Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHQ7

Protein Details
Accession C9SHQ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-63LGVKLGHRRKLQRRIANSRGLHydrophilic
97-119IAVVTKRKYRRHPKPDENAPERPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, cyto 3.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG val:VDBG_04589  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00536  SAM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAQGLGTIFAELGILQYLDTFVEQGFDTWATILDITESDLDALGVKLGHRRKLQRRIANSRGLAPDASLVSPIRASVEDTRTENTKPEPIKQDSKDIAVVTKRKYRRHPKPDENAPERPPSAYVLFSNKMRDDLKGRNLTFTEIAKLVGENWQSLSPVEKEPFETQALNAKEKYNQDLAEYKKTYDYKKYAQYLHDFKQKQLHQNQAGCQCYQSSSWQQC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.05
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.08
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.06
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.05
31 0.05
32 0.06
33 0.13
34 0.17
35 0.24
36 0.3
37 0.4
38 0.49
39 0.6
40 0.69
41 0.71
42 0.77
43 0.8
44 0.81
45 0.79
46 0.7
47 0.65
48 0.57
49 0.49
50 0.39
51 0.29
52 0.24
53 0.17
54 0.15
55 0.12
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.1
63 0.13
64 0.16
65 0.18
66 0.19
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.19
72 0.23
73 0.22
74 0.25
75 0.31
76 0.34
77 0.41
78 0.41
79 0.46
80 0.41
81 0.41
82 0.38
83 0.31
84 0.28
85 0.25
86 0.27
87 0.24
88 0.3
89 0.34
90 0.39
91 0.49
92 0.57
93 0.63
94 0.7
95 0.77
96 0.8
97 0.83
98 0.87
99 0.86
100 0.81
101 0.75
102 0.67
103 0.6
104 0.5
105 0.41
106 0.32
107 0.25
108 0.2
109 0.16
110 0.15
111 0.16
112 0.18
113 0.19
114 0.21
115 0.19
116 0.21
117 0.2
118 0.21
119 0.22
120 0.25
121 0.32
122 0.38
123 0.38
124 0.37
125 0.37
126 0.37
127 0.34
128 0.29
129 0.23
130 0.15
131 0.15
132 0.12
133 0.12
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.15
143 0.13
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.2
148 0.21
149 0.24
150 0.23
151 0.21
152 0.18
153 0.25
154 0.27
155 0.26
156 0.26
157 0.24
158 0.27
159 0.29
160 0.33
161 0.29
162 0.26
163 0.27
164 0.32
165 0.36
166 0.4
167 0.39
168 0.36
169 0.39
170 0.43
171 0.44
172 0.46
173 0.48
174 0.46
175 0.54
176 0.59
177 0.57
178 0.59
179 0.63
180 0.62
181 0.63
182 0.65
183 0.58
184 0.54
185 0.59
186 0.59
187 0.6
188 0.6
189 0.63
190 0.62
191 0.66
192 0.7
193 0.69
194 0.66
195 0.57
196 0.5
197 0.41
198 0.34
199 0.31
200 0.31