Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SJ70

Protein Details
Accession C9SJ70    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPTPKKMRGRPAANKVTKPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-95RPRGRPPKAKN
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
IPR003423  OMP_efflux  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
GO:0015562  F:efflux transmembrane transporter activity  
KEGG val:VDBG_04341  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
PF02321  OEP  
Amino Acid Sequences MPTPKKMRGRPAANKVTKPAQASSGRTSKRATAIAETAAREALLEKSTNHIAERTTRGRSAQGDISVHAAGCDTTITENKPVLGRPRGRPPKAKNASTSKKDAPLSQLAEIPETQQMATVAIDDIGNKLEEKIESPLMDQSPKQPPLSPAQYSSRALSLSPRKQYPSSPSREASSAQLRRRIGDLNNKCDSLEAKYCDLRELVVKEAERNFDRLQKQSEERARVASALISSLQADLEIQRGLAREGRIDKTRLDQSEERVVELSASLAEARKEIKNLSAKLSASRTVDASTARVPGGGTKGNHSSAALVVGPDAVQAAQMKDDLYADLTGLIVRNVRREPIEDVFDCLQTGRNGTLHFKLCVQNEVASESYEEAQFTYMPQLDESRDRELINLLPEFLTDEITFPRPQAAKFYARVSKSLMEPPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.78
3 0.75
4 0.69
5 0.63
6 0.54
7 0.51
8 0.5
9 0.51
10 0.52
11 0.54
12 0.52
13 0.51
14 0.52
15 0.48
16 0.47
17 0.46
18 0.41
19 0.37
20 0.37
21 0.39
22 0.4
23 0.36
24 0.31
25 0.27
26 0.24
27 0.18
28 0.17
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.17
34 0.21
35 0.22
36 0.22
37 0.21
38 0.21
39 0.27
40 0.34
41 0.35
42 0.36
43 0.37
44 0.37
45 0.4
46 0.41
47 0.4
48 0.36
49 0.36
50 0.32
51 0.31
52 0.32
53 0.27
54 0.24
55 0.19
56 0.14
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.05
61 0.07
62 0.1
63 0.13
64 0.15
65 0.16
66 0.18
67 0.2
68 0.22
69 0.27
70 0.34
71 0.39
72 0.42
73 0.53
74 0.62
75 0.67
76 0.73
77 0.74
78 0.76
79 0.78
80 0.77
81 0.74
82 0.74
83 0.77
84 0.73
85 0.72
86 0.65
87 0.63
88 0.6
89 0.54
90 0.49
91 0.46
92 0.43
93 0.37
94 0.36
95 0.3
96 0.3
97 0.27
98 0.23
99 0.17
100 0.15
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.18
124 0.18
125 0.19
126 0.18
127 0.21
128 0.28
129 0.3
130 0.3
131 0.29
132 0.31
133 0.37
134 0.42
135 0.37
136 0.33
137 0.35
138 0.38
139 0.37
140 0.35
141 0.29
142 0.23
143 0.22
144 0.25
145 0.3
146 0.32
147 0.36
148 0.37
149 0.39
150 0.41
151 0.44
152 0.45
153 0.45
154 0.45
155 0.45
156 0.44
157 0.42
158 0.42
159 0.4
160 0.36
161 0.37
162 0.37
163 0.35
164 0.4
165 0.39
166 0.38
167 0.39
168 0.38
169 0.32
170 0.36
171 0.39
172 0.4
173 0.42
174 0.41
175 0.39
176 0.36
177 0.32
178 0.26
179 0.25
180 0.2
181 0.2
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.18
194 0.21
195 0.18
196 0.21
197 0.2
198 0.24
199 0.26
200 0.27
201 0.29
202 0.29
203 0.31
204 0.35
205 0.4
206 0.38
207 0.36
208 0.34
209 0.31
210 0.27
211 0.25
212 0.18
213 0.12
214 0.08
215 0.08
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.1
230 0.1
231 0.12
232 0.15
233 0.19
234 0.21
235 0.23
236 0.23
237 0.25
238 0.3
239 0.29
240 0.31
241 0.3
242 0.31
243 0.38
244 0.37
245 0.33
246 0.28
247 0.26
248 0.2
249 0.18
250 0.14
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.17
262 0.24
263 0.25
264 0.29
265 0.3
266 0.3
267 0.32
268 0.34
269 0.32
270 0.26
271 0.26
272 0.22
273 0.19
274 0.2
275 0.17
276 0.16
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.12
283 0.15
284 0.17
285 0.16
286 0.19
287 0.22
288 0.23
289 0.23
290 0.21
291 0.18
292 0.14
293 0.15
294 0.12
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.1
321 0.15
322 0.16
323 0.19
324 0.2
325 0.22
326 0.27
327 0.28
328 0.34
329 0.29
330 0.33
331 0.32
332 0.31
333 0.28
334 0.23
335 0.22
336 0.17
337 0.18
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.21
342 0.27
343 0.26
344 0.27
345 0.29
346 0.33
347 0.32
348 0.34
349 0.33
350 0.29
351 0.27
352 0.29
353 0.26
354 0.21
355 0.2
356 0.18
357 0.17
358 0.15
359 0.14
360 0.11
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.14
365 0.15
366 0.15
367 0.16
368 0.18
369 0.21
370 0.27
371 0.3
372 0.3
373 0.3
374 0.3
375 0.3
376 0.3
377 0.3
378 0.28
379 0.25
380 0.21
381 0.18
382 0.18
383 0.19
384 0.17
385 0.17
386 0.12
387 0.13
388 0.15
389 0.19
390 0.19
391 0.17
392 0.25
393 0.24
394 0.25
395 0.31
396 0.34
397 0.38
398 0.41
399 0.48
400 0.49
401 0.48
402 0.5
403 0.47
404 0.45
405 0.42