Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPQ7

Protein Details
Accession C9SPQ7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MSDRPKTSRHSRQAKQPKNAKQNEQAQATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR019458  Est1-like_N  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG val:VDBG_06882  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10374  EST1  
PF10373  EST1_DNA_bind  
Amino Acid Sequences MSDRPKTSRHSRQAKQPKNAKQNEQAQATPSKPSETPKLAKKPEQVGKAQQSTEGEQQQPQMPNVEDVWTEAQKIRKLLSSQVSKLRREGDVSKHSTLREVGRDPCSFQVCACSACRTLFMDYIYAAKENVEETLWQAHVLVNSEYRNSLNRVRTAQLAVLKSKLETPYVRFLKLSQRFYEEYIRRLANRYGIPELQVAAKRILSEQKDAEDSNSGNGGKDCTNDVPSSIRLMALHSCYMTLIRLGDLVRYRLQVRHNKKPSNYLALTYYELAHDLKPTVGHAHHQMAIIYLDEKRDFDIVYHFFRSLAIEEPHPRATNNLELQFKATLSSVKSGMPKQSGPYDPLMMWFLRLHAYCYRGEPFPQQRELEAEVIHRLDAAIRDPDASAMLLKMVLINMAAYYVATQSVKGRLKDPVTLASVNAYTSLENEASLYPKTILRLNFLFFGTVLNIFKTELETLKVERMDWEDTHAGKDSSDNNSTRPQSTPTELVILPLVRLYTSWLVACRAEVGIASPNVPVEQVGKLLAECLSLIAELHGGDGLSLAPHMLPEDHMAIGLLPLNDPTLEPRCRLSFNQELNVVKPLCDYYDGKLLEGWEAGLARMLDILLCGYALTEDPALPFAFHEDRLVFTYGGDVSTTQKPQASPQQYGVQEPSQSAEYVKNPESVRQPAAGDGQPSLEVAPNDASSNPVKGSNIAHESGRNGHVSANRYGPDTTHIQPKNAATNTTEYDFSENSEVMNMVNDFMQPPDAHSAMDNFPASAQQEYDDSSYGMHSATANEVFGGEQQFFSHEGHFPGSSMAFSQASSLFQSTPYNWDPKFGPLTAFGRGSLQGTDDPTHYKNLIRSSANETDAYAGTYDQMVLQAARKGGDDDEGQRRAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.89
3 0.88
4 0.88
5 0.88
6 0.9
7 0.87
8 0.86
9 0.86
10 0.83
11 0.78
12 0.7
13 0.63
14 0.61
15 0.53
16 0.49
17 0.41
18 0.36
19 0.33
20 0.37
21 0.42
22 0.44
23 0.5
24 0.54
25 0.63
26 0.67
27 0.73
28 0.75
29 0.77
30 0.76
31 0.76
32 0.72
33 0.72
34 0.73
35 0.71
36 0.64
37 0.57
38 0.52
39 0.5
40 0.51
41 0.47
42 0.4
43 0.37
44 0.4
45 0.43
46 0.43
47 0.4
48 0.37
49 0.32
50 0.32
51 0.3
52 0.28
53 0.22
54 0.21
55 0.25
56 0.21
57 0.22
58 0.23
59 0.28
60 0.29
61 0.32
62 0.31
63 0.32
64 0.33
65 0.39
66 0.44
67 0.47
68 0.49
69 0.56
70 0.61
71 0.57
72 0.6
73 0.56
74 0.49
75 0.46
76 0.47
77 0.47
78 0.5
79 0.53
80 0.54
81 0.53
82 0.51
83 0.48
84 0.46
85 0.42
86 0.39
87 0.37
88 0.39
89 0.42
90 0.44
91 0.43
92 0.45
93 0.43
94 0.36
95 0.32
96 0.32
97 0.27
98 0.28
99 0.28
100 0.26
101 0.24
102 0.25
103 0.27
104 0.23
105 0.24
106 0.24
107 0.23
108 0.2
109 0.19
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.14
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.09
119 0.08
120 0.1
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.2
135 0.22
136 0.28
137 0.3
138 0.34
139 0.37
140 0.38
141 0.39
142 0.38
143 0.38
144 0.37
145 0.34
146 0.31
147 0.29
148 0.28
149 0.25
150 0.27
151 0.25
152 0.23
153 0.23
154 0.26
155 0.34
156 0.37
157 0.37
158 0.33
159 0.35
160 0.41
161 0.46
162 0.47
163 0.39
164 0.42
165 0.42
166 0.46
167 0.53
168 0.45
169 0.39
170 0.4
171 0.39
172 0.35
173 0.38
174 0.37
