Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SSP1

Protein Details
Accession C9SSP1    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKTDKKDKKGKKAAAPAAPPHydrophilic
42-68AFKKQHGKKSSKSKDATKKHRHNLVSVHydrophilic
193-216QGWPALRSRHKKEKTKAKKAAVEDHydrophilic
294-321LIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-15KKDKKGKKAA
44-62KKQHGKKSSKSKDATKKHR
182-211KRPTAKKLEDGQGWPALRSRHKKEKTKAKK
300-313KGFTKEKNKKKKGS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG val:VDBG_07916  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKTDKKDKKGKKAAAPAAPPAELMDLVENFLSEHAPSAHVAFKKQHGKKSSKSKDATKKHRHNLVSVFQTWETSLSTPEGEPVTITETVVQNVSSSSSSSSSDSSSEEDVDMADAAAAESSSDSSSDSDSSSSDSDSDSDDEPAPKIAVPVVNLKRKAPASDSSDSSDSDSSDSDSESDKKRPTAKKLEDGQGWPALRSRHKKEKTKAKKAAVEDAPSDSSVTLDNKTSPDFQAPPLPPDPSTLNNRGRGNMNNQKGKNVPFSRIKESTYVDPRFASNDYVPNDYSDRAHADLIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGMIDIGGRGGVKFDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.8
4 0.75
5 0.68
6 0.59
7 0.48
8 0.39
9 0.31
10 0.22
11 0.19
12 0.15
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.06
21 0.08
22 0.08
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.18
27 0.18
28 0.22
29 0.24
30 0.32
31 0.41
32 0.47
33 0.53
34 0.56
35 0.62
36 0.68
37 0.75
38 0.77
39 0.76
40 0.77
41 0.79
42 0.81
43 0.84
44 0.86
45 0.86
46 0.86
47 0.86
48 0.88
49 0.8
50 0.76
51 0.72
52 0.69
53 0.64
54 0.55
55 0.49
56 0.4
57 0.38
58 0.32
59 0.26
60 0.2
61 0.14
62 0.14
63 0.11
64 0.12
65 0.11
66 0.13
67 0.13
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.12
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.17
139 0.23
140 0.28
141 0.29
142 0.29
143 0.32
144 0.32
145 0.32
146 0.26
147 0.26
148 0.27
149 0.28
150 0.3
151 0.28
152 0.28
153 0.27
154 0.25
155 0.2
156 0.14
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.09
164 0.11
165 0.14
166 0.18
167 0.19
168 0.22
169 0.31
170 0.36
171 0.42
172 0.49
173 0.52
174 0.56
175 0.6
176 0.63
177 0.57
178 0.53
179 0.48
180 0.42
181 0.37
182 0.29
183 0.26
184 0.23
185 0.27
186 0.34
187 0.39
188 0.45
189 0.54
190 0.63
191 0.7
192 0.77
193 0.81
194 0.85
195 0.86
196 0.83
197 0.81
198 0.74
199 0.74
200 0.67
201 0.58
202 0.48
203 0.42
204 0.35
205 0.28
206 0.26
207 0.16
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.13
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.19
221 0.27
222 0.27
223 0.29
224 0.3
225 0.3
226 0.26
227 0.28
228 0.29
229 0.25
230 0.31
231 0.35
232 0.38
233 0.44
234 0.45
235 0.44
236 0.45
237 0.44
238 0.47
239 0.48
240 0.51
241 0.53
242 0.52
243 0.54
244 0.55
245 0.54
246 0.55
247 0.48
248 0.46
249 0.47
250 0.52
251 0.55
252 0.54
253 0.52
254 0.47
255 0.47
256 0.49
257 0.49
258 0.46
259 0.4
260 0.38
261 0.37
262 0.35
263 0.33
264 0.29
265 0.22
266 0.27
267 0.28
268 0.3
269 0.3
270 0.29
271 0.3
272 0.27
273 0.25
274 0.21
275 0.22
276 0.2
277 0.2
278 0.18
279 0.18
280 0.21
281 0.22
282 0.24
283 0.21
284 0.19
285 0.22
286 0.25
287 0.3
288 0.31
289 0.37
290 0.44
291 0.55
292 0.65
293 0.74
294 0.81
295 0.83
296 0.9
297 0.91
298 0.9
299 0.91
300 0.88
301 0.86
302 0.83
303 0.77
304 0.66
305 0.56
306 0.49
307 0.38
308 0.3
309 0.2
310 0.14
311 0.11