Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S7D5

Protein Details
Accession C9S7D5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-261GTPDRGRARRVPGRRFRKNHIMQDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-254GTPDRGRARRVPGRRFRK
Subcellular Location(s) plas 22, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG val:VDBG_01340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MSDAHNETIRRPFDECNEISIYCPVEATVLGYYPNFGANIFFAVAFGIVTIVSGYIGIKKRTWAYMAAVTGGALLETAGIVFSFPIYVSPQNAPGALTTKQQATPGRVLLNDNPWNSDAFQLQICAIILAPTMLCVAIYLTLKHVALALSPPLSRIRPRLYPWIFLPADLSCLVLQAIGGGISAAAGRTNATLLSHGNRMIISGVALQVVVLLFFGIMGVDYWVRVRPLGARRADAGTPDRGRARRVPGRRFRKNHIMQDEISFMILDATLVLVAVSLLTAFHPGIFFPQMAGSRRAKGGAASPEQGVVTESKSVATSSKEGSKTEESGRESA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.39
4 0.39
5 0.37
6 0.36
7 0.34
8 0.3
9 0.21
10 0.2
11 0.15
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.1
16 0.09
17 0.1
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.09
23 0.08
24 0.09
25 0.08
26 0.1
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.04
35 0.03
36 0.04
37 0.04
38 0.03
39 0.03
40 0.04
41 0.04
42 0.1
43 0.15
44 0.17
45 0.18
46 0.22
47 0.25
48 0.27
49 0.29
50 0.25
51 0.25
52 0.28
53 0.28
54 0.25
55 0.22
56 0.2
57 0.18
58 0.15
59 0.1
60 0.05
61 0.04
62 0.03
63 0.03
64 0.03
65 0.02
66 0.02
67 0.03
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.05
73 0.07
74 0.09
75 0.12
76 0.13
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.16
81 0.14
82 0.16
83 0.15
84 0.15
85 0.14
86 0.16
87 0.17
88 0.21
89 0.24
90 0.24
91 0.26
92 0.27
93 0.27
94 0.25
95 0.27
96 0.25
97 0.3
98 0.31
99 0.28
100 0.27
101 0.26
102 0.27
103 0.24
104 0.23
105 0.15
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.03
119 0.04
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.17
143 0.2
144 0.23
145 0.26
146 0.36
147 0.36
148 0.37
149 0.36
150 0.4
151 0.35
152 0.31
153 0.29
154 0.18
155 0.18
156 0.16
157 0.16
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.03
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.02
173 0.02
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.08
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.02
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.13
215 0.2
216 0.27
217 0.29
218 0.29
219 0.31
220 0.34
221 0.34
222 0.3
223 0.27
224 0.28
225 0.27
226 0.29
227 0.33
228 0.31
229 0.35
230 0.37
231 0.43
232 0.44
233 0.52
234 0.6
235 0.64
236 0.74
237 0.8
238 0.81
239 0.8
240 0.82
241 0.82
242 0.81
243 0.77
244 0.71
245 0.62
246 0.59
247 0.53
248 0.42
249 0.33
250 0.23
251 0.16
252 0.11
253 0.1
254 0.06
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.02
264 0.02
265 0.03
266 0.03
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.09
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.14
277 0.18
278 0.22
279 0.27
280 0.27
281 0.29
282 0.31
283 0.31
284 0.28
285 0.25
286 0.29
287 0.31
288 0.32
289 0.31
290 0.3
291 0.3
292 0.29
293 0.28
294 0.22
295 0.15
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.19
305 0.21
306 0.29
307 0.3
308 0.31
309 0.36
310 0.39
311 0.39
312 0.43
313 0.46