Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9ST50

Protein Details
Accession C9ST50    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-263ADPNLVKKIDTKKIKKRANRRSAMTTNVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-256IDTKKIKKRANRR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito_nucl 9.5, mito 8.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG val:VDBG_08075  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
Amino Acid Sequences MSYLEKQKAGFSSSLASASGKLSVKTSAFTPTPAPVKKEPKRKIPVDGDDNINTIILLMTYIHEYLRAQTEPKKAQDIIDNLEKEGHLRNPSLSKCQRIIDVLRHQTVVQFKADPSLTEQKWDSGTYFYLGKLGGIKDKIGLLGHLQAKSSMEPLLYKELKEGWPQCDAALAELKRENKIITVEDKKTIKHIFIDDPTLRHTVEDDFKNMWKRVVVPSNDDIVKKLVAAGQKPASADPNLVKKIDTKKIKKRANRRSAMTTNVHMQHLLKDFSGGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.18
4 0.15
5 0.15
6 0.2
7 0.17
8 0.17
9 0.17
10 0.2
11 0.2
12 0.2
13 0.21
14 0.21
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.25
19 0.33
20 0.35
21 0.39
22 0.42
23 0.52
24 0.59
25 0.67
26 0.69
27 0.72
28 0.78
29 0.77
30 0.78
31 0.76
32 0.77
33 0.73
34 0.69
35 0.63
36 0.55
37 0.52
38 0.42
39 0.32
40 0.23
41 0.16
42 0.12
43 0.06
44 0.05
45 0.04
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.09
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.21
57 0.3
58 0.35
59 0.37
60 0.4
61 0.36
62 0.37
63 0.41
64 0.38
65 0.34
66 0.36
67 0.34
68 0.29
69 0.29
70 0.27
71 0.22
72 0.22
73 0.21
74 0.16
75 0.17
76 0.19
77 0.24
78 0.26
79 0.35
80 0.35
81 0.36
82 0.36
83 0.37
84 0.36
85 0.33
86 0.35
87 0.33
88 0.38
89 0.39
90 0.37
91 0.36
92 0.34
93 0.34
94 0.34
95 0.27
96 0.2
97 0.16
98 0.15
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.17
103 0.24
104 0.22
105 0.24
106 0.24
107 0.22
108 0.23
109 0.23
110 0.19
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.06
130 0.11
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.16
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.17
147 0.19
148 0.24
149 0.25
150 0.2
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.21
155 0.2
156 0.15
157 0.19
158 0.16
159 0.16
160 0.19
161 0.21
162 0.19
163 0.2
164 0.19
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.21
169 0.26
170 0.27
171 0.32
172 0.33
173 0.32
174 0.36
175 0.35
176 0.29
177 0.26
178 0.27
179 0.26
180 0.26
181 0.33
182 0.29
183 0.29
184 0.3
185 0.29
186 0.25
187 0.21
188 0.2
189 0.17
190 0.22
191 0.22
192 0.23
193 0.23
194 0.28
195 0.34
196 0.34
197 0.31
198 0.26
199 0.26
200 0.32
201 0.38
202 0.36
203 0.35
204 0.37
205 0.41
206 0.42
207 0.39
208 0.33
209 0.27
210 0.24
211 0.19
212 0.17
213 0.14
214 0.16
215 0.18
216 0.22
217 0.23
218 0.25
219 0.26
220 0.26
221 0.26
222 0.23
223 0.25
224 0.24
225 0.3
226 0.31
227 0.3
228 0.3
229 0.33
230 0.41
231 0.47
232 0.53
233 0.54
234 0.62
235 0.73
236 0.82
237 0.85
238 0.88
239 0.89
240 0.9
241 0.89
242 0.85
243 0.85
244 0.81
245 0.78
246 0.72
247 0.65
248 0.62
249 0.57
250 0.5
251 0.42
252 0.37
253 0.36
254 0.36
255 0.33
256 0.25
257 0.26