175 0.33
176 0.33
177 0.34
178 0.33
179 0.31
180 0.32
181 0.28
182 0.27
183 0.25
184 0.25
185 0.23
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.2
190 0.26
191 0.24
192 0.26
193 0.25
194 0.26
195 0.28
196 0.28
197 0.27
198 0.24
199 0.21
200 0.18
201 0.2
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.17
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.18
211 0.17
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.2
216 0.17
217 0.16
218 0.13
219 0.15
220 0.17
221 0.16
222 0.16
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.11
228 0.09
229 0.07
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.12
234 0.14
235 0.16
236 0.17
237 0.19
238 0.2
239 0.23
240 0.31
241 0.37
242 0.44
243 0.52
244 0.6
245 0.65
246 0.65
247 0.71
248 0.67
249 0.66
250 0.59
251 0.5
252 0.43
253 0.38
254 0.37
255 0.29
256 0.24
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.12
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.17
270 0.19
271 0.2
272 0.21
273 0.2
274 0.17
275 0.17
276 0.15
277 0.12
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.15
287 0.16
288 0.19
289 0.2
290 0.19
291 0.19
292 0.19
293 0.2
294 0.15
295 0.16
296 0.14
297 0.16
298 0.19
299 0.23
300 0.25
301 0.25
302 0.23
303 0.2
304 0.22
305 0.25
306 0.27
307 0.28
308 0.27
309 0.27
310 0.28
311 0.27
312 0.24
313 0.18
314 0.14
315 0.12
316 0.11
317 0.13
318 0.12
319 0.14
320 0.17
321 0.19
322 0.22
323 0.23
324 0.22
325 0.23
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.26
330 0.24
331 0.21
332 0.21
333 0.21
334 0.15
335 0.14
336 0.12
337 0.1
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.14
342 0.17
343 0.16
344 0.19
345 0.2
346 0.18
347 0.2
348 0.25
349 0.31
350 0.33
351 0.37
352 0.35
353 0.33
354 0.35
355 0.36
356 0.29
357 0.21
358 0.17
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.1
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.06
394 0.14
395 0.17
396 0.18
397 0.2
398 0.23
399 0.25
400 0.27
401 0.27
402 0.23
403 0.22
404 0.22
405 0.2
406 0.17
407 0.15
408 0.12
409 0.12
410 0.09
411 0.06
412 0.06
413 0.08
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.12
425 0.12
426 0.14
427 0.16
428 0.16
429 0.17
430 0.16
431 0.15
432 0.12
433 0.11
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.1
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.12
451 0.14
452 0.15
453 0.14
454 0.16
455 0.16
456 0.16
457 0.17
458 0.17
459 0.15
460 0.12
461 0.15
462 0.14
463 0.16
464 0.2
465 0.19
466 0.2
467 0.26
468 0.27
469 0.26
470 0.25
471 0.24
472 0.22
473 0.25
474 0.25
475 0.2
476 0.22
477 0.2
478 0.19
479 0.17
480 0.14
481 0.11
482 0.09
483 0.09
484 0.05
485 0.05
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.07
497 0.06
498 0.06
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.07
