Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SV04

Protein Details
Accession C9SV04    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
439-460PGSSPRLRSRTSRRGRRIMPRSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
442-460SPRLRSRTSRRGRRIMPRS
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013144  CRA_dom  
IPR024964  CTLH/CRA  
IPR006595  CTLH_C  
IPR045098  Fyv10_fam  
Gene Ontology GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0045721  P:negative regulation of gluconeogenesis  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG val:VDBG_08729  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10607  CTLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50897  CTLH  
Amino Acid Sequences MSLQPQAPRALHEPPSTETSTPPPSTPDPTDVWPLGKSHPSCRKPDQPLLRLPYELLRNNFRAAHFTVEKESTSIKALLKDTATASVNGRASPDQVLQNLDAMIAKMRGVKRKLTTYADEEARLYHQTDARIAHLGELYGMHSFDDVKYETWSRSRRRPDVCLDEQDPGVITSGQRCRKRLLGAKTTRRSCARKILEFMLRFQQYVELLRSHKYLEAIAHSKKYIVPYKSVYPDQCRKAFGLLAYSNADAAANTTYATLYSPDRWNNLVDIFTNNHNELLALPRLPLLHIALSSGLSALKTPACHSSSAVASFTTTVPFSPEQYIETNAGISQSSSNETQRWRQPQQQQDHGMHSEPSGDGAHSQNPHHHHHHHQQQARQPPSRAPPRPAPSAPPSSTTSRATSRTPTTPKVTSTRTSCCCRTATPLARTASRTMRASPGSSPRLRSRTSRRGRRIMPRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.45
3 0.43
4 0.4
5 0.35
6 0.35
7 0.39
8 0.38
9 0.35
10 0.35
11 0.36
12 0.41
13 0.43
14 0.41
15 0.36
16 0.38
17 0.43
18 0.39
19 0.38
20 0.33
21 0.31
22 0.31
23 0.35
24 0.34
25 0.38
26 0.47
27 0.51
28 0.57
29 0.64
30 0.69
31 0.7
32 0.78
33 0.78
34 0.74
35 0.78
36 0.77
37 0.71
38 0.61
39 0.54
40 0.49
41 0.47
42 0.45
43 0.41
44 0.4
45 0.4
46 0.42
47 0.44
48 0.39
49 0.36
50 0.32
51 0.35
52 0.31
53 0.31
54 0.32
55 0.31
56 0.31
57 0.27
58 0.27
59 0.2
60 0.21
61 0.23
62 0.2
63 0.23
64 0.24
65 0.26
66 0.25
67 0.26
68 0.24
69 0.24
70 0.23
71 0.2
72 0.2
73 0.23
74 0.23
75 0.21
76 0.23
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.22
84 0.2
85 0.2
86 0.18
87 0.16
88 0.13
89 0.1
90 0.1
91 0.08
92 0.09
93 0.13
94 0.17
95 0.25
96 0.27
97 0.34
98 0.37
99 0.44
100 0.49
101 0.49
102 0.5
103 0.47
104 0.51
105 0.46
106 0.42
107 0.35
108 0.3
109 0.27
110 0.24
111 0.2
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.08
127 0.08
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.12
136 0.14
137 0.16
138 0.22
139 0.3
140 0.33
141 0.41
142 0.49
143 0.55
144 0.59
145 0.63
146 0.64
147 0.66
148 0.65
149 0.62
150 0.55
151 0.48
152 0.43
153 0.37
154 0.29
155 0.2
156 0.15
157 0.09
158 0.08
159 0.12
160 0.19
161 0.27
162 0.31
163 0.32
164 0.34
165 0.38
166 0.45
167 0.48
168 0.49
169 0.52
170 0.58
171 0.66
172 0.72
173 0.7
174 0.68
175 0.67
176 0.62
177 0.56
178 0.57
179 0.53
180 0.48
181 0.49
182 0.49
183 0.49
184 0.46
185 0.43
186 0.4
187 0.34
188 0.3
189 0.27
190 0.23
191 0.17
192 0.19
193 0.18
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.13
202 0.11
203 0.15
204 0.18
205 0.19
206 0.2
207 0.18
208 0.19
209 0.19
210 0.23
211 0.25
212 0.22
213 0.23
214 0.25
215 0.29
216 0.32
217 0.35
218 0.33
219 0.33
220 0.39
221 0.41
222 0.4
223 0.37
224 0.34
225 0.32
226 0.3
227 0.23
228 0.22
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.1
248 0.14
249 0.16
250 0.18
251 0.19
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.16
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.11
266 0.13
267 0.12
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.14
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.19
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.09
303 0.08
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.14
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.19
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.1
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.1
322 0.12
323 0.14
324 0.17
325 0.2
326 0.27
327 0.34
328 0.42
329 0.45
330 0.51
331 0.59
332 0.65
333 0.7
334 0.72
335 0.71
336 0.65
337 0.65
338 0.58
339 0.5
340 0.41
341 0.33
342 0.25
343 0.18
344 0.17
345 0.12
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.17
350 0.18
351 0.19
352 0.23
353 0.28
354 0.34
355 0.38
356 0.42
357 0.45
358 0.53
359 0.62
360 0.65
361 0.67
362 0.67
363 0.69
364 0.73
365 0.73
366 0.69
367 0.62
368 0.6
369 0.63
370 0.68
371 0.66
372 0.63
373 0.65
374 0.64
375 0.7
376 0.66
377 0.63
378 0.59
379 0.62
380 0.57
381 0.51
382 0.49
383 0.46
384 0.48
385 0.44
386 0.42
387 0.38
388 0.4
389 0.39
390 0.42
391 0.42
392 0.47
393 0.5
394 0.52
395 0.53
396 0.54
397 0.55
398 0.56
399 0.55
400 0.53
401 0.53
402 0.56
403 0.56
404 0.6
405 0.58
406 0.55
407 0.53
408 0.48
409 0.5
410 0.51
411 0.54
412 0.52
413 0.56
414 0.56
415 0.57
416 0.57
417 0.55
418 0.52
419 0.49
420 0.46
421 0.42
422 0.45
423 0.45
424 0.44
425 0.45
426 0.47
427 0.49
428 0.51
429 0.54
430 0.57
431 0.6
432 0.61
433 0.64
434 0.65
435 0.67
436 0.74
437 0.79
438 0.79
439 0.83
440 0.89