Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHU5

Protein Details
Accession C9SHU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
292-323LMEWKVAIRDRRRLTKQRSKEKQGQEHERGNPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-304R
307-307K
Subcellular Location(s) plas 21, pero 3, nucl 1.5, cyto_nucl 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046536  DUF6601  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG val:VDBG_04627  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF20246  DUF6601  
Amino Acid Sequences MLKIQKCPFKESRQLAVNVEEGSQEGKQVPGYPRISLSDRSEVLDFLTQELCNDDLDQMADKLWWMSRQNSQNISPLHRQAVKRRTIVVTEDPKLHLVWIHDRIFVKPLPRYLGDYGFWRDHICAKDGTDKQSVRVQRAALGVHPDTDFRIAKDPSLALIPEHVTWEHFCAFTGGLNSIEDREVSERYQYGEIRLTRLNFYAPFLLGRSHFQRVDYQYGPYFARFYVPILFAMGVVSVVLSGMQVIFTASEEGAAVRSRRWADAAVGFSVASIVVACGLLIALGGLIVYKILMEWKVAIRDRRRLTKQRSKEKQGQEHERGNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.62
3 0.57
4 0.5
5 0.41
6 0.34
7 0.26
8 0.19
9 0.18
10 0.15
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.12
15 0.19
16 0.22
17 0.28
18 0.3
19 0.3
20 0.32
21 0.35
22 0.38
23 0.37
24 0.38
25 0.36
26 0.35
27 0.36
28 0.35
29 0.3
30 0.29
31 0.27
32 0.22
33 0.17
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.17
38 0.15
39 0.12
40 0.12
41 0.11
42 0.09
43 0.1
44 0.11
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.14
52 0.16
53 0.19
54 0.27
55 0.34
56 0.4
57 0.43
58 0.44
59 0.46
60 0.46
61 0.49
62 0.46
63 0.42
64 0.41
65 0.43
66 0.45
67 0.48
68 0.54
69 0.55
70 0.52
71 0.53
72 0.49
73 0.45
74 0.46
75 0.45
76 0.43
77 0.39
78 0.39
79 0.35
80 0.34
81 0.32
82 0.27
83 0.2
84 0.16
85 0.2
86 0.25
87 0.25
88 0.28
89 0.28
90 0.29
91 0.3
92 0.29
93 0.27
94 0.23
95 0.24
96 0.24
97 0.25
98 0.28
99 0.27
100 0.29
101 0.25
102 0.26
103 0.27
104 0.24
105 0.23
106 0.2
107 0.18
108 0.2
109 0.2
110 0.19
111 0.16
112 0.17
113 0.25
114 0.27
115 0.3
116 0.32
117 0.31
118 0.32
119 0.36
120 0.37
121 0.31
122 0.32
123 0.28
124 0.24
125 0.26
126 0.24
127 0.19
128 0.21
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.13
133 0.12
134 0.14
135 0.14
136 0.11
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.12
143 0.13
144 0.12
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.12
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.19
179 0.19
180 0.21
181 0.23
182 0.22
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.15
187 0.16
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.12
193 0.11
194 0.15
195 0.17
196 0.2
197 0.2
198 0.21
199 0.26
200 0.28
201 0.34
202 0.31
203 0.3
204 0.27
205 0.29
206 0.28
207 0.23
208 0.2
209 0.14
210 0.15
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.19
248 0.19
249 0.2
250 0.25
251 0.26
252 0.22
253 0.21
254 0.19
255 0.17
256 0.16
257 0.12
258 0.07
259 0.04
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.03
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.1
282 0.14
283 0.21
284 0.27
285 0.36
286 0.41
287 0.5
288 0.58
289 0.65
290 0.72
291 0.75
292 0.81
293 0.83
294 0.87
295 0.88
296 0.91
297 0.9
298 0.9
299 0.9
300 0.9
301 0.9
302 0.89
303 0.87