Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S6Q0

Protein Details
Accession C9S6Q0    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-60LEAPEPPSKRAKRAQKKGKTLPPKQDSDDHydrophilic
292-313AQSEKKFKMRKWWVNRIAGRNLHydrophilic
320-340DDQVRYKKRFGKDAPRRQVQAHydrophilic
348-368GEVPKREKKPVPPRELKAQDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-72PSKRAKRAQKKGKTLPPKQDSDDEKEAKKEEKEKL
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG val:VDBG_00649  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTTEKTNKTPMSEDASSPKKRKAELEELEVDLEAPEPPSKRAKRAQKKGKTLPPKQDSDDEKEAKKEEKEKLKSNRSEHGVWVGNMPFAVTPDMLRKWLIENSGEVITNESITRINMPMTKDGGNKVKKNKGFAYVDFADIGAKVAAIALTENELLYRKLLIKDSTSYDGRPKKDEAEIAAAAKKKAEDEIPTSRKIFVGNLSFQTTEEDVRANFEKCGEIDWVKVATFEDSGKCKGYGWVKFREAESAGWAVKGFCRIKEELETEDDFVKGKKDKDADAEDNSDEEEDTDAQSEKKFKMRKWWVNRIAGRNLKIELAEDDQVRYKKRFGKDAPRRQVQADGTTAEGGEVPKREKKPVPPRELKAQDDLMVARLTGTAAKHTGTKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.49
3 0.54
4 0.55
5 0.57
6 0.54
7 0.55
8 0.6
9 0.61
10 0.62
11 0.6
12 0.63
13 0.6
14 0.56
15 0.53
16 0.45
17 0.36
18 0.25
19 0.19
20 0.12
21 0.09
22 0.12
23 0.13
24 0.16
25 0.26
26 0.31
27 0.38
28 0.47
29 0.57
30 0.65
31 0.75
32 0.82
33 0.83
34 0.89
35 0.91
36 0.92
37 0.92
38 0.9
39 0.9
40 0.86
41 0.82
42 0.75
43 0.73
44 0.69
45 0.66
46 0.67
47 0.61
48 0.55
49 0.53
50 0.52
51 0.48
52 0.48
53 0.48
54 0.47
55 0.53
56 0.58
57 0.64
58 0.71
59 0.76
60 0.79
61 0.76
62 0.76
63 0.7
64 0.65
65 0.57
66 0.54
67 0.48
68 0.4
69 0.38
70 0.31
71 0.25
72 0.23
73 0.21
74 0.13
75 0.11
76 0.12
77 0.08
78 0.09
79 0.13
80 0.15
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.17
85 0.2
86 0.21
87 0.17
88 0.17
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.11
101 0.09
102 0.11
103 0.13
104 0.15
105 0.18
106 0.2
107 0.22
108 0.22
109 0.26
110 0.33
111 0.37
112 0.41
113 0.46
114 0.52
115 0.52
116 0.56
117 0.55
118 0.54
119 0.51
120 0.46
121 0.46
122 0.38
123 0.36
124 0.3
125 0.27
126 0.19
127 0.15
128 0.14
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.04
136 0.03
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.11
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.18
151 0.21
152 0.24
153 0.22
154 0.22
155 0.27
156 0.32
157 0.32
158 0.33
159 0.31
160 0.29
161 0.31
162 0.31
163 0.25
164 0.24
165 0.23
166 0.21
167 0.22
168 0.21
169 0.18
170 0.17
171 0.15
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.15
177 0.25
178 0.28
179 0.29
180 0.3
181 0.29
182 0.28
183 0.26
184 0.21
185 0.16
186 0.17
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.18
192 0.19
193 0.16
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.11
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.18
224 0.24
225 0.28
226 0.31
227 0.36
228 0.37
229 0.39
230 0.39
231 0.38
232 0.33
233 0.26
234 0.24
235 0.19
236 0.17
237 0.15
238 0.15
239 0.12
240 0.11
241 0.18
242 0.17
243 0.15
244 0.2
245 0.2
246 0.23
247 0.27
248 0.29
249 0.24
250 0.27
251 0.27
252 0.24
253 0.23
254 0.21
255 0.17
256 0.15
257 0.17
258 0.16
259 0.17
260 0.21
261 0.23
262 0.25
263 0.31
264 0.38
265 0.39
266 0.38
267 0.4
268 0.34
269 0.32
270 0.3
271 0.24
272 0.16
273 0.12
274 0.1
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.16
282 0.17
283 0.24
284 0.29
285 0.3
286 0.41
287 0.51
288 0.6
289 0.66
290 0.75
291 0.76
292 0.81
293 0.85
294 0.81
295 0.8
296 0.76
297 0.69
298 0.6
299 0.52
300 0.43
301 0.36
302 0.31
303 0.24
304 0.21
305 0.21
306 0.19
307 0.2
308 0.24
309 0.28
310 0.31
311 0.3
312 0.33
313 0.38
314 0.42
315 0.51
316 0.54
317 0.62
318 0.69
319 0.78
320 0.82
321 0.82
322 0.79
323 0.71
324 0.7
325 0.62
326 0.56
327 0.47
328 0.38
329 0.32
330 0.29
331 0.27
332 0.19
333 0.17
334 0.13
335 0.13
336 0.16
337 0.19
338 0.27
339 0.3
340 0.37
341 0.43
342 0.53
343 0.61
344 0.68
345 0.74
346 0.76
347 0.79
348 0.83
349 0.84
350 0.77
351 0.72
352 0.65
353 0.56
354 0.49
355 0.43
356 0.35
357 0.27
358 0.23
359 0.17
360 0.14
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.15
366 0.16
367 0.19
368 0.2
369 0.26