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.04
538 0.06
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.09
553 0.14
554 0.15
555 0.16
556 0.19
557 0.21
558 0.24
559 0.25
560 0.29
561 0.31
562 0.33
563 0.36
564 0.38
565 0.37
566 0.35
567 0.39
568 0.32
569 0.24
570 0.21
571 0.17
572 0.14
573 0.17
574 0.17
575 0.13
576 0.21
577 0.21
578 0.21
579 0.21
580 0.21
581 0.18
582 0.17
583 0.14
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.05
605 0.07
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.1
610 0.11
611 0.12
612 0.13
613 0.12
614 0.14
615 0.16
616 0.18
617 0.14
618 0.12
619 0.14
620 0.12
621 0.12
622 0.11
623 0.09
624 0.11
625 0.15
626 0.16
627 0.16
628 0.18
629 0.18
630 0.23
631 0.32
632 0.34
633 0.32
634 0.35
635 0.41
636 0.4
637 0.42
638 0.4
639 0.32
640 0.28
641 0.26
642 0.23
643 0.17
644 0.17
645 0.15
646 0.16
647 0.16
648 0.21
649 0.22
650 0.26
651 0.25
652 0.3
653 0.34
654 0.34
655 0.34
656 0.31
657 0.3
658 0.26
659 0.3
660 0.27
661 0.22
662 0.18
663 0.17
664 0.15
665 0.15
666 0.13
667 0.11
668 0.1
669 0.1
670 0.11
671 0.11
672 0.12
673 0.12
674 0.14
675 0.13
676 0.14
677 0.14
678 0.14
679 0.14
680 0.15
681 0.17
682 0.21
683 0.23
684 0.23
685 0.23
686 0.23
687 0.24
688 0.26
689 0.26
690 0.21
691 0.18
692 0.2
693 0.24
694 0.26
695 0.27
696 0.28
697 0.26
698 0.27
699 0.27
700 0.24
701 0.24
702 0.25
703 0.25
704 0.3
705 0.31
706 0.3
707 0.34
708 0.37
709 0.41
710 0.38
711 0.37
712 0.29
713 0.32
714 0.33
715 0.31
716 0.29
717 0.21
718 0.23
719 0.21
720 0.21
721 0.19
722 0.16
723 0.14
724 0.14
725 0.13
726 0.1
727 0.12
728 0.1
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.09
734 0.12
735 0.09
736 0.12
737 0.16
738 0.16
739 0.16
740 0.16
741 0.19
742 0.18
743 0.22
744 0.2
745 0.15
746 0.15
747 0.17
748 0.17
749 0.15
750 0.14
751 0.11
752 0.11
753 0.14
754 0.15
755 0.14
756 0.13
757 0.12
758 0.12
759 0.11
760 0.1
761 0.09
762 0.08
763 0.08
764 0.12
765 0.12
766 0.11
767 0.11
768 0.11
769 0.1
770 0.12
771 0.13
772 0.1
773 0.1
774 0.1
775 0.12
776 0.13
777 0.14
778 0.14
779 0.15
780 0.16
781 0.19
782 0.19
783 0.17
784 0.18
785 0.17
786 0.15
787 0.14
788 0.15
789 0.12
790 0.12
791 0.14
792 0.13
793 0.14
794 0.16
795 0.16
796 0.14
797 0.15
798 0.18
799 0.18
800 0.24
801 0.26
802 0.31
803 0.3
804 0.33
805 0.33
806 0.36
807 0.4
808 0.34
809 0.31
810 0.3
811 0.33
812 0.34
813 0.33
814 0.28
815 0.25
816 0.25
817 0.24
818 0.19
819 0.19
820 0.16
821 0.19
822 0.21
823 0.2
824 0.24
825 0.24
826 0.28
827 0.27
828 0.29
829 0.3
830 0.35
831 0.4
832 0.38
833 0.4
834 0.44
835 0.49
836 0.48
837 0.43
838 0.37
839 0.33
840 0.31
841 0.28
842 0.2
843 0.14
844 0.12
845 0.12
846 0.11
847 0.08
848 0.09
849 0.09
850 0.1
851 0.13
852 0.15
853 0.16
854 0.17
855 0.17
856 0.18
857 0.18
858 0.21
859 0.22
860 0.25
861 0.33