FuNGI

C9SBD2

Protein Details

Accession

C9SBD2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-40	MASDAASRRRSRREREDSDEEEHEAPRRQRRRVTEQESED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
KEGG	val:VDBG_01775 -
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MASDAASRRRSRREREDSDEEEHEAPRRQRRRVTEQESEDSDGDDTSEQQETERSSRTNGAAKPDFDEDGFQPGAIRRVKVENFVTYERAEFFPGPNLNMVIGPNGTGKSSLVCAICLGLGYSPKHLGRAGSIKEFVKHGKATATIEIELQRRRQDRRNHVVQVQIDRERNSSRFRLNGKEATHKAIQGLMRDLSIQVDNLCQFLPQDRVVEFAGCTPVDLLHETLRAAADPQMLRWQTELQELHKDHKELQQRSGSHAETLANLENRQQAMQADVDRFREREEALVRIDDLGDARKIAHYLFLRTKYRETERAYKDARQLLQQLESESAPALEAVNSKQRYHAAVAAAVQARHAAVRAVDGAADRALNACENSQEEMAQCQAKIDAEKKVFDVKKRELGLIKTRIGQLERRLKNKPSDFDPREWNQKIRAQEHSIRELEAEDRQIQTRIRDVQERGRRVRDEQNTLARDLSDLDTQEGQQLKVLEKHFPDVAAAWKWLRENGEEFQQEVYGPPMLCCNPGVVERRSDLAEKQELQRRLDEVKQNMAVLREENASTKKEAEENHAQRESILAVTEDLKEQKKVLQKEFSEYQAIPAKLEHEKKLGVKKQEELESCRAVIIDLEVQCDKAVLETARAGLKYQQNIADMHDAQQALIEGQIREIEARSDFEGLKDKNTTLVRRLDHEKMKIVEVEREKQTSKAEAKEAHEKVKEMCIQAADPTERQVYLTEMAAGKTLEDIDNEIKAESAKLELLHANPQRHALRAKWEPKLEELVRQINDAFAYNFEQINCGGEVRIHKDEDFDQWALDIMVKFRQSETLQKLDQHRQSGGERAVSTIFFLMALQSMARSPFRVVDEINQGMDPRNERMVHERMVEIACREHTSQYFLITPKLLTGLRYDERMRVLCIASGEHMPTEGKKLDFGRCLQIHKRSIGVAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.8
2	0.83
3	0.85
4	0.8
5	0.77
6	0.69
7	0.62
8	0.53
9	0.46
10	0.41
11	0.4
12	0.42
13	0.46
14	0.52
15	0.56
16	0.62
17	0.7
18	0.76
19	0.79
20	0.81
21	0.8
22	0.79
23	0.78
24	0.74
25	0.69
26	0.58
27	0.48
28	0.4
29	0.3
30	0.23
31	0.17
32	0.14
33	0.12
34	0.14
35	0.12
36	0.13
37	0.16
38	0.19
39	0.23
40	0.26
41	0.25
42	0.27
43	0.32
44	0.36
45	0.4
46	0.39
47	0.44
48	0.45
49	0.45
50	0.46
51	0.43
52	0.4
53	0.33
54	0.34
55	0.25
56	0.25
57	0.24
58	0.2
59	0.19
60	0.19
61	0.26
62	0.25
63	0.25
64	0.23
65	0.31
66	0.33
67	0.38
68	0.4
69	0.38
70	0.41
71	0.43
72	0.43
73	0.35
74	0.35
75	0.31
76	0.28
77	0.26
78	0.22
79	0.2
80	0.25
81	0.26
82	0.26
83	0.25
84	0.24
85	0.21
86	0.21
87	0.2
88	0.14
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.12
95	0.11
96	0.11
97	0.12
98	0.15
99	0.14
100	0.13
101	0.13
102	0.13
103	0.13
104	0.11
105	0.11
106	0.08
107	0.12
108	0.13
109	0.16
110	0.21
111	0.21
112	0.23
113	0.24
114	0.23
115	0.24
116	0.32
117	0.33
118	0.32
119	0.36
120	0.36
121	0.36
122	0.39
123	0.36
124	0.33
125	0.3
126	0.27
127	0.26
128	0.28
129	0.29
130	0.3
131	0.3
132	0.24
133	0.25
134	0.28
135	0.3
136	0.31
137	0.32
138	0.35
139	0.39
140	0.45
141	0.51
142	0.57
143	0.63
144	0.69
145	0.75
146	0.74
147	0.71
148	0.72
149	0.68
150	0.65
151	0.61
152	0.57
153	0.51
154	0.46
155	0.47
156	0.45
157	0.43
158	0.42
159	0.41
160	0.39
161	0.42
162	0.45
163	0.49
164	0.51
165	0.55
166	0.53
167	0.57
168	0.55
169	0.53
170	0.51
171	0.44
172	0.37
173	0.35
174	0.33
175	0.25
176	0.27
177	0.21
178	0.19
179	0.19
180	0.18
181	0.16
182	0.15
183	0.12
184	0.1
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.12
189	0.1
190	0.1
191	0.12
192	0.15
193	0.14
194	0.16
195	0.15
196	0.18
197	0.19
198	0.19
199	0.16
200	0.14
201	0.15
202	0.13
203	0.13
204	0.1
205	0.1
206	0.11
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.12
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.1
215	0.1
