Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHL7

Protein Details
Accession C9SHL7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-155PEEEKRSQRGSPKKRRRLSEAARRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-158EKRSQRGSPKKRRRLSEAARRREEG
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017945  DHBP_synth_RibB-like_a/b_dom  
IPR006070  Sua5-like_dom  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
GO:0061710  F:L-threonylcarbamoyladenylate synthase  
KEGG val:VDBG_04549  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01300  Sua5_yciO_yrdC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51163  YRDC  
Amino Acid Sequences MLLWSSYVLSPRQPTKQNRAMSWSRGPGPAWGATCRSYQASVLSGHGSWQLDFSRSIRAWPGFLILGGIPMARRNSAAESRVQQKRASENECDWNKESHSEREREREREAMASQAAETCRGGIGPIAARQPEEEKRSQRGSPKKRRRLSEAARRREEGLREAASATANAKIALGGSPIRRLPAHQRHPRRLPDETVYGLGADATRSAAVKGIYAAKGRPSDNPLIIHVSDLTMLRRFLAPPPPSDTPDAVVTAAAAADPIPAIYKPLLERFWPGPLTILLPLPSPSPLAPEVTAGLPTFAVRMPASPLALSLIALADTPLAGPSANASTKPSPTAARHVLDDLAGRIELILDAGPCDVGVESTVVDGLCDPPVILRPGGIALDRLRACPGWARAVKGYRDASEEGAAAPRAPRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.62
3 0.69
4 0.71
5 0.68
6 0.7
7 0.68
8 0.66
9 0.66
10 0.62
11 0.57
12 0.53
13 0.5
14 0.45
15 0.42
16 0.4
17 0.34
18 0.3
19 0.3
20 0.29
21 0.29
22 0.28
23 0.27
24 0.23
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.2
31 0.18
32 0.18
33 0.2
34 0.19
35 0.16
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.19
41 0.24
42 0.23
43 0.25
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.26
48 0.28
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.07
57 0.1
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.18
63 0.23
64 0.25
65 0.27
66 0.31
67 0.39
68 0.45
69 0.46
70 0.42
71 0.42
72 0.48
73 0.51
74 0.5
75 0.46
76 0.45
77 0.52
78 0.53
79 0.53
80 0.47
81 0.42
82 0.38
83 0.39
84 0.38
85 0.38
86 0.43
87 0.43
88 0.45
89 0.53
90 0.58
91 0.56
92 0.56
93 0.5
94 0.44
95 0.43
96 0.4
97 0.33
98 0.27
99 0.23
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.14
104 0.14
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.06
110 0.08
111 0.09
112 0.12
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.2
118 0.24
119 0.27
120 0.31
121 0.34
122 0.39
123 0.43
124 0.46
125 0.5
126 0.55
127 0.61
128 0.66
129 0.72
130 0.77
131 0.8
132 0.82
133 0.81
134 0.81
135 0.8
136 0.8
137 0.79
138 0.79
139 0.75
140 0.71
141 0.66
142 0.59
143 0.51
144 0.44
145 0.38
146 0.3
147 0.26
148 0.25
149 0.22
150 0.18
151 0.16
152 0.13
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.24
169 0.32
170 0.41
171 0.49
172 0.58
173 0.65
174 0.73
175 0.78
176 0.72
177 0.65
178 0.58
179 0.52
180 0.46
181 0.38
182 0.31
183 0.24
184 0.19
185 0.16
186 0.12
187 0.08
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.16
204 0.17
205 0.18
206 0.21
207 0.22
208 0.24
209 0.24
210 0.22
211 0.22
212 0.21
213 0.19
214 0.14
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.12
225 0.21
226 0.21
227 0.22
228 0.28
229 0.3
230 0.31
231 0.33
232 0.3
233 0.23
234 0.23
235 0.21
236 0.15
237 0.12
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.05
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.05
250 0.05
251 0.07
252 0.09
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.18
257 0.19
258 0.23
259 0.22
260 0.2
261 0.18
262 0.17
263 0.18
264 0.15
265 0.15
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.13
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.12
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.06
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.16
315 0.19
316 0.21
317 0.23
318 0.23
319 0.24
320 0.27
321 0.35
322 0.36
323 0.35
324 0.35
325 0.35
326 0.33
327 0.29
328 0.27
329 0.19
330 0.14
331 0.12
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.08
359 0.12
360 0.15
361 0.14
362 0.13
363 0.13
364 0.15
365 0.16
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.22
370 0.23
371 0.23
372 0.24
373 0.23
374 0.24
375 0.28
376 0.31
377 0.33
378 0.35
379 0.38
380 0.43
381 0.5
382 0.51
383 0.52
384 0.52
385 0.44
386 0.46
387 0.43
388 0.38
389 0.33
390 0.31
391 0.24
392 0.24
393 0.22
394 0.18