Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SR20

Protein Details
Accession C9SR20    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
416-435DMSADKKAPAKRRGAKGRKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-435KKAPAKRRGAKGRKK
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 7, cysk 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037850  RBBP5/Swd1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0048188  C:Set1C/COMPASS complex  
KEGG val:VDBG_07405  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNLLLADPEEAVEYIEQITNTNTIRSGHATCLRFNRTGDFLASGRVDGTLVVWDIETMGVARKMRGHNRSITSLSWSGCGRYLLSACQGWKVILWDLQDGTKYREVRFRAPAYIAELHPHNHNLFVASLFEAQPMLVDVTEPVEVKHAPDPLYRSDQARRDDALAESMPETRRDDDRDHLHSIGSGETFWSTPKTERSERSMYPTSTLNTLDVDTLYLIKEHEFEDQVNRLSWNHVTFTATGEYVAASTYNNHEIYVWERRTGSLTRILDGPKEEQGVIEWHPQRHFLATCGLETGRIYVWSIVPEQKWARLAPDFAQVEENQEYVEREDEFDIYGQEELTKRRLDAEDEDVDVVTPYESGALEQQNAGEGGRQGKFRMPILFDLADSDSEEEFVAVSTGTMRRRSPGADGEILDDMSADKKAPAKRRGAKGRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.12
6 0.15
7 0.16
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.2
12 0.23
13 0.25
14 0.28
15 0.35
16 0.36
17 0.39
18 0.47
19 0.49
20 0.48
21 0.47
22 0.44
23 0.4
24 0.4
25 0.36
26 0.31
27 0.26
28 0.27
29 0.26
30 0.21
31 0.18
32 0.16
33 0.14
34 0.1
35 0.1
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.05
45 0.08
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.19
50 0.27
51 0.36
52 0.42
53 0.45
54 0.49
55 0.54
56 0.58
57 0.54
58 0.48
59 0.45
60 0.43
61 0.38
62 0.33
63 0.28
64 0.24
65 0.23
66 0.23
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.19
72 0.21
73 0.19
74 0.21
75 0.21
76 0.17
77 0.17
78 0.18
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.2
86 0.19
87 0.21
88 0.24
89 0.25
90 0.26
91 0.32
92 0.35
93 0.38
94 0.45
95 0.43
96 0.41
97 0.4
98 0.39
99 0.38
100 0.38
101 0.32
102 0.27
103 0.25
104 0.23
105 0.23
106 0.25
107 0.2
108 0.17
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.09
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.2
138 0.22
139 0.28
140 0.28
141 0.29
142 0.32
143 0.37
144 0.38
145 0.38
146 0.35
147 0.31
148 0.31
149 0.28
150 0.24
151 0.18
152 0.16
153 0.13
154 0.15
155 0.14
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.18
160 0.21
161 0.23
162 0.26
163 0.31
164 0.34
165 0.35
166 0.33
167 0.3
168 0.27
169 0.25
170 0.2
171 0.14
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.15
181 0.2
182 0.25
183 0.28
184 0.34
185 0.38
186 0.37
187 0.43
188 0.43
189 0.38
190 0.35
191 0.34
192 0.28
193 0.24
194 0.23
195 0.16
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.13
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.15
243 0.23
244 0.22
245 0.2
246 0.2
247 0.21
248 0.24
249 0.25
250 0.23
251 0.22
252 0.22
253 0.21
254 0.24
255 0.24
256 0.22
257 0.23
258 0.22
259 0.16
260 0.17
261 0.16
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.14
266 0.21
267 0.22
268 0.23
269 0.24
270 0.26
271 0.25
272 0.26
273 0.25
274 0.18
275 0.21
276 0.19
277 0.19
278 0.19
279 0.18
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.13
290 0.15
291 0.15
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.24
296 0.23
297 0.24
298 0.22
299 0.24
300 0.2
301 0.28
302 0.25
303 0.24
304 0.26
305 0.23
306 0.25
307 0.24
308 0.22
309 0.13
310 0.14
311 0.14
312 0.12
313 0.14
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.13
327 0.17
328 0.18
329 0.17
330 0.22
331 0.23
332 0.25
333 0.27
334 0.31
335 0.29
336 0.29
337 0.29
338 0.25
339 0.23
340 0.19
341 0.15
342 0.09
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.11
357 0.11
358 0.16
359 0.18
360 0.19
361 0.2
362 0.24
363 0.27
364 0.29
365 0.32
366 0.3
367 0.3
368 0.34
369 0.34
370 0.29
371 0.29
372 0.26
373 0.22
374 0.19
375 0.19
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.07
383 0.05
384 0.05
385 0.08
386 0.12
387 0.16
388 0.21
389 0.22
390 0.24
391 0.28
392 0.3
393 0.33
394 0.36
395 0.38
396 0.38
397 0.38
398 0.38
399 0.37
400 0.34
401 0.28
402 0.2
403 0.15
404 0.12
405 0.12
406 0.09
407 0.1
408 0.17
409 0.25
410 0.34
411 0.42
412 0.52
413 0.61
414 0.71
415 0.8