Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SNR7

Protein Details
Accession C9SNR7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
435-462APWPSARETKRRALRRGPSRSKPGKRRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
441-462RETKRRALRRGPSRSKPGKRRR
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8, pero 4, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG val:VDBG_06542  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MGTMTTRCPPKEPLVVILGSTGTGKSDLAVELATRFRGEVINADAMQLYQGLPVITNKMTTVERRGIPHHLLDHIPLDEPAWIVGDFKREANKVIREIRSRGNLPIVVGGTHYYTNALLFEDIFVGPDHNDDGEAAAAADEATASDAGRFPILDEPTEVILAKLRDVDPVMADKWHPNDRRKISRSLQIYLSHGRPASEIYAEQKRRNVAAAAAAQTAPRGPWENLLFWVYSEPEVLKPRLDRRVDKMLDVGLMDEVLQMQDHVRAKEASGEEVDYTKGIWQSIGFKEFQPYLLAAAATPADPDVEKRKAQGLEDMKASTRRYAKSQVRWITTKVVPRLQEQPGAMDSLFLLDSTDVAQWAANVAEPAAGHRCKQFLGGRSPRLSRSGLSPPGPERSSEAENAGRTPGSKKGATLCQVTCTTEPGLGRSTCAAGAPWPSARETKRRALRRGPSRSKPGKRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.38
4 0.34
5 0.27
6 0.18
7 0.17
8 0.12
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.09
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.18
28 0.23
29 0.22
30 0.23
31 0.21
32 0.2
33 0.19
34 0.15
35 0.11
36 0.06
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.09
41 0.13
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.15
46 0.18
47 0.21
48 0.26
49 0.29
50 0.32
51 0.35
52 0.38
53 0.41
54 0.41
55 0.42
56 0.38
57 0.35
58 0.32
59 0.31
60 0.3
61 0.24
62 0.22
63 0.18
64 0.15
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.22
76 0.21
77 0.26
78 0.32
79 0.36
80 0.38
81 0.46
82 0.5
83 0.5
84 0.53
85 0.55
86 0.55
87 0.52
88 0.48
89 0.44
90 0.38
91 0.34
92 0.33
93 0.27
94 0.19
95 0.18
96 0.16
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.08
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.1
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.17
162 0.24
163 0.3
164 0.33
165 0.42
166 0.5
167 0.59
168 0.61
169 0.64
170 0.6
171 0.62
172 0.6
173 0.53
174 0.49
175 0.41
176 0.41
177 0.37
178 0.33
179 0.28
180 0.25
181 0.22
182 0.18
183 0.17
184 0.14
185 0.11
186 0.11
187 0.13
188 0.21
189 0.24
190 0.26
191 0.27
192 0.28
193 0.27
194 0.28
195 0.24
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.08
206 0.07
207 0.09
208 0.08
209 0.12
210 0.14
211 0.15
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.16
226 0.21
227 0.28
228 0.32
229 0.32
230 0.35
231 0.44
232 0.43
233 0.41
234 0.37
235 0.29
236 0.26
237 0.23
238 0.17
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.18
255 0.18
256 0.15
257 0.13
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.12
270 0.15
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.13
292 0.17
293 0.18
294 0.19
295 0.25
296 0.26
297 0.27
298 0.33
299 0.31
300 0.3
301 0.32
302 0.31
303 0.28
304 0.3
305 0.3
306 0.27
307 0.28
308 0.27
309 0.3
310 0.39
311 0.46
312 0.51
313 0.6
314 0.61
315 0.61
316 0.62
317 0.6
318 0.56
319 0.52
320 0.5
321 0.46
322 0.43
323 0.4
324 0.4
325 0.45
326 0.41
327 0.42
328 0.35
329 0.32
330 0.28
331 0.28
332 0.24
333 0.17
334 0.14
335 0.11
336 0.1
337 0.07
338 0.07
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.09
355 0.14
356 0.15
357 0.16
358 0.19
359 0.2
360 0.19
361 0.26
362 0.29
363 0.3
364 0.39
365 0.47
366 0.52
367 0.56
368 0.59
369 0.55
370 0.53
371 0.48
372 0.39
373 0.36
374 0.38
375 0.39
376 0.39
377 0.41
378 0.4
379 0.45
380 0.45
381 0.39
382 0.35
383 0.34
384 0.35
385 0.32
386 0.33
387 0.3
388 0.3
389 0.31
390 0.28
391 0.23
392 0.21
393 0.22
394 0.24
395 0.25
396 0.25
397 0.26
398 0.31
399 0.38
400 0.41
401 0.45
402 0.39
403 0.39
404 0.4
405 0.42
406 0.36
407 0.31
408 0.28
409 0.25
410 0.25
411 0.22
412 0.25
413 0.22
414 0.23
415 0.21
416 0.22
417 0.19
418 0.19
419 0.17
420 0.14
421 0.17
422 0.19
423 0.21
424 0.21
425 0.23
426 0.3
427 0.35
428 0.42
429 0.46
430 0.52
431 0.59
432 0.67
433 0.74
434 0.77
435 0.82
436 0.83
437 0.87
438 0.87
439 0.87
440 0.89
441 0.91
442 0.91