216	0.11
217	0.14
218	0.14
219	0.15
220	0.22
221	0.22
222	0.22
223	0.23
224	0.23
225	0.19
226	0.26
227	0.27
228	0.22
229	0.3
230	0.31
231	0.35
232	0.37
233	0.37
234	0.33
235	0.38
236	0.45
237	0.39
238	0.44
239	0.46
240	0.43
241	0.47
242	0.5
243	0.43
244	0.34
245	0.33
246	0.27
247	0.2
248	0.22
249	0.21
250	0.17
251	0.16
252	0.18
253	0.2
254	0.2
255	0.19
256	0.18
257	0.14
258	0.14
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.18
263	0.21
264	0.22
265	0.22
266	0.22
267	0.22
268	0.2
269	0.22
270	0.22
271	0.21
272	0.21
273	0.21
274	0.2
275	0.17
276	0.17
277	0.12
278	0.1
279	0.1
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.14
287	0.13
288	0.19
289	0.24
290	0.31
291	0.35
292	0.37
293	0.4
294	0.4
295	0.44
296	0.47
297	0.47
298	0.5
299	0.5
300	0.56
301	0.56
302	0.55
303	0.55
304	0.53
305	0.48
306	0.41
307	0.4
308	0.34
309	0.35
310	0.31
311	0.26
312	0.22
313	0.2
314	0.17
315	0.13
316	0.11
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.05
321	0.06
322	0.08
323	0.15
324	0.17
325	0.17
326	0.19
327	0.2
328	0.22
329	0.23
330	0.24
331	0.17
332	0.17
333	0.18
334	0.2
335	0.19
336	0.17
337	0.15
338	0.12
339	0.11
340	0.1
341	0.09
342	0.06
343	0.04
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.08
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.08
369	0.09
370	0.09
371	0.11
372	0.13
373	0.17
374	0.18
375	0.19
376	0.19
377	0.28
378	0.29
379	0.32
380	0.37
381	0.35
382	0.4
383	0.41
384	0.43
385	0.37
386	0.39
387	0.43
388	0.41
389	0.38
390	0.33
391	0.33
392	0.32
393	0.31
394	0.3
395	0.3
396	0.35
397	0.38
398	0.41
399	0.44
400	0.46
401	0.53
402	0.55
403	0.49
404	0.45
405	0.51
406	0.5
407	0.49
408	0.52
409	0.47
410	0.52
411	0.5
412	0.46
413	0.4
414	0.41
415	0.43
416	0.39
417	0.4
418	0.37
419	0.41
420	0.42
421	0.42
422	0.39
423	0.33
424	0.3
425	0.26
426	0.21
427	0.16
428	0.15
429	0.11
430	0.11
431	0.12
432	0.14
433	0.14
434	0.14
435	0.17
436	0.19
437	0.2
438	0.24
439	0.25
440	0.32
441	0.39
442	0.45
443	0.44
444	0.45
445	0.44
446	0.43
447	0.5
448	0.46
449	0.45
450	0.43
451	0.47
452	0.44
453	0.43
454	0.39
455	0.3
456	0.24
457	0.19
458	0.17
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.1
463	0.1
464	0.13
465	0.12
466	0.11
467	0.11
468	0.12
469	0.12
470	0.16
471	0.17
472	0.17
473	0.17
474	0.19
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.11
479	0.14
480	0.11
481	0.12
482	0.1
483	0.11
484	0.12
485	0.13
486	0.13
487	0.12
488	0.14
489	0.14
490	0.2
491	0.19
492	0.2
493	0.18
494	0.17
495	0.16
496	0.13
497	0.13
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.09
507	0.13
508	0.17
509	0.16
510	0.18
511	0.18
512	0.19
513	0.2
514	0.2
515	0.17
516	0.17
517	0.19
518	0.19
519	0.23
520	0.29
521	0.31
522	0.31
523	0.32
524	0.3
525	0.29
526	0.33
527	0.34
528	0.29
529	0.3
530	0.3
531	0.28
532	0.27
533	0.25
534	0.2
535	0.15
536	0.14
537	0.11
538	0.11
539	0.13
540	0.14
541	0.14
542	0.14
543	0.15
544	0.14
545	0.16
546	0.17
547	0.22
548	0.3
549	0.32
550	0.38
551	0.37
552	0.36
553	0.33
554	0.33
555	0.26
556	0.16
557	0.13
558	0.07
559	0.06
560	0.08
561	0.08
562	0.09
563	0.11
564	0.12
565	0.12
566	0.13
567	0.17
568	0.23
569	0.28
570	0.32
571	0.37
572	0.37
573	0.42
574	0.44
