEAADEEQRPWTAKKGYSIVRCLPLTGRTHQIRVHLQFLGYPIQNDPIYANQRVWGFDLGCNDDGTTHTDEDIMSRLEKMGKEEVADAVAYHEEMVDLYHKRRAEKLSGELCKTCDTPLYTDPGDQELSLFLHSLRYEDSGGKWSYCSPLPPWALPPSGMSGPTAVGGLGELVEAVKDDPIDLTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.2
6 0.23
7 0.24
8 0.3
9 0.37
10 0.43
11 0.46
12 0.5
13 0.57
14 0.61
15 0.62
16 0.58
17 0.55
18 0.53
19 0.56
20 0.54
21 0.48
22 0.45
23 0.41
24 0.43
25 0.41
26 0.37
27 0.3
28 0.27
29 0.26
30 0.21
31 0.19
32 0.16
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.13
37 0.11
38 0.12
39 0.15
40 0.15
41 0.18
42 0.22
43 0.24
44 0.24
45 0.24
46 0.24
47 0.21
48 0.21
49 0.2
50 0.19
51 0.16
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.21
56 0.24
57 0.23
58 0.24
59 0.28
60 0.25
61 0.26
62 0.23
63 0.25
64 0.22
65 0.2
66 0.18
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.06
73 0.08
74 0.11
75 0.13
76 0.13
77 0.18
78 0.28
79 0.34
80 0.42
81 0.51
82 0.6
83 0.68
84 0.79
85 0.85
86 0.87
87 0.91
88 0.94
89 0.93
90 0.92
91 0.9
92 0.86
93 0.81
94 0.7
95 0.61
96 0.5
97 0.39
98 0.29
99 0.2
100 0.13
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.14
105 0.15
106 0.17
107 0.21
108 0.24
109 0.24
110 0.24
111 0.26
112 0.24
113 0.27
114 0.32
115 0.3
116 0.31
117 0.34
118 0.33
119 0.31
120 0.26
121 0.27
122 0.23
123 0.26
124 0.29
125 0.28
126 0.32
127 0.33
128 0.35
129 0.35
130 0.37
131 0.36
132 0.35
133 0.42
134 0.45
135 0.53
136 0.57
137 0.56
138 0.53
139 0.59
140 0.56
141 0.54
142 0.48
143 0.42
144 0.36
145 0.34
146 0.33
147 0.25
148 0.21
149 0.14
150 0.19
151 0.2
152 0.24
153 0.3
154 0.36
155 0.4
156 0.49
157 0.5
158 0.47
159 0.47
160 0.46
161 0.4
162 0.4
163 0.37
164 0.31
165 0.34
166 0.32
167 0.3
168 0.26
169 0.24
170 0.17
171 0.15
172 0.12
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.13
187 0.14
188 0.17
189 0.22
190 0.22
191 0.25
192 0.25
193 0.23
194 0.26
195 0.3
196 0.29
197 0.24
198 0.23
199 0.19
200 0.18
201 0.18
202 0.13
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.24
226 0.25
227 0.26
228 0.26
229 0.22
230 0.22
231 0.21
232 0.21
233 0.14
234 0.14
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.2
244 0.24
245 0.29
246 0.32
247 0.35
248 0.34
249 0.38
250 0.37
251 0.36
252 0.34
253 0.36
254 0.34
255 0.32
256 0.31
257 0.27
258 0.27
259 0.22
260 0.19
261 0.12
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.16
274 0.16
275 0.15
276 0.19
277 0.22
278 0.25
279 0.28
280 0.3
281 0.28
282 0.29
283 0.32
284 0.29
285 0.29
286 0.25
287 0.22
288 0.21
289 0.22
290 0.22
291 0.19
292 0.17
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.14
312 0.17
313 0.22
314 0.25
315 0.27
316 0.29
317 0.29
318 0.34
319 0.36
320 0.34
321 0.33
322 0.29
323 0.35
324 0.34
325 0.39
326 0.36
327 0.36
328 0.35
329 0.32
330 0.39
331 0.34
332 0.37
333 0.34
334 0.33
335 0.31
336 0.29
337 0.28
338 0.23
339 0.19
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.15
344 0.19
345 0.19
346 0.21
347 0.22
348 0.21
349 0.23
350 0.24
351 0.26
352 0.27
353 0.32
354 0.32
355 0.37
356 0.36
357 0.33
358 0.31
359 0.29
360 0.26
361 0.21
362 0.23
363 0.21
364 0.22
365 0.26
366 0.31
367 0.37
368 0.41
369 0.45
370 0.44
371 0.45
372 0.43
373 0.39
374 0.35
375 0.33
376 0.32
377 0.29
378 0.33
379 0.3
380 0.34
381 0.34
382 0.38
383 0.41
384 0.4
385 0.4
386 0.33
387 0.3
388 0.28
389 0.28
390 0.28
391 0.2
392 0.18
393 0.15
394 0.18
395 0.18
396 0.17
397 0.17
398 0.18
399 0.23
400 0.23
401 0.23
402 0.22
403 0.23
404 0.24
405 0.25
406 0.21
407 0.18
408 0.19
409 0.22
410 0.23
411 0.22
412 0.21
413 0.19
414 0.16
415 0.16
416 0.18
417 0.17
418 0.14
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.16
424 0.13
425 0.1
426 0.1
427 0.12
428 0.15
429 0.16
430 0.19
431 0.21
432 0.21
433 0.21
434 0.22
435 0.21
436 0.18
437 0.17
438 0.13
439 0.1
440 0.1
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.06
447 0.1
448 0.12
449 0.14
450 0.19
451 0.22
452 0.24
453 0.3
454 0.35
455 0.38
456 0.41
457 0.48
458 0.53
459 0.57
460 0.59
461 0.55
462 0.51
463 0.47
464 0.42
465 0.34
466 0.29
467 0.26
468 0.27
469 0.27
470 0.32
471 0.29
472 0.3
473 0.31
474 0.28
475 0.26
476 0.21
477 0.19
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.12
482 0.09
483 0.12
484 0.12
485 0.13
486 0.13
487 0.15
488 0.16
489 0.18
490 0.2
491 0.23
492 0.25
493 0.24
494 0.23
495 0.23
496 0.25
497 0.25
498 0.27
499 0.23
500 0.3
501 0.34
502 0.35
503 0.38
504 0.38
505 0.38
506 0.36
507 0.35
508 0.31
509 0.29
510 0.27
511 0.23
512 0.19
513 0.18
514 0.17
515 0.15
516 0.09
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.05
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.05
526 0.05
527 0.06
528 0.06
529 0.07