Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SGT1

Protein Details
Accession C9SGT1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-335TQKNSPTFWKEQQRRHSQRLSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 16, E.R. 5, vacu 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG val:VDBG_04284  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MAGDCNSVFLAGFALLVPVTLALGYRFKTPIFASILTTGLLLEVLGFAGRLLLFDNVANKTYFALFLLGTVLGSTFIAASIFIILPHALSVYGARASSVQPKHIALVLSAVALVAAIVEIIGTVCVAFAVLETAGLVVFVAVHSWFTINLNGERSKLDPKHATVYRSARFKRFLLGTQAATVLLLSHTIYRIVETASGFDGPLAQNEAACMVVNGALPFVVCALLAIFHPGVAFGKAWGPTSPRLRKRYTRPAPLRSPVATFEYSRSPDQTAFDKMTTPTSATMPLQNATMATTVKQSPVTQTTTQQPLSVGMTQKNSPTFWKEQQRRHSQRLSSTFLRQSPKTSPTFEMNQMQQPRASPTAQHGSRPHSQSLSGHRTSLKSEQAATRGKLVDSETLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.04
6 0.04
7 0.04
8 0.05
9 0.06
10 0.1
11 0.11
12 0.15
13 0.16
14 0.16
15 0.2
16 0.21
17 0.25
18 0.27
19 0.27
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.24
24 0.23
25 0.17
26 0.11
27 0.1
28 0.06
29 0.05
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.03
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.13
43 0.14
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.11
51 0.11
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.06
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.11
84 0.19
85 0.21
86 0.22
87 0.23
88 0.24
89 0.25
90 0.26
91 0.25
92 0.16
93 0.16
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.08
135 0.1
136 0.11
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.23
143 0.23
144 0.27
145 0.27
146 0.28
147 0.36
148 0.38
149 0.38
150 0.36
151 0.42
152 0.41
153 0.46
154 0.47
155 0.43
156 0.43
157 0.42
158 0.4
159 0.36
160 0.33
161 0.32
162 0.32
163 0.28
164 0.26
165 0.25
166 0.2
167 0.18
168 0.15
169 0.08
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.03
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.13
227 0.17
228 0.27
229 0.36
230 0.42
231 0.47
232 0.53
233 0.6
234 0.67
235 0.73
236 0.73
237 0.75
238 0.75
239 0.78
240 0.79
241 0.75
242 0.7
243 0.6
244 0.53
245 0.44
246 0.4
247 0.33
248 0.26
249 0.24
250 0.24
251 0.26
252 0.25
253 0.25
254 0.22
255 0.22
256 0.23
257 0.24
258 0.23
259 0.23
260 0.22
261 0.22
262 0.21
263 0.22
264 0.21
265 0.19
266 0.16
267 0.15
268 0.17
269 0.16
270 0.18
271 0.17
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.14
276 0.12
277 0.13
278 0.1
279 0.09
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.18
286 0.22
287 0.26
288 0.25
289 0.28
290 0.33
291 0.37
292 0.37
293 0.33
294 0.3
295 0.26
296 0.27
297 0.28
298 0.24
299 0.22
300 0.25
301 0.25
302 0.28
303 0.29
304 0.27
305 0.27
306 0.3
307 0.34
308 0.39
309 0.49
310 0.54
311 0.61
312 0.7
313 0.78
314 0.8
315 0.82
316 0.82
317 0.76
318 0.77
319 0.75
320 0.72
321 0.65
322 0.64
323 0.61
324 0.59
325 0.6
326 0.51
327 0.49
328 0.49
329 0.51
330 0.48
331 0.46
332 0.44
333 0.44
334 0.48
335 0.48
336 0.48
337 0.45
338 0.49
339 0.49
340 0.47
341 0.43
342 0.4
343 0.39
344 0.37
345 0.34
346 0.27
347 0.3
348 0.39
349 0.39
350 0.44
351 0.43
352 0.45
353 0.53
354 0.56
355 0.52
356 0.44
357 0.45
358 0.44
359 0.49
360 0.52
361 0.45
362 0.44
363 0.43
364 0.43
365 0.45
366 0.46
367 0.43
368 0.37
369 0.4
370 0.42
371 0.46
372 0.51
373 0.48
374 0.47
375 0.43
376 0.4
377 0.38
378 0.36