575	0.41
576	0.38
577	0.32
578	0.31
579	0.3
580	0.29
581	0.23
582	0.21
583	0.22
584	0.25
585	0.28
586	0.26
587	0.22
588	0.25
589	0.29
590	0.38
591	0.41
592	0.42
593	0.41
594	0.43
595	0.46
596	0.5
597	0.48
598	0.45
599	0.44
600	0.39
601	0.36
602	0.32
603	0.26
604	0.2
605	0.17
606	0.12
607	0.11
608	0.1
609	0.12
610	0.12
611	0.12
612	0.12
613	0.12
614	0.11
615	0.07
616	0.09
617	0.07
618	0.08
619	0.09
620	0.11
621	0.12
622	0.12
623	0.13
624	0.16
625	0.2
626	0.21
627	0.23
628	0.24
629	0.24
630	0.24
631	0.26
632	0.26
633	0.21
634	0.21
635	0.22
636	0.19
637	0.17
638	0.17
639	0.15
640	0.1
641	0.1
642	0.1
643	0.07
644	0.08
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.09
650	0.08
651	0.1
652	0.1
653	0.12
654	0.12
655	0.13
656	0.21
657	0.2
658	0.22
659	0.22
660	0.21
661	0.25
662	0.3
663	0.31
664	0.29
665	0.35
666	0.33
667	0.36
668	0.42
669	0.43
670	0.45
671	0.46
672	0.46
673	0.41
674	0.42
675	0.4
676	0.36
677	0.36
678	0.34
679	0.37
680	0.35
681	0.36
682	0.35
683	0.34
684	0.35
685	0.36
686	0.35
687	0.33
688	0.35
689	0.37
690	0.41
691	0.48
692	0.49
693	0.48
694	0.45
695	0.42
696	0.38
697	0.4
698	0.4
699	0.31
700	0.3
701	0.25
702	0.23
703	0.24
704	0.27
705	0.22
706	0.18
707	0.2
708	0.19
709	0.18
710	0.18
711	0.17
712	0.15
713	0.14
714	0.14
715	0.14
716	0.13
717	0.13
718	0.14
719	0.13
720	0.11
721	0.1
722	0.11
723	0.08
724	0.08
725	0.11
726	0.11
727	0.13
728	0.13
729	0.12
730	0.11
731	0.11
732	0.11
733	0.09
734	0.08
735	0.09
736	0.08
737	0.11
738	0.13
739	0.14
740	0.22
741	0.27
742	0.29
743	0.28
744	0.35
745	0.34
746	0.36
747	0.38
748	0.32
749	0.35
750	0.42
751	0.49
752	0.5
753	0.53
754	0.51
755	0.51
756	0.57
757	0.5
758	0.46
759	0.44
760	0.44
761	0.4
762	0.39
763	0.36
764	0.28
765	0.27
766	0.22
767	0.17
768	0.12
769	0.15
770	0.15
771	0.17
772	0.15
773	0.16
774	0.15
775	0.16
776	0.15
777	0.12
778	0.11
779	0.12
780	0.16
781	0.21
782	0.25
783	0.24
784	0.24
785	0.26
786	0.28
787	0.3
788	0.32
789	0.26
790	0.22
791	0.2
792	0.21
793	0.18
794	0.19
795	0.14
796	0.1
797	0.14
798	0.16
799	0.16
800	0.16
801	0.22
802	0.22
803	0.3
804	0.35
805	0.38
806	0.39
807	0.44
808	0.51
809	0.55
810	0.58
811	0.53
812	0.49
813	0.46
814	0.46
815	0.48
816	0.44
817	0.39
818	0.33
819	0.31
820	0.31
821	0.26
822	0.25
823	0.17
824	0.14
825	0.09
826	0.09
827	0.08
828	0.07
829	0.07
830	0.06
831	0.06
832	0.08
833	0.11
834	0.12
835	0.13
836	0.14
837	0.18
838	0.21
839	0.23
840	0.24
841	0.27
842	0.33
843	0.33
844	0.33
845	0.29
846	0.27
847	0.27
848	0.29
849	0.27
850	0.23
851	0.27
852	0.27
853	0.29
854	0.35
855	0.38
856	0.38
857	0.37
858	0.34
859	0.31
860	0.32
861	0.31
862	0.26
863	0.24
864	0.23
865	0.24
866	0.25
867	0.26
868	0.25
869	0.29
870	0.29
871	0.28
872	0.31
873	0.28
874	0.3
875	0.27
876	0.26
877	0.21
878	0.24
879	0.22
880	0.18
881	0.2
882	0.25
883	0.26
884	0.31
885	0.32
886	0.32
887	0.37
888	0.38
889	0.37
890	0.32
891	0.31
892	0.28
893	0.27
894	0.25
895	0.21
896	0.22
897	0.21
898	0.17
899	0.18
900	0.17
901	0.17
902	0.22
903	0.23
904	0.21
905	0.26
906	0.3
907	0.35
908	0.39
909	0.41
910	0.46
911	0.45
912	0.52
913	0.55
914	0.6
915	0.59
916	0.56
917	0.55

C9SBD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer