Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPB5

Protein Details
Accession C9SPB5    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-81GKTSSPPSSRPWRRRTWSRASPPTRRCCCRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12.833, nucl 10, cyto_mito 9.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR015847  ExoRNase_PH_dom2  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG val:VDBG_06740  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
PF03725  RNase_PH_C  
Amino Acid Sequences MPREAEPSVNEKEFILKALHEGVRLDGRPFDQYRTIDISFGDEYGVVDVSLGKTSSPPSSRPWRRRTWSRASPPTRRCCCRGCSRRRSAAPAPSTWSRSASSPAPKVWSVRADVHVVSHDGNIVDAACLAAVAALRHFRKPDAQVEGEDLTVFTPAEREPVPLGWLHSPFCVTFAHFAAKDDSSPDHDGGDVTLLDPDWREEQLRVASCTISLNKLGEVCQVSKLGGDAVEATTLLQCAARRGPQGQGAVGPGRQDAGRRRQEERQGRPDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.22
3 0.16
4 0.17
5 0.23
6 0.24
7 0.21
8 0.21
9 0.22
10 0.27
11 0.28
12 0.27
13 0.22
14 0.23
15 0.29
16 0.3
17 0.3
18 0.31
19 0.31
20 0.34
21 0.38
22 0.36
23 0.3
24 0.29
25 0.29
26 0.23
27 0.22
28 0.17
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.1
42 0.16
43 0.18
44 0.2
45 0.26
46 0.37
47 0.47
48 0.56
49 0.62
50 0.66
51 0.73
52 0.81
53 0.83
54 0.82
55 0.82
56 0.83
57 0.86
58 0.84
59 0.85
60 0.84
61 0.86
62 0.84
63 0.78
64 0.72
65 0.67
66 0.65
67 0.66
68 0.68
69 0.68
70 0.7
71 0.74
72 0.79
73 0.78
74 0.79
75 0.74
76 0.72
77 0.65
78 0.56
79 0.52
80 0.46
81 0.46
82 0.38
83 0.34
84 0.26
85 0.24
86 0.25
87 0.25
88 0.28
89 0.28
90 0.28
91 0.29
92 0.29
93 0.29
94 0.29
95 0.26
96 0.23
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.18
103 0.16
104 0.13
105 0.11
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.03
115 0.02
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.04
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.15
127 0.19
128 0.23
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.26
133 0.26
134 0.22
135 0.18
136 0.14
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.13
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.18
172 0.18
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.13
177 0.13
178 0.08
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.11
189 0.14
190 0.2
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.21
195 0.2
196 0.23
197 0.21
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.17
205 0.18
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.12
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.11
226 0.15
227 0.19
228 0.22
229 0.24
230 0.28
231 0.32
232 0.34
233 0.32
234 0.29
235 0.29
236 0.28
237 0.27
238 0.23
239 0.18
240 0.17
241 0.17
242 0.21
243 0.26
244 0.34
245 0.43
246 0.46
247 0.52
248 0.59
249 0.69
250 0.74
251 0.75