FuNGI

C9SMM3

Protein Details

Accession

C9SMM3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
96-122	VERLLEPPRKPKERKRKRDEDDLEGKY	Basic
427-449	GDKATDKKSTKYKQKATNEELSM	Hydrophilic
510-536	PSDVRIGKKKGRVNKGRVEKKGRGAVR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
32-48	PHPRAKYAEAPPPRPKK
103-113	PRKPKERKRKR
467-473	KKKKQGR
513-549	VRIGKKKGRVNKGRVEKKGRGAVRAAAWRKEGGKTSK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 7, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	val:VDBG_06147 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MSKKTSKLTASSKAVDPTLDALFSSSAGPAKPHPRAKYAEAPPPRPKKAAEESDEEEEAGDDDDDEDMVDADADLSELSGDAEGEASEEEDVEEAVERLLEPPRKPKERKRKRDEDDLEGKYLNKLALEEEKEEAQLKRQKNKSEAPKAEQADDTTSDDDVEKEVLPVHESLVAKDKNDANTKDTDVEKASRTVFLANVAAEASTTKAAKKTLMTHLSTVLEKGEKIESIRFRSLAFSAGSMPKRAAYITHSLMEATTKSANAYVVYSTPAAARKACTTLNGSVVLDRHIRVDSVAHPAPTDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNTDASGETKERKRNKVPSDIEEGLWRVFGKEDGKVESVRVIRDPKTRVGKGFAYVQFHDANDVEAALLLNEKKFPPMLPRTLRVTRAKAPHKTALAQERSRAKTAGDKATDKKSTKYKQKATNEELSMAGRASKLLGRSGALYDHKKKKQGRGGSGDGKEQASGSGLVLKTPEEIIFEGKRASANDGRPSDVRIGKKKGRVNKGRVEKKGRGAVRAAAWRKEGGKTSKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.42
3	0.36
4	0.3
5	0.24
6	0.2
7	0.16
8	0.14
9	0.13
10	0.13
11	0.13
12	0.11
13	0.11
14	0.12
15	0.14
16	0.19
17	0.28
18	0.36
19	0.44
20	0.47
21	0.52
22	0.57
23	0.62
24	0.66
25	0.64
26	0.65
27	0.65
28	0.69
29	0.73
30	0.77
31	0.75
32	0.68
33	0.64
34	0.63
35	0.64
36	0.65
37	0.6
38	0.57
39	0.57
40	0.58
41	0.56
42	0.47
43	0.37
44	0.27
45	0.22
46	0.16
47	0.11
48	0.06
49	0.06
50	0.07
51	0.06
52	0.06
53	0.06
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.04
61	0.04
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.05
78	0.05
79	0.05
80	0.05
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.07
86	0.14
87	0.19
88	0.21
89	0.31
90	0.4
91	0.5
92	0.59
93	0.68
94	0.73
95	0.79
96	0.88
97	0.89
98	0.9
99	0.87
100	0.9
101	0.85
102	0.83
103	0.82
104	0.74
105	0.65
106	0.55
107	0.49
108	0.38
109	0.34
110	0.25
111	0.15
112	0.12
113	0.12
114	0.18
115	0.2
116	0.21
117	0.21
118	0.21
119	0.22
120	0.24
121	0.22
122	0.24
123	0.28
124	0.33
125	0.41
126	0.47
127	0.53
128	0.57
129	0.66
130	0.68
131	0.72
132	0.72
133	0.68
134	0.7
135	0.65
136	0.61
137	0.53
138	0.43
139	0.35
140	0.31
141	0.27
142	0.2
143	0.18
144	0.16
145	0.15
146	0.14
147	0.11
148	0.1
149	0.08
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.13
157	0.13
158	0.14
159	0.21
160	0.21
161	0.2
162	0.25
163	0.27
164	0.28
165	0.35
166	0.36
167	0.3
168	0.32
169	0.34
170	0.33
171	0.3
172	0.27
173	0.22
174	0.23
175	0.22
176	0.22
177	0.21
178	0.18
179	0.18
180	0.17
181	0.14
182	0.13
183	0.13
184	0.1
185	0.09
186	0.08
187	0.08
188	0.07
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.09
195	0.1
196	0.12
197	0.15
198	0.19
199	0.26
200	0.31
201	0.32
202	0.31
203	0.33
204	0.33
