Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPN1

Protein Details
Accession C9SPN1    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-41SSSSSSKPSRPPPPPPPSRLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-45KPSRPPPPPPPSRLGKRSR
291-328GAKKRDGRPPKLADYRREEERKTAERRDRREGGYRERD
353-370RGSHRERDRERDSGRHRS
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 11, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG val:VDBG_06856  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
Amino Acid Sequences MPDHKPPSAPRIAISFGKNSSSSSSSKPSRPPPPPPPSRLGKRSRAPALGNDSDSDSDDGRAHRHEAIYELGGDSDADRSFRKKPRDLVITKQSNRDWKAELRAKRGGKNLLPAEAQAAQAGAGKDTEPADAQKDIKWGLTVTKPRQQQAEDEEEGARTGDAGRGDSRERRRSASPAAEAVKPQTADEAALDALLGKKRASEERTIRPSEDSAYKDDVAQHVGADATMEDYDAIPDGEFGAALLRGMGWDGKMRGPKPSKAAAGERRQNQLGLGAKKLQDAEDLGQWNHGGAKKRDGRPPKLADYRREEERKTAERRDRREGGYRERDRYEDAARDRERDRDQGRDRDFDRDRGSHRERDRERDSGRHRSGESRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.33
4 0.36
5 0.34
6 0.31
7 0.31
8 0.3
9 0.29
10 0.29
11 0.37
12 0.39
13 0.46
14 0.52
15 0.57
16 0.63
17 0.69
18 0.74
19 0.75
20 0.8
21 0.82
22 0.81
23 0.79
24 0.78
25 0.8
26 0.79
27 0.78
28 0.77
29 0.75
30 0.78
31 0.77
32 0.73
33 0.66
34 0.64
35 0.63
36 0.58
37 0.51
38 0.43
39 0.39
40 0.33
41 0.32
42 0.27
43 0.19
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.21
55 0.2
56 0.18
57 0.16
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.11
66 0.14
67 0.22
68 0.3
69 0.38
70 0.43
71 0.5
72 0.58
73 0.67
74 0.68
75 0.68
76 0.71
77 0.73
78 0.7
79 0.69
80 0.64
81 0.62
82 0.61
83 0.55
84 0.48
85 0.42
86 0.5
87 0.51
88 0.53
89 0.51
90 0.56
91 0.57
92 0.58
93 0.6
94 0.56
95 0.51
96 0.53
97 0.48
98 0.43
99 0.39
100 0.34
101 0.3
102 0.25
103 0.22
104 0.14
105 0.12
106 0.09
107 0.11
108 0.11
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.08
116 0.09
117 0.11
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.14
127 0.19
128 0.26
129 0.28
130 0.34
131 0.37
132 0.39
133 0.42
134 0.4
135 0.37
136 0.35
137 0.37
138 0.32
139 0.3
140 0.28
141 0.24
142 0.23
143 0.19
144 0.13
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.13
153 0.19
154 0.27
155 0.32
156 0.34
157 0.36
158 0.38
159 0.4
160 0.44
161 0.42
162 0.36
163 0.33
164 0.34
165 0.31
166 0.29
167 0.26
168 0.22
169 0.17
170 0.15
171 0.11
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.09
186 0.14
187 0.16
188 0.23
189 0.29
190 0.37
191 0.43
192 0.44
193 0.43
194 0.4
195 0.38
196 0.33
197 0.31
198 0.24
199 0.21
200 0.23
201 0.22
202 0.21
203 0.22
204 0.2
205 0.17
206 0.15
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.06
237 0.08
238 0.12
239 0.17
240 0.18
241 0.27
242 0.31
243 0.35
244 0.37
245 0.41
246 0.41
247 0.4
248 0.49
249 0.49
250 0.54
251 0.57
252 0.57
253 0.56
254 0.54
255 0.5
256 0.41
257 0.38
258 0.35
259 0.3
260 0.28
261 0.27
262 0.27
263 0.29
264 0.29
265 0.24
266 0.18
267 0.18
268 0.17
269 0.18
270 0.2
271 0.18
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.18
276 0.2
277 0.22
278 0.22
279 0.32
280 0.4
281 0.46
282 0.55
283 0.61
284 0.65
285 0.67
286 0.72
287 0.72
288 0.73
289 0.74
290 0.73
291 0.72
292 0.7
293 0.7
294 0.69
295 0.61
296 0.58
297 0.6
298 0.61
299 0.6
300 0.65
301 0.65
302 0.69
303 0.74
304 0.76
305 0.74
306 0.71
307 0.73
308 0.71
309 0.71
310 0.73
311 0.73
312 0.7
313 0.66
314 0.63
315 0.57
316 0.55
317 0.5
318 0.47
319 0.44
320 0.48
321 0.48
322 0.5
323 0.48
324 0.51
325 0.5
326 0.51
327 0.5
328 0.51
329 0.57
330 0.62
331 0.65
332 0.65
333 0.63
334 0.63
335 0.63
336 0.6
337 0.59
338 0.55
339 0.55
340 0.57
341 0.61
342 0.6
343 0.64
344 0.67
345 0.67
346 0.7
347 0.71
348 0.71
349 0.7
350 0.71
351 0.72
352 0.72
353 0.72
354 0.69
355 0.65
356 0.66