Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S8I0

Protein Details
Accession C9S8I0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-219SRDMHSKCVKHRKHYNSFNTPFLHydrophilic
243-266KKDFMCWRCHKSYKNQFQQLKAHLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-48KPKRAKTSPAER
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.5, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019808  Histidine_triad_CS  
IPR011146  HIT-like  
IPR036265  HIT-like_sf  
IPR032566  Znf-C2HE  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
KEGG val:VDBG_00048  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01230  HIT  
PF16278  zf-C2HE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00892  HIT_1  
Amino Acid Sequences MDKLQQASNEAMTRDELVSSASTKKQRNAFSELMAPKPKRAKTSPAERPRAPHLDRFRDNLGVYIENPASFPASQVIYYDDDFVAVHDLYPKATVHALLLPRSPQHSLLHPFEAFEDADFLASVRKAVRKLEALVAKELQRKLGHESKADARREAVLNGHVEVDGDELPPGRNWALEVRTGIHAQPSMNHLHIHVFSRDMHSKCVKHRKHYNSFNTPFLVDVADFPLAKDDPRRHPGHEGYLKKDFMCWRCHKSYKNQFQQLKAHLEVEFDEWKRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.18
3 0.14
4 0.12
5 0.13
6 0.14
7 0.17
8 0.22
9 0.29
10 0.34
11 0.4
12 0.46
13 0.52
14 0.55
15 0.58
16 0.55
17 0.5
18 0.54
19 0.51
20 0.5
21 0.51
22 0.47
23 0.46
24 0.52
25 0.53
26 0.51
27 0.53
28 0.56
29 0.56
30 0.66
31 0.7
32 0.72
33 0.77
34 0.71
35 0.71
36 0.69
37 0.7
38 0.62
39 0.6
40 0.59
41 0.61
42 0.62
43 0.62
44 0.57
45 0.52
46 0.49
47 0.43
48 0.36
49 0.27
50 0.24
51 0.23
52 0.21
53 0.16
54 0.16
55 0.14
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.08
83 0.12
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.2
94 0.25
95 0.26
96 0.29
97 0.27
98 0.26
99 0.24
100 0.24
101 0.18
102 0.12
103 0.1
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.09
113 0.1
114 0.12
115 0.14
116 0.15
117 0.17
118 0.22
119 0.25
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.25
124 0.27
125 0.26
126 0.23
127 0.2
128 0.2
129 0.24
130 0.29
131 0.28
132 0.25
133 0.28
134 0.32
135 0.39
136 0.39
137 0.33
138 0.28
139 0.28
140 0.28
141 0.26
142 0.19
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.11
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.16
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.16
179 0.17
180 0.18
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.21
185 0.28
186 0.26
187 0.3
188 0.34
189 0.37
190 0.45
191 0.55
192 0.55
193 0.58
194 0.67
195 0.72
196 0.76
197 0.83
198 0.83
199 0.83
200 0.81
201 0.75
202 0.66
203 0.56
204 0.46
205 0.36
206 0.27
207 0.16
208 0.13
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.14
214 0.13
215 0.14
216 0.21
217 0.25
218 0.32
219 0.4
220 0.44
221 0.44
222 0.52
223 0.55
224 0.58
225 0.61
226 0.58
227 0.57
228 0.6
229 0.58
230 0.5
231 0.51
232 0.48
233 0.44
234 0.48
235 0.5
236 0.51
237 0.59
238 0.67
239 0.68
240 0.72
241 0.78
242 0.79
243 0.82
244 0.84
245 0.81
246 0.8
247 0.82
248 0.78
249 0.74
250 0.65
251 0.56
252 0.47
253 0.42
254 0.36
255 0.32
256 0.33