Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SD08

Protein Details
Accession C9SD08    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-124DEEPPKKKKPVARSKARKTAASBasic
127-148EDGSPPKAKRARKPHKVLDSEPBasic
173-200SEKEARPTKKRKAGPAPKKPAKKRKTVSBasic
230-253MDASPKPKPKPRAKSKTQPKKAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-142PKKKKPVARSKARKTAASDEEDGSPPKAKRARKPHK
177-197ARPTKKRKAGPAPKKPAKKRK
234-271PKPKPKPRAKSKTQPKKAAPGKKATPVKPKKQPAKSPS
303-325PKPKRGAKSKDAAPAKPRAPRKS
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037647  HIRIP3  
KEGG val:VDBG_03082  -  
Amino Acid Sequences MALSKQEIEAAIRDAVREVSGINRDNLTVNYIRKFTEKKLNLEEGFFSEPEWKSRSRALIKEIAESLDTASQQQESSPAKPKTNPTPAPKPVKNAADDDDDDDEEPPKKKKPVARSKARKTAASDEEDGSPPKAKRARKPHKVLDSEPESDDPEDDFGSDGGDNSDDLSQDDSEKEARPTKKRKAGPAPKKPAKKRKTVSDDEDEEASADESSALSDAPPEEDSELSDVMDASPKPKPKPRAKSKTQPKKAAPGKKATPVKPKKQPAKSPSGKDEGDDLAAKSKPDAEDAESSELSDVLDEPPKPKRGAKSKDAAPAKPRAPRKSGAAASDDPDEAEVKKLQSQLVKCGIRKIWGVELRGCGGDPKAKIKHLRGMLRDAGMDGRFSEARAREIKERRELEADLEAVKEMDAAWGVGGRASRSKAKVAMKDASDEGSGAGEEGGNDGSEEDDEDFGVSSKARGRSGAQADLAFLDDDDESGSDDSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.16
4 0.14
5 0.12
6 0.14
7 0.21
8 0.23
9 0.24
10 0.24
11 0.25
12 0.26
13 0.26
14 0.26
15 0.25
16 0.27
17 0.29
18 0.3
19 0.3
20 0.35
21 0.39
22 0.4
23 0.46
24 0.47
25 0.51
26 0.58
27 0.65
28 0.6
29 0.58
30 0.53
31 0.46
32 0.43
33 0.35
34 0.28
35 0.26
36 0.26
37 0.27
38 0.29
39 0.26
40 0.26
41 0.32
42 0.41
43 0.42
44 0.46
45 0.48
46 0.52
47 0.52
48 0.53
49 0.49
50 0.4
51 0.33
52 0.28
53 0.23
54 0.18
55 0.17
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.18
62 0.19
63 0.24
64 0.32
65 0.36
66 0.39
67 0.44
68 0.51
69 0.54
70 0.61
71 0.64
72 0.63
73 0.69
74 0.74
75 0.79
76 0.75
77 0.71
78 0.69
79 0.66
80 0.6
81 0.53
82 0.48
83 0.43
84 0.41
85 0.37
86 0.32
87 0.27
88 0.25
89 0.22
90 0.21
91 0.19
92 0.21
93 0.22
94 0.25
95 0.29
96 0.35
97 0.42
98 0.51
99 0.58
100 0.66
101 0.74
102 0.79
103 0.84
104 0.88
105 0.85
106 0.78
107 0.72
108 0.71
109 0.65
110 0.59
111 0.52
112 0.43
113 0.42
114 0.39
115 0.35
116 0.27
117 0.27
118 0.22
119 0.26
120 0.32
121 0.36
122 0.44
123 0.54
124 0.64
125 0.69
126 0.78
127 0.8
128 0.84
129 0.83
130 0.76
131 0.74
132 0.68
133 0.6
134 0.52
135 0.44
136 0.36
137 0.3
138 0.27
139 0.18
140 0.14
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.15
163 0.21
164 0.27
165 0.35
166 0.44
167 0.52
168 0.6
169 0.63
170 0.7
171 0.74
172 0.79
173 0.81
174 0.83
175 0.84
176 0.83
177 0.88
178 0.88
179 0.88
180 0.84
181 0.83
182 0.78
183 0.78
184 0.79
185 0.76
186 0.73
187 0.69
188 0.66
189 0.57
190 0.51
191 0.4
192 0.31
193 0.24
194 0.18
195 0.1
196 0.06
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.12
221 0.15
222 0.19
223 0.25
224 0.34
225 0.42
226 0.53
227 0.62
228 0.69
229 0.74
230 0.81
231 0.86
232 0.88
233 0.87
234 0.85
235 0.77
236 0.77
237 0.77
238 0.76
239 0.69
240 0.65
241 0.6
242 0.59
243 0.64
244 0.59
245 0.62
246 0.62
247 0.66
248 0.68
249 0.74
250 0.75
251 0.76
252 0.79
253 0.75
254 0.77
255 0.75
256 0.71
257 0.67
258 0.63
259 0.54
260 0.46
261 0.42
262 0.31
263 0.26
264 0.21
265 0.16
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.11
270 0.13
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.15
276 0.18
277 0.21
278 0.18
279 0.18
280 0.16
281 0.15
282 0.12
283 0.09
284 0.07
285 0.06
286 0.09
287 0.09
288 0.12
289 0.17
290 0.21
291 0.23
292 0.26
293 0.33
294 0.41
295 0.48
296 0.53
297 0.55
298 0.58
299 0.65
300 0.66
301 0.61
302 0.55
303 0.55
304 0.52
305 0.51
306 0.53
307 0.5
308 0.5
309 0.49
310 0.5
311 0.52
312 0.5
313 0.46
314 0.43
315 0.38
316 0.36
317 0.34
318 0.29
319 0.2
320 0.17
321 0.15
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.11
326 0.14
327 0.16
328 0.18
329 0.23
330 0.24
331 0.28
332 0.36
333 0.4
334 0.37
335 0.42
336 0.41
337 0.39
338 0.39
339 0.35
340 0.34
341 0.34
342 0.36
343 0.33
344 0.34
345 0.32
346 0.3
347 0.28
348 0.2
349 0.17
350 0.19
351 0.18
352 0.24
353 0.26
354 0.32
355 0.38
356 0.42
357 0.48
358 0.51
359 0.56
360 0.52
361 0.54
362 0.52
363 0.47
364 0.42
365 0.35
366 0.31
367 0.24
368 0.2
369 0.14
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.19
374 0.17
375 0.21
376 0.26
377 0.29
378 0.35
379 0.43
380 0.5
381 0.53
382 0.55
383 0.54
384 0.53
385 0.5
386 0.44
387 0.4
388 0.34
389 0.25
390 0.22
391 0.19
392 0.15
393 0.14
394 0.1
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.13
406 0.17
407 0.23
408 0.25
409 0.29
410 0.35
411 0.42
412 0.47
413 0.5
414 0.53
415 0.48
416 0.49
417 0.46
418 0.41
419 0.33
420 0.26
421 0.2
422 0.14
423 0.13
424 0.09
425 0.08
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.09
445 0.16
446 0.2
447 0.21
448 0.23
449 0.26
450 0.35
451 0.4
452 0.43
453 0.39
454 0.36
455 0.35
456 0.33
457 0.31
458 0.22
459 0.16
460 0.12
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.09