205	0.3
206	0.25
207	0.18
208	0.13
209	0.11
210	0.12
211	0.1
212	0.09
213	0.1
214	0.15
215	0.18
216	0.23
217	0.24
218	0.23
219	0.23
220	0.24
221	0.23
222	0.2
223	0.16
224	0.12
225	0.13
226	0.18
227	0.18
228	0.17
229	0.17
230	0.15
231	0.15
232	0.14
233	0.12
234	0.11
235	0.15
236	0.16
237	0.17
238	0.16
239	0.16
240	0.16
241	0.16
242	0.12
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.1
258	0.1
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.13
263	0.13
264	0.14
265	0.15
266	0.15
267	0.17
268	0.16
269	0.15
270	0.14
271	0.14
272	0.14
273	0.12
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.15
282	0.16
283	0.15
284	0.14
285	0.15
286	0.19
287	0.25
288	0.27
289	0.23
290	0.24
291	0.26
292	0.27
293	0.29
294	0.25
295	0.23
296	0.2
297	0.19
298	0.17
299	0.15
300	0.14
301	0.12
302	0.11
303	0.07
304	0.06
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.12
316	0.18
317	0.27
318	0.33
319	0.41
320	0.49
321	0.57
322	0.62
323	0.67
324	0.66
325	0.63
326	0.64
327	0.58
328	0.5
329	0.42
330	0.37
331	0.26
332	0.22
333	0.18
334	0.1
335	0.08
336	0.11
337	0.1
338	0.12
339	0.14
340	0.16
341	0.18
342	0.18
343	0.18
344	0.2
345	0.2
346	0.18
347	0.2
348	0.22
349	0.24
350	0.31
351	0.33
352	0.36
353	0.43
354	0.45
355	0.43
356	0.44
357	0.41
358	0.37
359	0.42
360	0.38
361	0.34
362	0.32
363	0.33
364	0.29
365	0.27
366	0.27
367	0.19
368	0.16
369	0.12
370	0.11
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.08
379	0.09
380	0.1
381	0.1
382	0.12
383	0.19
384	0.25
385	0.33
386	0.37
387	0.41
388	0.47
389	0.51
390	0.57
391	0.55
392	0.55
393	0.53
394	0.57
395	0.62
396	0.61
397	0.63
398	0.62
399	0.59
400	0.56
401	0.55
402	0.55
403	0.55
404	0.5
405	0.5
406	0.52
407	0.53
408	0.52
409	0.46
410	0.38
411	0.38
412	0.43
413	0.45
414	0.41
415	0.43
416	0.45
417	0.53
418	0.6
419	0.53
420	0.53
421	0.54
422	0.59
423	0.64
424	0.7
425	0.71
426	0.74
427	0.82
428	0.86
429	0.83
430	0.82
431	0.73
432	0.64
433	0.56
434	0.47
435	0.37
436	0.28
437	0.22
438	0.13
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.14
444	0.15
445	0.14
446	0.16
447	0.17
448	0.21
449	0.25
450	0.31
451	0.39
452	0.48
453	0.52
454	0.6
455	0.65
456	0.7
457	0.74
458	0.76
459	0.76
460	0.74
461	0.77
462	0.78
463	0.73
464	0.67
465	0.6
466	0.5
467	0.41
468	0.33
469	0.24
470	0.17
471	0.15
472	0.11
473	0.14
474	0.14
475	0.14
476	0.14
477	0.14
478	0.14
479	0.15
480	0.15
481	0.11
482	0.12
483	0.17
484	0.18
485	0.19
486	0.19
487	0.18
488	0.2
489	0.2
490	0.25
491	0.27
492	0.31
493	0.39
494	0.4
495	0.43
496	0.42
497	0.44
498	0.45
499	0.45
500	0.47
501	0.47
502	0.54
503	0.58
504	0.66
505	0.7
506	0.72
507	0.77
508	0.79
509	0.79
510	0.81
511	0.84
512	0.86
513	0.88
514	0.87
515	0.84
516	0.82
517	0.83
518	0.76
519	0.7
520	0.63
521	0.59
522	0.57
523	0.6
524	0.56
525	0.51
526	0.5
527	0.49
528	0.48
529	0.48
530	0.49

C9SMM3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer